EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCJAG00000048683 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Callithrix_jacchus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21732 bases
Position: chrNTIC01035500.1:131290489-131312220
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCJAP00000057839	Ribosomal_L37ae	PF01780.19	4e-20	1	1
ENSCJAP00000056381	Ribosomal_L37ae	PF01780.19	2.6e-13	1	1

Transcripts

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSCJAG00000048683	-	96	71.739	ENSAMEG00000020228	-	50	71.739	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000048683	-	100	100.000	ENSAMEG00000003377	-	52	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCJAG00000048683	-	100	85.417	ENSAMEG00000019756	-	52	85.417	Ailuropoda_melanoleuca
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ENSCJAG00000048683	-	100	97.917	ENSAPLG00000009836	RPL37A	52	97.917	Anas_platyrhynchos
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ENSCJAG00000048683	-	100	100.000	ENSANAG00000019149	-	52	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000048683	-	100	100.000	ENSANAG00000033950	RPL37A	52	100.000	Aotus_nancymaae
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ENSCJAG00000048683	-	68	96.154	ENSANAG00000024516	-	53	83.871	Aotus_nancymaae
ENSCJAG00000048683	-	100	100.000	ENSANAG00000006555	-	52	100.000	Aotus_nancymaae
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ENSCJAG00000048683	-	100	100.000	ENSBTAG00000051254	RPL37A	52	100.000	Bos_taurus
ENSCJAG00000048683	-	69	78.788	ENSBTAG00000051185	-	60	78.788	Bos_taurus
ENSCJAG00000048683	-	100	89.583	ENSCAFG00000024313	-	51	89.583	Canis_familiaris
ENSCJAG00000048683	-	100	50.000	ENSCAFG00000005195	-	53	50.000	Canis_familiaris
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ENSCJAG00000048683	-	100	89.583	ENSCAFG00020025594	-	52	89.583	Canis_lupus_dingo
ENSCJAG00000048683	-	100	87.500	ENSCAFG00020017929	-	70	87.500	Canis_lupus_dingo
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ENSCJAG00000048683	-	100	97.917	ENSCHIG00000004998	-	71	97.917	Capra_hircus
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