EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000042850 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RPUSD4
Alias: FLJ14494
Full Name: RNA pseudouridine synthase D4
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10763 bases
Position: chrNTIC01001113.1:23761436-23772198
Accession: 100407115
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000065721	PseudoU_synth_2	PF00849.22	2.9e-33	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000078758	RPUSD4-201	3038	-	ENSCJAP00000065721	397 (aa)	XP_002754668	A0A2R8PKE8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	89.730	ENSG00000165526	RPUSD4	98	89.730	Homo_sapiens
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	50.904	ENSAPOG00000011024	rpusd4	83	50.904	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.703	ENSAMEG00000000127	-	98	82.703	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	57	83.654	ENSAMEG00000005953	-	97	83.654	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	48.328	ENSACIG00000003533	rpusd4	96	48.328	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	84	50.882	ENSAOCG00000015409	rpusd4	83	50.882	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	84	50.882	ENSAPEG00000018935	rpusd4	83	50.882	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	49.699	ENSATEG00000008059	rpusd4	82	49.699	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	70	61.649	ENSAPLG00000013250	RPUSD4	99	60.339	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	83	65.766	ENSACAG00000000189	RPUSD4	91	65.766	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	95.405	ENSANAG00000024050	RPUSD4	99	95.405	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	49.547	ENSACLG00000020996	rpusd4	84	49.547	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	86	47.977	ENSAMXG00000031479	rpusd4	92	49.390	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	79.784	ENSBTAG00000020900	RPUSD4	98	79.784	Bos_taurus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	79.784	ENSCAFG00000010488	RPUSD4	98	79.784	Canis_familiaris
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	79.784	ENSCAFG00020010621	RPUSD4	98	79.784	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	94	78.667	ENSCHIG00000009975	RPUSD4	99	78.667	Capra_hircus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	85.405	ENSTSYG00000008456	RPUSD4	98	85.405	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	63	78.486	ENSCAPG00000006040	RPUSD4	97	78.486	Cavia_aperea
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	79.189	ENSCPOG00000014971	RPUSD4	98	79.189	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	95.946	ENSCCAG00000027838	RPUSD4	99	95.946	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	89.189	ENSCATG00000041570	RPUSD4	98	89.189	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.432	ENSCLAG00000016553	RPUSD4	98	82.432	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	88.919	ENSCSAG00000002274	RPUSD4	98	88.919	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	70	82.609	ENSCHOG00000010249	RPUSD4	98	82.609	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	71	68.662	ENSCPBG00000011175	RPUSD4	98	68.662	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	68	43.165	ENSCSAVG00000000872	-	54	43.165	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	88.378	ENSCANG00000039684	RPUSD4	98	88.378	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	83.514	ENSCGRG00001024141	Rpusd4	98	83.514	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	83.514	ENSCGRG00000014415	Rpusd4	98	83.514	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	49.398	ENSCVAG00000000392	rpusd4	94	49.398	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	49.096	ENSCVAG00000008761	rpusd4	84	49.096	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	86	46.512	ENSDARG00000012674	rpusd4	96	46.512	Danio_rerio
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	77.568	ENSDNOG00000020026	RPUSD4	98	77.568	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	81.622	ENSDORG00000016717	Rpusd4	98	81.622	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	94	78.016	ENSETEG00000013953	RPUSD4	99	78.016	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	81.622	ENSEASG00005022982	RPUSD4	98	81.622	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	81.351	ENSECAG00000000557	RPUSD4	98	81.351	Equus_caballus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	76	76.630	ENSEEUG00000014036	RPUSD4	80	76.630	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	87	51.934	ENSELUG00000008075	rpusd4	95	51.934	Esox_lucius
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.703	ENSFCAG00000029789	RPUSD4	98	82.703	Felis_catus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	83	58.258	ENSFALG00000005171	RPUSD4	98	58.258	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	81.622	ENSFDAG00000014307	RPUSD4	98	81.622	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	84	49.412	ENSFHEG00000004329	rpusd4	88	49.412	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	81	50.920	ENSGMOG00000017726	rpusd4	96	50.920	Gadus_morhua
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	71	63.830	ENSGALG00000024326	RPUSD4	95	58.407	Gallus_gallus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	86	46.571	ENSGAFG00000021559	rpusd4	88	46.571	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	84	47.353	ENSGACG00000001657	rpusd4	100	47.353	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	84	63.393	ENSGAGG00000000132	RPUSD4	93	63.393	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	89.459	ENSGGOG00000016494	RPUSD4	98	89.459	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	49.547	ENSHBUG00000022838	rpusd4	84	49.547	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.162	ENSHGLG00000002285	RPUSD4	98	82.162	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.162	ENSHGLG00100006385	RPUSD4	98	82.162	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	81	51.220	ENSHCOG00000006612	rpusd4	83	51.220	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	81	51.840	ENSIPUG00000023879	rusd4	84	51.840	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	92	84.066	ENSSTOG00000025280	RPUSD4	100	84.066	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	81.892	ENSJJAG00000018673	Rpusd4	99	81.892	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	83	51.642	ENSKMAG00000021805	rpusd4	87	51.642	Kryptolebias_marmoratus
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ENSCJAG00000042850	RPUSD4	81	61.043	ENSLACG00000011028	RPUSD4	82	61.043	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	46.951	ENSLOCG00000003124	rpusd4	87	46.951	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.749	ENSLAFG00000005211	RPUSD4	98	82.749	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	89.459	ENSMFAG00000039513	RPUSD4	98	89.459	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	89.189	ENSMMUG00000007933	RPUSD4	98	89.189	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	89.189	ENSMNEG00000027414	RPUSD4	98	89.189	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	88.919	ENSMLEG00000042461	RPUSD4	98	88.919	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	83	48.547	ENSMAMG00000023839	rpusd4	89	48.547	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	49.547	ENSMZEG00005011999	rpusd4	84	49.547	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	70	61.786	ENSMGAG00000000840	RPUSD4	99	58.951	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	81.351	ENSMAUG00000010280	Rpusd4	98	81.351	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.703	ENSMICG00000015979	RPUSD4	98	82.703	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	79.730	ENSMOCG00000000661	Rpusd4	98	79.730	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	77	52.258	ENSMMOG00000021731	rpusd4	92	52.258	Mola_mola
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	87	73.121	ENSMODG00000004521	RPUSD4	89	73.121	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	75	52.475	ENSMALG00000005839	rpusd4	98	50.617	Monopterus_albus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	81.081	MGP_CAROLIEiJ_G0031954	Rpusd4	98	81.081	Mus_caroli
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	80.000	ENSMUSG00000032044	Rpusd4	98	80.000	Mus_musculus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	80.270	MGP_PahariEiJ_G0014819	Rpusd4	98	80.270	Mus_pahari
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	80.270	MGP_SPRETEiJ_G0033078	Rpusd4	98	80.270	Mus_spretus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	80.541	ENSMPUG00000006608	RPUSD4	98	80.541	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	81.572	ENSMLUG00000017328	-	97	81.572	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	64	84.252	ENSMLUG00000029348	-	100	84.252	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	79.730	ENSNGAG00000020847	Rpusd4	98	79.730	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	82	49.848	ENSNBRG00000005207	rpusd4	95	49.848	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	88.919	ENSNLEG00000007465	RPUSD4	98	88.919	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	69.811	ENSMEUG00000004370	RPUSD4	98	69.811	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	67	60.755	ENSOPRG00000013141	-	100	60.755	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	80.541	ENSODEG00000004577	RPUSD4	98	80.541	Octodon_degus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	85	49.854	ENSONIG00000018879	rpusd4	92	49.854	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	73	71.864	ENSOANG00000007247	RPUSD4	95	71.717	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	91	82.873	ENSOCUG00000017039	RPUSD4	96	82.873	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	86	47.399	ENSORLG00000002750	rpusd4	95	47.399	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	83	48.204	ENSORLG00020002044	rpusd4	83	48.204	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	83	48.955	ENSORLG00015020034	rpusd4	83	48.955	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	84	48.968	ENSOMEG00000004861	rpusd4	83	48.968	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	79.784	ENSOGAG00000008922	RPUSD4	98	79.784	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	92	79.508	ENSOARG00000012238	RPUSD4	96	79.508	Ovis_aries
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	90.000	ENSPPAG00000042883	RPUSD4	91	90.000	Pan_paniscus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.703	ENSPPRG00000003081	RPUSD4	98	82.703	Panthera_pardus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	82.703	ENSPTIG00000012059	RPUSD4	98	82.703	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	89.730	ENSPTRG00000004454	RPUSD4	98	89.730	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	88.919	ENSPANG00000015040	RPUSD4	98	88.919	Papio_anubis
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	84	55.621	ENSPKIG00000023986	rpusd4	86	55.621	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	76	67.987	ENSPSIG00000014268	RPUSD4	96	67.987	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	86	47.293	ENSPMGG00000002806	rpusd4	97	47.293	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	73.514	ENSPEMG00000000278	Rpusd4	98	73.514	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000042850	RPUSD4	77	45.428	ENSPMAG00000008183	rpusd4	98	45.428	Petromyzon_marinus
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