EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000048360 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 156 bases
Position: chrNTIC01036611.1:29283807-29283962
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000009150	Ribosomal_L39	PF00832.20	1.1e-20	1	1

Transcripts

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ENSCJAT00000009670	-	156	-	ENSCJAP00000009150	51 (aa)	-	F7IQ68

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSCJAG00000038615	-	100	92.157
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ENSCJAG00000048360	-	100	86.275	ENSCJAG00000042864	-	100	86.275
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSCJAG00000040046	-	100	92.157
ENSCJAG00000048360	-	100	70.588	ENSCJAG00000045312	-	100	70.588

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSG00000198918	RPL39	100	92.157	Homo_sapiens
ENSCJAG00000048360	-	98	94.000	ENSAPOG00000012798	rpl39	94	94.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSACIG00000013617	rpl39	98	92.157	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSAOCG00000011218	rpl39	100	92.157	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000048360	-	98	94.000	ENSAPEG00000005525	rpl39	94	94.000	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSATEG00000018783	rpl39	100	92.157	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000048360	-	98	92.000	ENSACAG00000003624	RPL39	98	92.000	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSANAG00000031269	-	100	92.157	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000048360	-	100	94.118	ENSANAG00000012093	-	100	94.118	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSANAG00000015996	-	100	92.157	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSANAG00000033543	-	100	92.157	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSANAG00000012309	-	100	92.157	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000048360	-	98	90.000	ENSANAG00000011451	-	68	90.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000048360	-	98	94.000	ENSACLG00000001657	rpl39	91	94.000	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000048360	-	84	93.023	ENSAMXG00000000196	rpl39	86	93.023	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSBTAG00000034844	RPL39	100	92.157	Bos_taurus
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSBTAG00000049833	RPL39	100	92.157	Bos_taurus
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ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSBTAG00000054083	RPL39	100	92.157	Bos_taurus
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSBTAG00000054736	RPL39	100	92.157	Bos_taurus
ENSCJAG00000048360	-	100	90.196	ENSBTAG00000049161	-	100	90.196	Bos_taurus
ENSCJAG00000048360	-	100	90.196	ENSBTAG00000048605	-	100	90.196	Bos_taurus
ENSCJAG00000048360	-	100	86.275	ENSBTAG00000048422	-	100	86.275	Bos_taurus
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSCAFG00000029014	-	100	92.157	Canis_familiaris
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSCAFG00000032101	-	100	92.157	Canis_familiaris
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSCAFG00000029524	-	100	92.157	Canis_familiaris
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSCAFG00000032122	-	100	92.157	Canis_familiaris
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSCAFG00000031092	-	100	92.157	Canis_familiaris
ENSCJAG00000048360	-	100	86.275	ENSCAFG00020018445	-	68	86.275	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000048360	-	100	90.196	ENSCAFG00020010357	-	100	90.196	Canis_lupus_dingo
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ENSCJAG00000048360	-	100	90.196	ENSCAFG00020012355	-	100	90.196	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSCAFG00020000437	-	100	92.157	Canis_lupus_dingo
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ENSCJAG00000048360	-	100	90.196	ENSCAFG00020022170	-	100	90.196	Canis_lupus_dingo
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ENSCJAG00000048360	-	100	90.196	ENSCAFG00020006843	-	100	90.196	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000048360	-	100	92.157	ENSCAFG00020003011	-	100	92.157	Canis_lupus_dingo
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