EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000042808 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 471 bases
Position: chrNTIC01000001.1:119045182-119045652
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000065090	Ribosomal_L23	PF00276.20	7.2e-16	1	1
ENSCJAP00000065090	Ribosomal_L23eN	PF03939.13	3.6e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000071610	-	471	-	ENSCJAP00000065090	156 (aa)	-	A0A2R8MUA9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000042808	-	100	97.436	ENSCJAG00000013126	-	100	97.436
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ENSCJAG00000042808	-	83	95.349	ENSCJAG00000046769	-	84	95.349
ENSCJAG00000042808	-	100	97.436	ENSCJAG00000047682	-	100	97.436
ENSCJAG00000042808	-	81	94.444	ENSCJAG00000039429	-	100	94.872
ENSCJAG00000042808	-	100	96.795	ENSCJAG00000042604	-	100	96.795

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000042808	-	100	97.436	ENSG00000198242	RPL23A	100	98.571	Homo_sapiens
ENSCJAG00000042808	-	100	92.308	ENSAPOG00000008770	rpl23a	76	94.574	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000042808	-	61	74.737	ENSAMEG00000017534	-	83	65.891	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042808	-	83	70.000	ENSAMEG00000009758	-	82	70.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042808	-	83	74.046	ENSAMEG00000011777	-	83	74.615	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042808	-	99	83.117	ENSAMEG00000019431	-	82	81.890	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042808	-	99	68.387	ENSAMEG00000010669	-	82	65.891	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042808	-	63	75.000	ENSAMEG00000018533	-	94	75.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042808	-	100	67.516	ENSAMEG00000013394	-	80	66.142	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042808	-	100	97.436	ENSAMEG00000004684	RPL23A	100	97.436	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042808	-	99	91.613	ENSACIG00000002878	rpl23a	77	93.750	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000042808	-	100	92.308	ENSAOCG00000007918	rpl23a	76	94.574	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000042808	-	100	92.308	ENSAPEG00000023469	rpl23a	83	94.574	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000042808	-	100	92.949	ENSATEG00000021517	rpl23a	83	95.349	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000042808	-	93	96.575	ENSAPLG00000000604	RPL23A	94	96.575	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000042808	-	100	94.231	ENSACAG00000005311	RPL23A	83	96.899	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000042808	-	100	97.436	ENSANAG00000035778	-	100	97.436	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000042808	-	97	96.689	ENSANAG00000029957	-	98	96.689	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000042808	-	82	81.679	ENSANAG00000025336	-	100	81.679	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000042808	-	81	92.857	ENSANAG00000019559	-	100	93.590	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000042808	-	81	88.806	ENSANAG00000011108	-	100	90.244	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000042808	-	100	92.308	ENSANAG00000022026	-	95	92.308	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000042808	-	100	90.385	ENSAMXG00000041598	rpl23a	83	93.023	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000042808	-	100	97.436	ENSBTAG00000022278	-	99	97.436	Bos_taurus
ENSCJAG00000042808	-	96	97.315	ENSBTAG00000046394	-	100	97.315	Bos_taurus
ENSCJAG00000042808	-	100	59.615	ENSBTAG00000011830	-	100	59.615	Bos_taurus
ENSCJAG00000042808	-	100	96.154	ENSBTAG00000032432	-	99	96.154	Bos_taurus
ENSCJAG00000042808	-	81	94.444	ENSBTAG00000022498	-	99	94.872	Bos_taurus
ENSCJAG00000042808	-	81	92.063	ENSBTAG00000032775	-	100	92.949	Bos_taurus
ENSCJAG00000042808	-	100	97.436	ENSCAFG00000018784	-	100	97.436	Canis_familiaris
ENSCJAG00000042808	-	97	61.184	ENSCAFG00000003985	-	83	60.156	Canis_familiaris
ENSCJAG00000042808	-	81	93.651	ENSCAFG00000004003	-	85	93.798	Canis_familiaris
ENSCJAG00000042808	-	100	95.513	ENSCAFG00000024043	-	100	95.513	Canis_familiaris
ENSCJAG00000042808	-	83	89.922	ENSCAFG00000031555	-	83	89.922	Canis_familiaris
ENSCJAG00000042808	-	100	96.154	ENSCAFG00000001968	-	100	96.154	Canis_familiaris
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ENSCJAG00000042808	-	81	79.365	ENSCAFG00000017753	-	100	81.410	Canis_familiaris
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ENSCJAG00000042808	-	83	93.023	ENSCAFG00000020044	-	100	92.949	Canis_familiaris
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