EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000045028 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: 60S ribosomal protein L39-like
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 228 bases
Position: chrNTIC01022223.1:59732338-59732565
Accession: 108591275
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000057601	Ribosomal_L39	PF00832.20	1.1e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000069282	-	228	-	ENSCJAP00000057601	75 (aa)	XP_017826808	A0A2R8P874

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000045028	-	68	86.275	ENSCJAG00000042864	-	100	86.275
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCJAG00000040046	-	100	90.196
ENSCJAG00000045028	-	68	86.275	ENSCJAG00000048360	-	100	86.275
ENSCJAG00000045028	-	68	68.627	ENSCJAG00000045312	-	100	68.627
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCJAG00000038615	-	100	90.196

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSG00000198918	RPL39	100	90.196	Homo_sapiens
ENSCJAG00000045028	-	67	90.000	ENSAPOG00000012798	rpl39	94	90.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000045028	-	68	88.235	ENSACIG00000013617	rpl39	98	88.235	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSAOCG00000011218	rpl39	100	90.196	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000045028	-	67	88.000	ENSAPEG00000005525	rpl39	94	88.000	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSATEG00000018783	rpl39	100	90.196	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000045028	-	67	88.000	ENSACAG00000003624	RPL39	98	88.000	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSANAG00000015996	-	100	90.196	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000045028	-	64	89.583	ENSANAG00000011451	-	65	89.583	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSANAG00000012309	-	100	90.196	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSANAG00000033543	-	100	90.196	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSANAG00000031269	-	100	90.196	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSANAG00000012093	-	100	90.196	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000045028	-	67	90.000	ENSACLG00000001657	rpl39	91	90.000	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000045028	-	57	90.698	ENSAMXG00000000196	rpl39	86	90.698	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000045028	-	68	88.235	ENSBTAG00000049161	-	100	88.235	Bos_taurus
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSBTAG00000049441	RPL39	100	90.196	Bos_taurus
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSBTAG00000047136	RPL39	100	90.196	Bos_taurus
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSBTAG00000049833	RPL39	100	90.196	Bos_taurus
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSBTAG00000054736	RPL39	100	90.196	Bos_taurus
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSBTAG00000054083	RPL39	100	90.196	Bos_taurus
ENSCJAG00000045028	-	68	84.314	ENSBTAG00000048422	-	100	84.314	Bos_taurus
ENSCJAG00000045028	-	68	84.314	ENSBTAG00000048605	-	100	84.314	Bos_taurus
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSBTAG00000034844	RPL39	100	90.196	Bos_taurus
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCAFG00000031092	-	100	90.196	Canis_familiaris
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCAFG00000032101	-	100	90.196	Canis_familiaris
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCAFG00000029524	-	100	90.196	Canis_familiaris
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCAFG00000032122	-	100	90.196	Canis_familiaris
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCAFG00000029014	-	100	90.196	Canis_familiaris
ENSCJAG00000045028	-	68	92.157	ENSCAFG00020022170	-	100	92.157	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	83	78.125	ENSCAFG00020017348	-	94	78.125	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCAFG00020026417	-	100	90.196	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	68	86.275	ENSCAFG00020019302	-	100	86.275	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	68	88.235	ENSCAFG00020010357	-	100	88.235	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	68	88.235	ENSCAFG00020006843	-	100	88.235	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	68	88.235	ENSCAFG00020013245	-	100	88.235	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	71	83.019	ENSCAFG00020018445	-	71	83.019	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCAFG00020000437	-	100	90.196	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	67	81.818	ENSCAFG00020004092	-	89	81.818	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCAFG00020027407	-	100	90.196	Canis_lupus_dingo
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ENSCJAG00000045028	-	68	90.196	ENSCAFG00020026703	-	100	90.196	Canis_lupus_dingo
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