EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000048403 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRSF6
Alias: B52|SFRS6|SRP55
Full Name: serine and arginine rich splicing factor 6
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9074 bases
Position: chrNTIC01034389.1:36312207-36321280
Accession: 10788
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000058014	RRM_1	PF00076.22	6.8e-33	1	2
ENSCJAP00000058014	RRM_1	PF00076.22	6.8e-33	2	2
ENSCJAP00000059311	RRM_1	PF00076.22	3.3e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCJAT00000075887	SRSF6-202	408	-	ENSCJAP00000059311	135 (aa)	-	A0A2R8MGQ0
ENSCJAT00000085629	SRSF6-201	5015	-	ENSCJAP00000058014	271 (aa)	-	A0A2R8MDR9

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCJAG00000048403	SRSF6	62	39.884	ENSCJAG00000008111	-	81	38.660
ENSCJAG00000048403	SRSF6	66	65.363	ENSCJAG00000014884	SRSF5	87	61.290
ENSCJAG00000048403	SRSF6	75	30.693	ENSCJAG00000001294	RBM14	59	32.143
ENSCJAG00000048403	SRSF6	56	48.101	ENSCJAG00000015185	SRSF7	58	48.101
ENSCJAG00000048403	SRSF6	73	40.670	ENSCJAG00000041713	-	77	50.000
ENSCJAG00000048403	SRSF6	53	36.709	ENSCJAG00000040528	-	82	37.500
ENSCJAG00000048403	SRSF6	62	32.143	ENSCJAG00000013666	RBM4B	58	32.143
ENSCJAG00000048403	SRSF6	62	40.000	ENSCJAG00000001187	SRSF9	71	41.143
ENSCJAG00000048403	SRSF6	56	46.835	ENSCJAG00000016062	-	64	46.835

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSG00000124193	SRSF6	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCJAG00000048403	SRSF6	58	93.590	ENSAPOG00000016635	-	84	82.353	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	69	78.723	ENSAMEG00000003710	SRSF6	54	78.723	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000048403	SRSF6	80	77.130	ENSACIG00000020091	-	95	80.315	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	66	88.827	ENSACIG00000023658	-	55	88.268	Amphilophus_citrinellus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	97	69.776	ENSAOCG00000004309	-	57	83.152	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000048403	SRSF6	92	67.939	ENSAOCG00000019438	-	98	67.939	Amphiprion_ocellaris
ENSCJAG00000048403	SRSF6	69	82.105	ENSAPEG00000020746	-	66	79.787	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000048403	SRSF6	98	61.871	ENSAPEG00000013086	-	53	88.172	Amphiprion_percula
ENSCJAG00000048403	SRSF6	67	82.967	ENSATEG00000007255	-	71	80.000	Anabas_testudineus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	94.536	ENSACAG00000002061	SRSF6	53	91.979	Anolis_carolinensis
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSANAG00000024080	SRSF6	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000048403	SRSF6	54	89.041	ENSACLG00000024373	-	96	79.570	Astatotilapia_calliptera
ENSCJAG00000048403	SRSF6	67	87.634	ENSAMXG00000003101	-	51	85.789	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	83.333	ENSAMXG00000042692	-	96	78.519	Astyanax_mexicanus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	99.259	ENSBTAG00000008527	SRSF6	100	99.259	Bos_taurus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	99.259	ENSCAFG00000009289	SRSF6	100	99.259	Canis_familiaris
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	99.259	ENSCAFG00020013559	SRSF6	100	99.259	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	97.761	ENSCHIG00000009148	-	78	97.761	Capra_hircus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	99.259	ENSCHIG00000015890	-	100	99.259	Capra_hircus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	80.224	ENSTSYG00000026476	SRSF6	74	80.224	Carlito_syrichta
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSCPOG00000011761	SRSF6	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSCCAG00000026018	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	87.634	ENSCCAG00000018540	-	62	87.766	Cebus_capucinus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSCATG00000030794	SRSF6	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSCLAG00000010247	SRSF6	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	100.000	ENSCSAG00000014022	SRSF6	78	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	80.524	ENSCHOG00000000561	SRSF6	77	80.524	Choloepus_hoffmanni
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	92.553	ENSCPBG00000018200	SRSF6	55	94.737	Chrysemys_picta_bellii
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	99.254	ENSCANG00000037774	-	78	99.254	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	80.970	ENSCANG00000042529	-	74	80.970	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	98.519	ENSCGRG00001022339	Srsf6	100	98.519	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCJAG00000048403	SRSF6	51	100.000	ENSCGRG00000006618	Srsf6	66	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCJAG00000048403	SRSF6	58	93.590	ENSCSEG00000019778	SRSF6	90	84.252	Cynoglossus_semilaevis
ENSCJAG00000048403	SRSF6	58	92.308	ENSCVAG00000001863	SRSF6	95	85.039	Cyprinodon_variegatus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	83.957	ENSDARG00000016783	srsf6b	87	89.157	Danio_rerio
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	99.251	ENSDNOG00000008410	SRSF6	77	99.251	Dasypus_novemcinctus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSDORG00000028378	Srsf6	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCJAG00000048403	SRSF6	69	94.652	ENSETEG00000006221	SRSF6	54	91.979	Echinops_telfairi
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	97.761	ENSEASG00005023429	SRSF6	78	97.761	Equus_asinus_asinus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	97.761	ENSECAG00000023932	SRSF6	82	97.761	Equus_caballus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	98	59.286	ENSELUG00000024182	SRSF6	85	87.356	Esox_lucius
ENSCJAG00000048403	SRSF6	67	84.530	ENSELUG00000013506	SRSF6	88	77.778	Esox_lucius
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	98.127	ENSFCAG00000032814	SRSF6	78	98.127	Felis_catus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	80.597	ENSFDAG00000012191	SRSF6	74	80.597	Fukomys_damarensis
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	88.525	ENSFHEG00000023065	srsf6a	55	87.500	Fundulus_heteroclitus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	85	79.913	ENSGMOG00000014458	srsf6a	52	78.646	Gadus_morhua
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	97.037	ENSGALG00000000990	SRSF6	100	97.037	Gallus_gallus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	58	92.308	ENSGAFG00000019088	-	72	82.400	Gambusia_affinis
ENSCJAG00000048403	SRSF6	98	61.194	ENSGACG00000006084	srsf6a	53	83.871	Gasterosteus_aculeatus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	92.553	ENSGAGG00000003238	SRSF6	55	94.737	Gopherus_agassizii
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSGGOG00000009808	SRSF6	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCJAG00000048403	SRSF6	80	73.684	ENSHBUG00000006386	-	58	83.696	Haplochromis_burtoni
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSHGLG00000007348	SRSF6	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000048403	SRSF6	98	57.576	ENSHGLG00000007701	-	58	79.144	Heterocephalus_glaber_female
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	80.224	ENSHGLG00100005043	SRSF6	74	80.224	Heterocephalus_glaber_male
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	83.607	ENSHCOG00000002740	srsf6a	57	83.152	Hippocampus_comes
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	86.885	ENSIPUG00000004776	-	64	86.413	Ictalurus_punctatus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSSTOG00000010866	SRSF6	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	51	97.842	ENSJJAG00000020690	Srsf6	67	97.842	Jaculus_jaculus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	96	67.509	ENSKMAG00000011934	srsf6a	59	85.870	Kryptolebias_marmoratus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	67	84.783	ENSLBEG00000007356	srsf6a	52	85.484	Labrus_bergylta
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	85.240	ENSLACG00000005466	SRSF6	54	91.848	Latimeria_chalumnae
ENSCJAG00000048403	SRSF6	67	96.703	ENSLAFG00000006682	SRSF6	71	96.703	Loxodonta_africana
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSMFAG00000036925	SRSF6	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSMMUG00000006742	SRSF6	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	98.519	ENSMNEG00000027392	-	100	98.519	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	98.881	ENSMNEG00000038270	-	78	98.881	Macaca_nemestrina
ENSCJAG00000048403	SRSF6	51	100.000	ENSMLEG00000031524	SRSF6	65	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	98	61.871	ENSMAMG00000017161	srsf6a	68	75.000	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	63	87.059	ENSMAMG00000023477	-	89	87.059	Mastacembelus_armatus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	98	58.333	ENSMZEG00005020658	-	60	82.873	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000048403	SRSF6	79	71.861	ENSMZEG00005008032	-	57	83.696	Maylandia_zebra
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	98.519	ENSMAUG00000019086	-	100	98.519	Mesocricetus_auratus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSMICG00000008537	SRSF6	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	51	100.000	ENSMOCG00000018738	Srsf6	66	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSCJAG00000048403	SRSF6	58	92.308	ENSMMOG00000015241	-	78	90.361	Mola_mola
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	95.699	ENSMODG00000003107	SRSF6	55	96.809	Monodelphis_domestica
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	98.519	MGP_CAROLIEiJ_G0024606	Srsf6	100	98.519	Mus_caroli
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	98.519	ENSMUSG00000016921	Srsf6	100	98.519	Mus_musculus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	98.519	MGP_PahariEiJ_G0026050	Srsf6	100	98.519	Mus_pahari
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	98.519	MGP_SPRETEiJ_G0025528	Srsf6	100	98.519	Mus_spretus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	98.127	ENSMPUG00000017692	SRSF6	93	98.127	Mustela_putorius_furo
ENSCJAG00000048403	SRSF6	69	71.123	ENSMLUG00000016618	SRSF6	54	71.123	Myotis_lucifugus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSNGAG00000017560	Srsf6	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	83.060	ENSNBRG00000014709	-	58	83.696	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000048403	SRSF6	67	88.525	ENSNBRG00000001846	-	52	87.634	Neolamprologus_brichardi
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSNLEG00000006524	SRSF6	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	95.699	ENSMEUG00000014615	SRSF6	62	96.809	Notamacropus_eugenii
ENSCJAG00000048403	SRSF6	67	98.901	ENSOPRG00000002017	-	71	98.901	Ochotona_princeps
ENSCJAG00000048403	SRSF6	100	100.000	ENSODEG00000016510	-	100	100.000	Octodon_degus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	67	85.792	ENSONIG00000001925	-	52	88.172	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	68	84.153	ENSONIG00000020247	-	53	84.239	Oreochromis_niloticus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	93	58.498	ENSOCUG00000023999	-	70	63.687	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	69	72.549	ENSOCUG00000009785	-	64	77.320	Oryctolagus_cuniculus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	58	94.872	ENSORLG00020017506	srsf6a	90	70.323	Oryzias_latipes_hni
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	97.753	ENSOGAG00000014468	SRSF6	77	97.753	Otolemur_garnettii
ENSCJAG00000048403	SRSF6	69	91.979	ENSOARG00000003117	SRSF6	54	91.979	Ovis_aries
ENSCJAG00000048403	SRSF6	99	99.627	ENSPPAG00000034327	-	78	99.627	Pan_paniscus
ENSCJAG00000048403	SRSF6	73	81.726	ENSPPAG00000043131	-	86	88.433	Pan_paniscus
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