EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000046570 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9196 bases
Position: chrNTIC01036611.1:96045532-96054727
Accession: 100396674
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000055600	SYF2	PF08231.12	2e-54	1	1
ENSCJAP00000055816	SYF2	PF08231.12	5.7e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000072348	SYF2-201	1537	-	ENSCJAP00000055816	243 (aa)	XP_002750491	U3FGF7
ENSCJAT00000079719	SYF2-202	606	-	ENSCJAP00000055600	201 (aa)	-	A0A2R8M8Q0

Gene Model

Click here to download ENSCJAG00000046570's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCJAG00000046570's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.010	ENSG00000117614	SYF2	100	98.010	Homo_sapiens
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	84.932	ENSAPOG00000001174	syf2	91	85.185	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000046570	SYF2	80	96.923	ENSAMEG00000010134	-	100	96.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000046570	SYF2	98	92.946	ENSAMEG00000010115	-	99	92.946	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	75.100	ENSACIG00000023688	syf2	86	82.791	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000046570	SYF2	88	79.909	ENSAOCG00000010912	syf2	62	84.422	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000046570	SYF2	98	80.672	ENSAOCG00000022046	syf2	99	80.672	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000046570	SYF2	95	81.356	ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.648	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000046570	SYF2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000046570	SYF2	82	89.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	Anas_platyrhynchos
ENSCJAG00000046570	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000046570	SYF2	79	75.625	ENSACAG00000026777	-	96	75.625	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	99.177	ENSANAG00000032473	SYF2	100	99.177	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	81.735	ENSACLG00000019916	syf2	91	82.870	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.486	ENSAMXG00000004051	syf2	91	83.796	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.653	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.492	Bos_taurus
ENSCJAG00000046570	SYF2	94	45.263	WBGene00019402	syf-2	90	50.711	Caenorhabditis_elegans
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	94.262	ENSCAFG00000012895	-	99	94.262	Canis_familiaris
ENSCJAG00000046570	SYF2	92	89.286	ENSCAFG00000030331	-	100	83.128	Canis_familiaris
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	94.262	ENSCAFG00020021091	-	99	94.262	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000046570	SYF2	91	91.209	ENSCAFG00020021094	-	100	83.824	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.593	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	93.724	Capra_hircus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.827	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.827	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000046570	SYF2	81	98.990	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	Cavia_aperea
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.443	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.443	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	99.588	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	99.588	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.119	ENSCATG00000026917	SYF2	100	97.119	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	94.672	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.672	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.119	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.119	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000046570	SYF2	74	77.348	ENSCHOG00000005273	-	100	75.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000046570	SYF2	92	89.286	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	87.124	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000046570	SYF2	87	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSCJAG00000046570	SYF2	87	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	83.951	ENSCANG00000037322	SYF2	100	83.951	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	90.535	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000046570	SYF2	82	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	90	79.070	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	82.192	ENSCVAG00000019543	syf2	90	82.407	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	78.333	ENSDARG00000004706	syf2	99	78.333	Danio_rerio
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	93.416	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	93.416	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	92.562	ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.562	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	57.273	FBgn0033556	CG12343	96	56.881	Drosophila_melanogaster
ENSCJAG00000046570	SYF2	94	77.293	ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.293	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000046570	SYF2	89	56.044	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	82.305	ENSEASG00005004232	-	100	82.305	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.245	ENSEASG00005004224	-	100	92.245	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	92.975	ENSECAG00000010440	-	96	96.507	Equus_caballus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.061	ENSECAG00000012023	-	100	93.061	Equus_caballus
ENSCJAG00000046570	SYF2	75	80.874	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.874	Erinaceus_europaeus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	79.835	ENSELUG00000003465	syf2	99	78.776	Esox_lucius
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	93.852	ENSFCAG00000043095	-	99	93.852	Felis_catus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	94.286	ENSFCAG00000010324	-	85	94.286	Felis_catus
ENSCJAG00000046570	SYF2	84	85.784	ENSFALG00000000460	SYF2	88	85.185	Ficedula_albicollis
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.827	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.827	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	67.727	ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.742	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.486	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	Gadus_morhua
ENSCJAG00000046570	SYF2	92	88.393	ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.400	Gallus_gallus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.275	ENSGAFG00000019435	syf2	91	81.019	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000046570	SYF2	88	83.721	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	92	89.732	ENSGAGG00000010670	SYF2	87	90.278	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.354	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	98.354	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	81.735	ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.870	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000046570	SYF2	93	84.141	ENSHGLG00000004304	-	99	80.417	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000046570	SYF2	98	78.423	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.593	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000046570	SYF2	91	83.710	ENSIPUG00000019859	syf2	91	85.185	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	60	97.945	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	82	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	82.569	ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.870	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.562	ENSLBEG00000014425	syf2	91	84.259	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	80.417	ENSLACG00000012064	SYF2	91	86.574	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000046570	SYF2	97	81.277	ENSLOCG00000002728	syf2	92	81.277	Lepisosteus_oculatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.245	ENSLAFG00000023150	-	100	92.245	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.531	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	97.531	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.531	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.531	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.531	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	97.531	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.119	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	97.119	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000046570	SYF2	89	82.028	ENSMAMG00000010403	syf2	90	82.407	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	95	78.814	ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.870	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000046570	SYF2	82	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	90.947	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000046570	SYF2	89	98.315	ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.181	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.181	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.365	ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	Mola_mola
ENSCJAG00000046570	SYF2	93	88.546	ENSMODG00000013951	-	95	89.908	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	82.727	ENSMALG00000010706	syf2	90	83.410	Monopterus_albus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	91.358	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	90.123	Mus_caroli
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	91.358	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	90.123	Mus_musculus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	91.358	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	90.123	Mus_pahari
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	91.358	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	90.123	Mus_spretus
ENSCJAG00000046570	SYF2	98	94.167	ENSMPUG00000015801	-	98	94.167	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	93.852	ENSMPUG00000015802	-	99	93.852	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000046570	SYF2	98	93.333	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	93.333	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	92.653	ENSNGAG00000007912	Syf2	99	92.653	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000046570	SYF2	97	72.500	ENSNBRG00000010720	syf2	91	74.178	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.765	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.765	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	91.358	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000046570	SYF2	96	84.979	ENSODEG00000014338	-	98	84.979	Octodon_degus
ENSCJAG00000046570	SYF2	96	95.279	ENSODEG00000017664	-	98	95.279	Octodon_degus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	81.735	ENSONIG00000008213	syf2	91	82.407	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000046570	SYF2	83	91.089	ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	94.672	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.105	ENSORLG00000028820	syf2	93	83.796	Oryzias_latipes
ENSCJAG00000046570	SYF2	96	79.079	ENSORLG00020018333	syf2	91	83.796	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.028	ENSORLG00015014665	syf2	91	83.796	Oryzias_latipes_hsok
ENSCJAG00000046570	SYF2	96	79.412	ENSOMEG00000013911	syf2	91	84.259	Oryzias_melastigma
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	94.215	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000046570	SYF2	80	67.692	ENSOARG00000006269	-	100	67.692	Ovis_aries
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.713	ENSOARG00000006348	-	100	92.308	Ovis_aries
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.354	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	98.354	Pan_paniscus
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	93.852	ENSPPRG00000001651	-	99	93.852	Panthera_pardus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.902	ENSPPRG00000001638	-	100	93.902	Panthera_pardus
ENSCJAG00000046570	SYF2	94	96.930	ENSPTIG00000005711	-	83	96.930	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	93.443	ENSPTIG00000007036	-	99	93.443	Panthera_tigris_altaica
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.354	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	98.354	Pan_troglodytes
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.531	ENSPANG00000008139	SYF2	100	97.531	Papio_anubis
ENSCJAG00000046570	SYF2	95	80.687	ENSPKIG00000008130	syf2	92	85.185	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCJAG00000046570	SYF2	96	86.266	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.266	Pelodiscus_sinensis
ENSCJAG00000046570	SYF2	97	78.390	ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.870	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	91.358	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCJAG00000046570	SYF2	93	93.778	ENSPCIG00000014235	SYF2	86	95.833	Phascolarctos_cinereus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.734	ENSPFOG00000004116	syf2	89	81.019	Poecilia_formosa
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.734	ENSPLAG00000006691	syf2	92	81.395	Poecilia_latipinna
ENSCJAG00000046570	SYF2	96	73.932	ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.932	Poecilia_mexicana
ENSCJAG00000046570	SYF2	89	81.481	ENSPREG00000003009	syf2	91	81.481	Poecilia_reticulata
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.354	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	98.354	Pongo_abelii
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	77.114	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	Propithecus_coquereli
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	81.893	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.893	Pteropus_vampyrus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	81.735	ENSPNYG00000004979	syf2	91	82.870	Pundamilia_nyererei
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	79.835	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.424	Pygocentrus_nattereri
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	91.358	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	90.123	Rattus_norvegicus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	95.062	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	95.062	Rhinopithecus_bieti
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.531	ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.531	Rhinopithecus_roxellana
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	98.354	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	98.354	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCJAG00000046570	SYF2	84	94.175	ENSSHAG00000007152	-	100	94.175	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000046570	SYF2	93	92.000	ENSSHAG00000015630	-	87	93.519	Sarcophilus_harrisii
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	84.862	ENSSFOG00015023647	syf2	91	85.185	Scleropages_formosus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	82.110	ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.407	Scophthalmus_maximus
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.486	ENSSDUG00000013072	syf2	91	83.796	Seriola_dumerili
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.486	ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.796	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	74.590	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	Sorex_araneus
ENSCJAG00000046570	SYF2	95	86.580	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.889	Sphenodon_punctatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	96	78.571	ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.796	Stegastes_partitus
ENSCJAG00000046570	SYF2	98	91.393	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.393	Sus_scrofa
ENSCJAG00000046570	SYF2	58	73.504	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	61.491	Taeniopygia_guttata
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	74.897	ENSTRUG00000001499	syf2	86	82.326	Takifugu_rubripes
ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.734	ENSTNIG00000016912	syf2	97	81.019	Tetraodon_nigroviridis
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	70.782	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.370	Tupaia_belangeri
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.623	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	Tursiops_truncatus
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	92.623	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.623	Ursus_americanus
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	93.033	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	93.033	Ursus_maritimus
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.033	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	Vicugna_pacos
ENSCJAG00000046570	SYF2	99	94.262	ENSVVUG00000027175	-	99	94.262	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000046570	SYF2	100	90.323	ENSVVUG00000027181	-	100	90.323	Vulpes_vulpes
ENSCJAG00000046570	SYF2	96	83.262	ENSXETG00000022797	syf2	87	86.574	Xenopus_tropicalis
ENSCJAG00000046570	SYF2	88	81.395	ENSXMAG00000022698	syf2	91	81.019	Xiphophorus_maculatus