EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000040413 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: FDXACB1
Alias: LOC91893|hCG_2033039
Full Name: ferredoxin-fold anticodon binding domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3850 bases
Position: chrNTIC01001113.1:9390421-9394270
Accession: 25110
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000048644	FDX-ACB	PF03147.14	4.2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000061385	FDXACB1-201	1875	-	ENSCJAP00000048644	624 (aa)	-	U3EJY1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	92.308	ENSG00000255561	FDXACB1	100	92.308	Homo_sapiens
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.224	ENSAPOG00000009726	fdxacb1	100	35.224	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.224	ENSAPOG00000009041	FDXACB1	100	35.224	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	36.997	ENSACIG00000004208	fdxacb1	100	36.687	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.417	ENSAOCG00000007455	fdxacb1	100	35.417	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.268	ENSAPEG00000023857	fdxacb1	100	35.714	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.983	ENSATEG00000020757	fdxacb1	100	35.879	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	47.049	ENSAPLG00000004681	FDXACB1	99	47.049	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	96.314	ENSANAG00000022744	FDXACB1	100	96.314	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.672	ENSACLG00000020497	fdxacb1	100	35.672	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.672	ENSACLG00000027415	-	100	35.672	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	42.047	ENSAMXG00000038372	fdxacb1	99	42.047	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	81.571	ENSBTAG00000004949	FDXACB1	100	81.571	Bos_taurus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	82.051	ENSCAFG00020006314	FDXACB1	100	82.051	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	81.731	ENSCHIG00000017261	FDXACB1	100	81.731	Capra_hircus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	84.615	ENSTSYG00000029218	FDXACB1	100	84.615	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	71	69.516	ENSCAPG00000010478	-	100	69.516	Cavia_aperea
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	76.442	ENSCPOG00000032584	FDXACB1	100	76.442	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	95.994	ENSCCAG00000024232	FDXACB1	100	95.994	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	93.910	ENSCATG00000035600	FDXACB1	100	93.910	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	77.885	ENSCLAG00000015613	FDXACB1	100	77.885	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	93.910	ENSCSAG00000002878	FDXACB1	100	93.910	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	79.393	ENSCHOG00000003037	FDXACB1	99	79.393	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	52.351	ENSCPBG00000009087	FDXACB1	100	52.351	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	93.429	ENSCANG00000043844	FDXACB1	100	93.429	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	73.878	ENSCGRG00001023825	Fdxacb1	98	73.878	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	73.878	ENSCGRG00000001752	Fdxacb1	98	73.878	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	36.883	ENSCSEG00000006964	fdxacb1	99	36.883	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	36.622	ENSCVAG00000013005	fdxacb1	100	36.622	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	42.063	ENSDARG00000095750	fdxacb1	99	42.063	Danio_rerio
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	78.788	ENSDNOG00000037748	FDXACB1	100	78.788	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	76.837	ENSDORG00000028060	Fdxacb1	100	76.837	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	76.480	ENSETEG00000004898	FDXACB1	99	76.480	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	84.936	ENSEASG00005007198	FDXACB1	100	84.936	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	84.776	ENSECAG00000009561	FDXACB1	100	84.776	Equus_caballus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	84	83.486	ENSEEUG00000009839	FDXACB1	83	83.486	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	33.481	ENSELUG00000011250	fdxacb1	99	33.628	Esox_lucius
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	81.571	ENSFCAG00000024559	FDXACB1	100	81.571	Felis_catus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	47.105	ENSFALG00000006177	FDXACB1	100	47.105	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	77.885	ENSFDAG00000016115	FDXACB1	100	78.686	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.277	ENSFHEG00000016602	fdxacb1	100	35.277	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	48.830	ENSGALG00000007967	FDXACB1	100	48.830	Gallus_gallus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	36.161	ENSGAFG00000001162	fdxacb1	95	36.161	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	37.402	ENSGACG00000020639	fdxacb1	99	37.402	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	51.811	ENSGAGG00000020645	FDXACB1	98	52.840	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	92.788	ENSGGOG00000037643	FDXACB1	100	92.788	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.672	ENSHBUG00000003489	fdxacb1	100	35.672	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	79.808	ENSHGLG00000004171	FDXACB1	100	79.808	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	79.808	ENSHGLG00100017458	FDXACB1	100	79.808	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	36.223	ENSHCOG00000018986	fdxacb1	99	36.223	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	39.680	ENSIPUG00000022559	FDXACB1	99	39.520	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	77.885	ENSJJAG00000010367	Fdxacb1	100	77.885	Jaculus_jaculus
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ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.398	ENSLBEG00000016100	fdxacb1	100	35.398	Labrus_bergylta
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ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	93.590	ENSMNEG00000041539	FDXACB1	100	93.590	Macaca_nemestrina
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ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	35.672	ENSMZEG00005018799	fdxacb1	100	35.672	Maylandia_zebra
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ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	83.974	ENSMICG00000045510	FDXACB1	100	83.974	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	73.397	ENSMOCG00000011835	Fdxacb1	100	73.397	Microtus_ochrogaster
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ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	71.474	ENSMUSG00000037845	Fdxacb1	100	71.474	Mus_musculus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	72.115	MGP_PahariEiJ_G0015065	Fdxacb1	100	72.115	Mus_pahari
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	71.474	MGP_SPRETEiJ_G0033336	Fdxacb1	100	71.474	Mus_spretus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	81.571	ENSMPUG00000003585	FDXACB1	100	81.571	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	80.800	ENSMLUG00000014872	FDXACB1	100	80.800	Myotis_lucifugus
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ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	36.926	ENSNBRG00000006939	fdxacb1	100	36.926	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	93.109	ENSNLEG00000030387	FDXACB1	100	93.109	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	64.800	ENSMEUG00000003077	FDXACB1	99	64.800	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	73.120	ENSOPRG00000012593	FDXACB1	99	73.120	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	78.045	ENSODEG00000010360	FDXACB1	100	78.045	Octodon_degus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	37.242	ENSONIG00000004939	fdxacb1	100	37.242	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	51.597	ENSOANG00000003844	-	99	51.597	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	66	41.358	ENSORLG00020008420	fdxacb1	99	34.033	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	35.474	ENSOMEG00000019353	fdxacb1	99	35.474	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	81.250	ENSOARG00000015064	FDXACB1	99	81.250	Ovis_aries
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	92.308	ENSPPAG00000030196	FDXACB1	100	92.308	Pan_paniscus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	81.410	ENSPPRG00000005967	FDXACB1	100	81.410	Panthera_pardus
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	81.250	ENSPTIG00000016420	FDXACB1	100	81.250	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	92.308	ENSPTRG00000004272	FDXACB1	100	92.308	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	93.429	ENSPANG00000019268	FDXACB1	100	93.429	Papio_anubis
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	99	39.968	ENSPKIG00000009407	fdxacb1	99	39.683	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	33.283	ENSPMGG00000004912	fdxacb1	100	33.891	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	36.513	ENSPMEG00000002110	fdxacb1	100	36.513	Poecilia_mexicana
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ENSCJAG00000040413	FDXACB1	90	70.796	ENSRNOG00000010743	Fdxacb1	97	70.796	Rattus_norvegicus
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ENSCJAG00000040413	FDXACB1	100	93.590	ENSRROG00000045453	FDXACB1	100	93.590	Rhinopithecus_roxellana
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