EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000041007 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBDS
Alias: CGI-97|FLJ10917|SDS|SWDS
Full Name: SBDS%2C ribosome maturation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10717 bases
Position: chrNTIC01011112.1:197678218-197688934
Accession: 100387555
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000066297	SBDS	PF01172.18	7.9e-33	1	1
ENSCJAP00000066297	SBDS_C	PF09377.10	7.9e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000075633	SBDS-201	5118	-	ENSCJAP00000066297	250 (aa)	XP_002743950	F6QRM2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.800	ENSG00000126524	SBDS	100	98.800	Homo_sapiens
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.133	ENSAPOG00000014285	sbds	100	83.133	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	97.600	ENSAMEG00000018167	SBDS	100	97.600	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	82.540	ENSACIG00000007308	sbds	100	82.540	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.133	ENSAOCG00000016770	sbds	100	83.133	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.534	ENSAPEG00000015897	sbds	100	83.534	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.534	ENSATEG00000006901	sbds	100	83.534	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000041007	SBDS	83	99.034	ENSANAG00000037501	-	100	99.034	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000041007	SBDS	92	92.641	ENSANAG00000024342	-	97	92.641	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.936	ENSACLG00000018750	sbds	100	83.936	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	84.400	ENSAMXG00000005361	sbds	100	84.400	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	99.200	ENSBTAG00000004051	SBDS	100	99.200	Bos_taurus
ENSCJAG00000041007	SBDS	98	57.317	WBGene00021063	sbds-1	97	57.317	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	95.635	ENSCAFG00000010797	SBDS	100	95.635	Canis_familiaris
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.000	ENSCAFG00020005357	SBDS	100	98.000	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.400	ENSCHIG00000026854	SBDS	100	98.400	Capra_hircus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.800	ENSTSYG00000033822	SBDS	100	98.800	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000041007	SBDS	66	97.561	ENSCAPG00000006634	SBDS	100	97.561	Cavia_aperea
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.000	ENSCPOG00000036143	SBDS	100	98.000	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.400	ENSCCAG00000020671	SBDS	100	98.400	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.800	ENSCATG00000039026	SBDS	100	98.800	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	70.565	ENSCLAG00000002113	-	99	70.565	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	97.600	ENSCLAG00000005721	-	100	97.600	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.800	ENSCSAG00000018275	SBDS	100	98.800	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	93.200	ENSCHOG00000003795	SBDS	100	93.200	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	89.600	ENSCPBG00000014893	SBDS	100	89.600	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	66.400	ENSCSAVG00000011811	-	100	66.400	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.400	ENSCANG00000032368	SBDS	100	98.400	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000041007	SBDS	66	95.122	ENSCGRG00001019886	Sbds	100	95.122	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000041007	SBDS	83	95.652	ENSCGRG00000009211	Sbds	100	95.652	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	81.526	ENSCSEG00000005798	sbds	100	81.526	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	81.526	ENSCVAG00000001053	sbds	100	81.526	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	84.000	ENSDARG00000027803	sbds	100	84.000	Danio_rerio
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	97.600	ENSDNOG00000041174	SBDS	100	97.600	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	95.600	ENSDORG00000026218	Sbds	100	95.600	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000041007	SBDS	90	58.333	FBgn0035714	CG8549	99	58.635	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000041007	SBDS	93	58.369	ENSEBUG00000015780	sbds	92	64.251	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.400	ENSEASG00005008821	SBDS	100	98.400	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.400	ENSECAG00000008202	SBDS	100	98.400	Equus_caballus
ENSCJAG00000041007	SBDS	83	76.442	ENSEEUG00000004768	SBDS	100	76.442	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	82.400	ENSELUG00000008382	sbds	100	82.400	Esox_lucius
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.000	ENSFCAG00000022142	SBDS	100	98.000	Felis_catus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	89.200	ENSFALG00000013808	SBDS	100	89.200	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	98.000	ENSFDAG00000018947	-	100	98.000	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	78.313	ENSFHEG00000000708	sbds	100	78.313	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	83.200	ENSGMOG00000018356	sbds	99	83.200	Gadus_morhua
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	89.200	ENSGALG00000027989	SBDS	100	89.200	Gallus_gallus
ENSCJAG00000041007	SBDS	92	78.261	ENSGAFG00000014204	sbds	100	78.261	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	82.329	ENSGACG00000012697	sbds	100	82.329	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000041007	SBDS	86	89.720	ENSGAGG00000022402	SBDS	100	89.720	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000041007	SBDS	96	78.838	ENSGGOG00000040023	-	92	78.838	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.936	ENSHBUG00000002660	sbds	100	83.936	Haplochromis_burtoni
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ENSCJAG00000041007	SBDS	100	96.400	ENSHGLG00100011332	SBDS	100	96.400	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	81.124	ENSHCOG00000018606	sbds	100	81.124	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	85.200	ENSIPUG00000006536	sbds	100	85.200	Ictalurus_punctatus
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ENSCJAG00000041007	SBDS	100	69.960	ENSJJAG00000003934	-	100	69.960	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.936	ENSKMAG00000018542	sbds	100	83.936	Kryptolebias_marmoratus
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ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.133	ENSMALG00000010219	sbds	100	83.133	Monopterus_albus
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ENSCJAG00000041007	SBDS	100	96.800	MGP_PahariEiJ_G0024384	Sbds	100	97.674	Mus_pahari
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	96.800	MGP_SPRETEiJ_G0028798	Sbds	100	97.674	Mus_spretus
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ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.936	ENSNBRG00000017027	sbds	100	83.936	Neolamprologus_brichardi
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ENSCJAG00000041007	SBDS	99	72.289	ENSODEG00000000137	-	84	75.904	Octodon_degus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	88.000	ENSODEG00000019253	-	84	88.000	Octodon_degus
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	77.108	ENSODEG00000001116	-	99	77.108	Octodon_degus
ENSCJAG00000041007	SBDS	99	83.133	ENSONIG00000005874	sbds	100	83.133	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000041007	SBDS	83	91.304	ENSOANG00000007674	-	100	91.304	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000041007	SBDS	100	97.200	ENSOCUG00000003170	SBDS	100	97.200	Oryctolagus_cuniculus
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