EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000040026 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: APOBEC4
Alias: C1orf169|FLJ25691|MGC26594|RP1-127C7.4
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1110 bases
Position: chrNTIC01013335.1:11356235-11357344
Accession: 32152
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000055173	APOBEC_N	PF08210.11	2.3e-30	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000083686	APOBEC4-201	1110	-	ENSCJAP00000055173	369 (aa)	-	A0A2R8M7S7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	89.694	ENSG00000173627	APOBEC4	98	89.694	Homo_sapiens
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	81.337	ENSAMEG00000002503	APOBEC4	94	81.337	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	95	52.113	ENSACAG00000015192	APOBEC4	98	52.113	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	96	78.249	ENSBTAG00000047395	APOBEC4	98	78.552	Bos_taurus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	79.944	ENSCAFG00000013349	APOBEC4	98	79.944	Canis_familiaris
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	79.944	ENSCAFG00020015526	APOBEC4	98	79.944	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	96	77.401	ENSCHIG00000011987	APOBEC4	93	77.159	Capra_hircus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	85.237	ENSCSAG00000000243	APOBEC4	98	85.237	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	79.944	ENSCHOG00000012387	APOBEC4	98	79.944	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	99	54.496	ENSCPBG00000015714	APOBEC4	95	54.875	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	90	63.772	ENSCGRG00001004553	Apobec4	93	63.772	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	96	82.768	ENSDNOG00000044664	APOBEC4	98	82.451	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	65.738	ENSDORG00000007335	Apobec4	99	65.738	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	82.730	ENSEASG00005006513	APOBEC4	97	82.730	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	82.730	ENSECAG00000019734	APOBEC4	97	82.730	Equus_caballus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	81.058	ENSFCAG00000010909	APOBEC4	98	81.058	Felis_catus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	85	76.603	ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	76.603	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	89	48.358	ENSGALG00000053078	APOBEC4	95	48.071	Gallus_gallus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	89.415	ENSGGOG00000042217	APOBEC4	98	89.415	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	99	50.000	ENSLACG00000014504	APOBEC4	97	50.549	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	86.630	ENSMMUG00000031303	APOBEC4	98	86.630	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	88	48.780	ENSMGAG00000017190	APOBEC4	95	48.780	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	100	61.892	MGP_CAROLIEiJ_G0014701	Apobec4	94	62.222	Mus_caroli
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	100	61.081	ENSMUSG00000055547	Apobec4	94	61.389	Mus_musculus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	99	61.308	MGP_PahariEiJ_G0027937	Apobec4	94	61.944	Mus_pahari
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	100	60.270	MGP_SPRETEiJ_G0015508	Apobec4	94	60.556	Mus_spretus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	96	78.249	ENSMPUG00000011756	APOBEC4	95	78.552	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	96	77.684	ENSMLUG00000002458	APOBEC4	98	77.159	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	58.774	ENSNGAG00000017599	Apobec4	97	58.611	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	89.972	ENSNLEG00000035610	APOBEC4	98	89.972	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	89	72.477	ENSODEG00000009778	APOBEC4	98	69.795	Octodon_degus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	95	57.143	ENSOANG00000001000	APOBEC4	98	56.546	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	79.387	ENSOGAG00000003118	APOBEC4	98	79.387	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	96	77.966	ENSOARG00000005287	APOBEC4	98	77.716	Ovis_aries
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	86.351	ENSPPAG00000038272	APOBEC4	98	86.351	Pan_paniscus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	81.337	ENSPPRG00000014706	APOBEC4	98	81.337	Panthera_pardus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	81.337	ENSPTIG00000005518	APOBEC4	98	81.337	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	88.858	ENSPTRG00000047181	APOBEC4	98	88.858	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	96	66.479	ENSPEMG00000019164	Apobec4	98	66.667	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	93	30.541	ENSPMAG00000006156	APOBEC4	97	30.362	Petromyzon_marinus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	64.804	ENSPCIG00000003817	APOBEC4	95	64.624	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	88.301	ENSPPYG00000000424	APOBEC4	98	88.301	Pongo_abelii
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	59.889	ENSPCAG00000015174	APOBEC4	98	59.722	Procavia_capensis
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	81.058	ENSPVAG00000001100	APOBEC4	98	81.058	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	99	59.730	ENSRNOG00000028089	Apobec4	91	60.388	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	96	64.407	ENSSHAG00000013804	APOBEC4	98	63.889	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	99	53.699	ENSSPUG00000010884	APOBEC4	95	54.190	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	99	79.235	ENSSSCG00000015561	APOBEC4	98	79.387	Sus_scrofa
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	78.273	ENSTBEG00000006476	APOBEC4	98	78.273	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	82.402	ENSTTRG00000014784	APOBEC4	98	82.173	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	95	81.818	ENSUAMG00000005088	APOBEC4	98	81.894	Ursus_americanus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	95	81.534	ENSUMAG00000016285	APOBEC4	98	81.616	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	97	79.666	ENSVVUG00000009054	APOBEC4	98	79.666	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000040026	APOBEC4	99	43.883	ENSXETG00000017441	apobec4	94	43.869	Xenopus_tropicalis