EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000046275 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 38513 bases
Position: chrNTIC01005557.1:42683770-42722282
Accession: 100395022
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000012537	MMR_HSR1	PF01926.23	1.9e-05	1	1
ENSCJAP00000066464	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000083434	RAB1A-203	426	-	ENSCJAP00000056723	141 (aa)	-	A0A2R8N066
ENSCJAT00000067513	RAB1A-206	465	-	ENSCJAP00000067154	154 (aa)	-	A0A2R8NFB2
ENSCJAT00000072211	RAB1A-201	618	-	ENSCJAP00000066464	205 (aa)	XP_002757737	F7GSP9
ENSCJAT00000013214	RAB1A-205	597	-	ENSCJAP00000012537	198 (aa)	-	F7GXX1
ENSCJAT00000074454	RAB1A-204	390	-	ENSCJAP00000057017	129 (aa)	-	A0A2R8MBR0
ENSCJAT00000075003	RAB1A-202	522	-	ENSCJAP00000057484	173 (aa)	-	A0A2R8N1H1

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000046275's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000046275's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000046275	RAB1A	78	39.623	ENSCJAG00000003973	RAB9A	79	39.623
ENSCJAG00000046275	RAB1A	90	46.927	ENSCJAG00000019696	RAB15	90	57.944
ENSCJAG00000046275	RAB1A	81	30.303	ENSCJAG00000008094	DNAJC27	89	30.380
ENSCJAG00000046275	RAB1A	80	39.264	ENSCJAG00000017521	RAB7A	81	38.994
ENSCJAG00000046275	RAB1A	79	36.709	ENSCJAG00000039507	-	90	37.278
ENSCJAG00000046275	RAB1A	83	35.928	ENSCJAG00000044294	MRAS	80	35.928
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	54.315	ENSCJAG00000008955	RAB35	100	53.960
ENSCJAG00000046275	RAB1A	97	38.384	ENSCJAG00000039039	RAB6A	94	38.384
ENSCJAG00000046275	RAB1A	98	43.814	ENSCJAG00000048394	RAB5A	90	43.814
ENSCJAG00000046275	RAB1A	85	32.544	ENSCJAG00000042669	RHEB	91	32.544
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	45.581	ENSCJAG00000010778	RAB11B	92	52.727
ENSCJAG00000046275	RAB1A	87	35.028	ENSCJAG00000012199	HRAS	93	35.028
ENSCJAG00000046275	RAB1A	59	33.333	ENSCJAG00000044597	-	61	33.333
ENSCJAG00000046275	RAB1A	78	39.623	ENSCJAG00000003347	RAB9B	79	39.623
ENSCJAG00000046275	RAB1A	59	34.746	ENSCJAG00000005865	ARL8A	61	34.746
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	44.554	ENSCJAG00000042020	RAB14	93	44.554
ENSCJAG00000046275	RAB1A	77	36.538	ENSCJAG00000018414	-	65	36.538
ENSCJAG00000046275	RAB1A	86	44.767	ENSCJAG00000047802	RAB39B	84	43.820
ENSCJAG00000046275	RAB1A	91	46.703	ENSCJAG00000045749	RAB18	93	45.876
ENSCJAG00000046275	RAB1A	98	43.367	ENSCJAG00000041780	RAB5B	85	43.367
ENSCJAG00000046275	RAB1A	85	50.000	ENSCJAG00000015468	RAB12	50	50.296
ENSCJAG00000046275	RAB1A	83	50.610	ENSCJAG00000041773	RAB30	82	50.602
ENSCJAG00000046275	RAB1A	59	31.092	ENSCJAG00000042179	ARL4C	59	31.092
ENSCJAG00000046275	RAB1A	79	37.342	ENSCJAG00000042173	-	90	37.870
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	46.829	ENSCJAG00000042037	RAB11A	95	46.829
ENSCJAG00000046275	RAB1A	82	38.650	ENSCJAG00000036517	NRAS	91	38.650
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	92.079	ENSCJAG00000047933	-	100	92.079
ENSCJAG00000046275	RAB1A	92	48.634	ENSCJAG00000008981	RAB2B	86	48.649
ENSCJAG00000046275	RAB1A	90	55.866	ENSCJAG00000009933	-	90	55.435
ENSCJAG00000046275	RAB1A	80	39.130	ENSCJAG00000013101	RAB34	62	39.130
ENSCJAG00000046275	RAB1A	81	38.037	ENSCJAG00000009762	RAB36	61	38.037
ENSCJAG00000046275	RAB1A	83	37.576	ENSCJAG00000044757	KRAS	95	35.912
ENSCJAG00000046275	RAB1A	82	47.619	ENSCJAG00000002524	RAB33A	71	47.619
ENSCJAG00000046275	RAB1A	85	45.238	ENSCJAG00000007715	RAB25	82	44.970
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	93.069	ENSCJAG00000001599	-	100	93.069
ENSCJAG00000046275	RAB1A	83	35.152	ENSCJAG00000010247	RAB23	73	33.526
ENSCJAG00000046275	RAB1A	90	32.609	ENSCJAG00000021602	RERG	90	32.609
ENSCJAG00000046275	RAB1A	59	32.203	ENSCJAG00000046554	ARL8B	61	32.203
ENSCJAG00000046275	RAB1A	98	39.086	ENSCJAG00000044464	RAB22A	97	39.086
ENSCJAG00000046275	RAB1A	82	45.238	ENSCJAG00000040200	RAB33B	76	44.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	100.000	Capra_hircus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	99.492	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSHGLG00100007994	RAB1A	97	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000046275	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000046275	RAB1A	97	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	93.909	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	100.000	Ovis_aries
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	100.000	Pan_paniscus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	Panthera_pardus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSPANG00000010485	RAB1A	100	100.000	Papio_anubis
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	99.492	ENSPSIG00000008028	RAB1A	99	96.552	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.939	ENSPMGG00000021015	-	99	95.588	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSPEMG00000009340	Rab1a	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	99.512	ENSPCIG00000023212	RAB1A	100	99.512	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	93.909	ENSPFOG00000000498	-	99	93.137	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	94.059	ENSPLAG00000015592	-	100	94.059	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	94.059	ENSPMEG00000005288	-	100	94.059	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSPPYG00000012360	RAB1A	100	100.000	Pongo_abelii
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSPCOG00000017244	RAB1A	100	100.000	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	96.040	ENSPNYG00000015841	-	100	96.040	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSRNOG00000004992	Rab1a	100	100.000	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSSBOG00000023732	RAB1A	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	99.492	ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	98.010	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.545	ENSSMAG00000021049	-	100	95.545	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	95.455	ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	99.512	ENSSPUG00000012822	RAB1A	100	99.512	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.545	ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSSSCG00000008359	RAB1A	100	100.000	Sus_scrofa
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	99.492	ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.050	ENSTRUG00000024994	RAB1A	100	95.050	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSUMAG00000021038	RAB1A	99	100.000	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	ENSVPAG00000005640	RAB1A	99	99.495	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	ENSVVUG00000027588	RAB1A	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	94.554	ENSXMAG00000015776	-	100	94.554	Xiphophorus_maculatus