EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000000267 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: NOM1
Alias: C7orf3|PPP1R113|SGD1
Full Name: nucleolar protein with MIF4G domain 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28348 bases
Position: chrJH722039.1:13844-42191
Accession: 102028915
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000000301	MA3	PF02847.17	2.5e-24	1	1
ENSCLAP00000000301	MIF4G	PF02854.19	6.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000000329	NOM1-201	4191	XM_013509670	ENSCLAP00000000301	849 (aa)	XP_013365124	-

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000000267's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000000267's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	75.585	ENSG00000146909	NOM1	84	74.064	Homo_sapiens
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	66.292	ENSAPOG00000012073	nom1	82	58.169	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000000267	NOM1	84	67.989	ENSAMEG00000001412	NOM1	100	68.733	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000000267	NOM1	72	68.008	ENSACIG00000018050	nom1	85	57.580	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	64.916	ENSAOCG00000006229	nom1	82	57.041	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	64.916	ENSAPEG00000015994	nom1	82	57.389	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000000267	NOM1	64	64.247	ENSATEG00000005405	nom1	81	59.320	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000000267	NOM1	77	63.514	ENSAPLG00000006585	NOM1	99	63.253	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000000267	NOM1	70	64.393	ENSACAG00000011192	NOM1	84	59.916	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	66.098	ENSACLG00000000033	nom1	84	56.887	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000000267	NOM1	61	64.559	ENSAMXG00000041486	nom1	81	55.540	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	71.179	ENSBTAG00000016435	NOM1	84	70.139	Bos_taurus
ENSCLAG00000000267	NOM1	87	71.888	ENSCJAG00000004336	NOM1	83	73.343	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	70.451	ENSCAFG00020005121	NOM1	83	69.626	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	69.754	ENSCHIG00000020102	NOM1	85	70.950	Capra_hircus
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	74.352	ENSTSYG00000000227	NOM1	85	74.306	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	91.396	ENSCAPG00000016273	NOM1	100	91.396	Cavia_aperea
ENSCLAG00000000267	NOM1	84	79.888	ENSCPOG00000025538	NOM1	83	79.167	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000000267	NOM1	77	83.962	ENSCCAG00000014944	NOM1	100	84.270	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000000267	NOM1	68	71.676	ENSCPBG00000018215	NOM1	75	60.894	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000000267	NOM1	61	39.575	ENSCING00000005248	-	91	35.942	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000000267	NOM1	65	79.964	ENSCANG00000041984	NOM1	94	79.964	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	74.569	ENSCGRG00001020293	Nom1	83	74.685	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	82.739	ENSCGRG00000005405	Nom1	100	82.739	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000000267	NOM1	75	58.333	ENSCSEG00000000932	nom1	77	57.604	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	58.908	ENSCVAG00000007562	nom1	86	56.258	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000000267	NOM1	82	59.227	ENSDARG00000060027	nom1	99	67.288	Danio_rerio
ENSCLAG00000000267	NOM1	65	67.023	ENSDORG00000015682	Nom1	98	64.412	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000000267	NOM1	60	37.452	FBgn0035336	CG9004	79	34.136	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000000267	NOM1	83	55.633	ENSETEG00000003104	NOM1	83	56.821	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000000267	NOM1	50	51.972	ENSEBUG00000010077	nom1	95	51.972	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000000267	NOM1	82	75.971	ENSEASG00005001489	NOM1	84	74.895	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000000267	NOM1	67	79.115	ENSECAG00000007596	NOM1	79	73.670	Equus_caballus
ENSCLAG00000000267	NOM1	61	66.348	ENSELUG00000006266	nom1	84	55.923	Esox_lucius
ENSCLAG00000000267	NOM1	82	69.774	ENSFCAG00000006467	NOM1	85	70.845	Felis_catus
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	62.734	ENSFALG00000006904	NOM1	97	62.319	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	80.417	ENSFDAG00000016241	NOM1	88	79.673	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	66.095	ENSFHEG00000015974	nom1	82	59.416	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000000267	NOM1	61	63.127	ENSGMOG00000005129	nom1	89	55.282	Gadus_morhua
ENSCLAG00000000267	NOM1	82	62.500	ENSGALG00000006437	NOM1	79	61.938	Gallus_gallus
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	65.121	ENSGAFG00000003211	nom1	84	58.182	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	63.728	ENSGAGG00000014347	NOM1	82	63.372	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	74.708	ENSGGOG00000010920	NOM1	77	73.398	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	65.909	ENSHBUG00000014616	nom1	84	57.183	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	80.894	ENSHGLG00000007392	NOM1	87	77.297	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	80.894	ENSHGLG00100014407	NOM1	85	90.190	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	61.039	ENSIPUG00000013980	nom1	82	55.861	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000000267	NOM1	67	82.124	ENSSTOG00000031736	NOM1	99	82.124	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000000267	NOM1	58	86.094	ENSJJAG00000011716	Nom1	99	86.094	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	65.660	ENSLBEG00000009252	nom1	86	55.182	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	60.663	ENSLACG00000011777	NOM1	82	59.254	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	61.898	ENSLOCG00000012452	nom1	83	61.982	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	64.560	ENSLAFG00000007119	NOM1	85	64.315	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000000267	NOM1	83	70.083	ENSMMUG00000039033	NOM1	83	69.903	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	83.523	ENSMLEG00000037062	NOM1	99	83.523	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000000267	NOM1	84	54.817	ENSMAMG00000004118	nom1	82	56.695	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	66.098	ENSMZEG00005000384	nom1	81	58.309	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000000267	NOM1	81	63.135	ENSMGAG00000005051	NOM1	99	60.449	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	73.728	ENSMAUG00000017988	Nom1	84	75.035	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000000267	NOM1	83	73.529	ENSMICG00000017531	NOM1	85	73.109	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000000267	NOM1	87	72.995	ENSMOCG00000015962	Nom1	82	74.786	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000000267	NOM1	84	54.025	ENSMMOG00000004419	nom1	85	55.285	Mola_mola
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	77.138	ENSMODG00000005177	NOM1	81	69.679	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000000267	NOM1	75	59.545	ENSMALG00000008800	nom1	85	57.453	Monopterus_albus
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	72.841	MGP_CAROLIEiJ_G0027043	Nom1	86	70.270	Mus_caroli
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	72.981	ENSMUSG00000001569	Nom1	82	71.770	Mus_musculus
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	71.841	MGP_SPRETEiJ_G0028039	Nom1	82	72.301	Mus_spretus
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	66.618	ENSMPUG00000009745	NOM1	99	67.105	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000000267	NOM1	71	73.147	ENSMLUG00000009129	NOM1	95	75.433	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000000267	NOM1	82	57.525	ENSNBRG00000016429	nom1	94	65.970	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000000267	NOM1	87	68.072	ENSNLEG00000000238	NOM1	83	72.245	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000000267	NOM1	68	65.207	ENSMEUG00000001108	NOM1	77	62.088	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000000267	NOM1	56	67.353	ENSOPRG00000014676	NOM1	73	63.934	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000000267	NOM1	82	83.691	ENSODEG00000009399	NOM1	100	83.595	Octodon_degus
ENSCLAG00000000267	NOM1	82	57.521	ENSONIG00000005958	nom1	89	56.612	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000000267	NOM1	54	75.000	ENSOANG00000006139	-	97	75.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	60.523	ENSOCUG00000021448	-	91	61.408	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000000267	NOM1	87	73.684	ENSOCUG00000004071	-	83	74.789	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000000267	NOM1	79	57.040	ENSORLG00000010541	nom1	82	56.749	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000000267	NOM1	79	57.558	ENSORLG00020010789	nom1	89	57.475	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000000267	NOM1	79	57.122	ENSORLG00015010475	nom1	89	57.039	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000000267	NOM1	61	65.571	ENSOMEG00000004219	nom1	83	57.493	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000000267	NOM1	70	76.884	ENSOGAG00000001124	NOM1	94	78.819	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	69.465	ENSOARG00000007261	NOM1	97	70.069	Ovis_aries
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	75.328	ENSPPAG00000041374	NOM1	84	73.786	Pan_paniscus
ENSCLAG00000000267	NOM1	84	70.345	ENSPTIG00000013532	NOM1	98	70.124	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	75.328	ENSPTRG00000019917	NOM1	84	73.509	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000000267	NOM1	83	73.546	ENSPANG00000007605	NOM1	83	73.093	Papio_anubis
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	53.271	ENSPKIG00000005825	nom1	82	56.122	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000000267	NOM1	66	67.673	ENSPSIG00000017848	NOM1	89	70.732	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000000267	NOM1	82	57.606	ENSPMGG00000002577	nom1	81	59.911	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000000267	NOM1	87	72.267	ENSPEMG00000024180	Nom1	82	73.895	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	69.296	ENSPCIG00000027941	NOM1	78	69.263	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000000267	NOM1	61	66.346	ENSPFOG00000015771	nom1	85	57.420	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000000267	NOM1	61	66.284	ENSPLAG00000007856	nom1	84	58.287	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000000267	NOM1	61	65.900	ENSPMEG00000014155	nom1	81	59.496	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000000267	NOM1	80	58.129	ENSPREG00000008850	nom1	85	55.331	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000000267	NOM1	83	69.144	ENSPPYG00000018222	NOM1	83	68.428	Pongo_abelii
ENSCLAG00000000267	NOM1	57	79.630	ENSPCAG00000000440	NOM1	82	58.396	Procavia_capensis
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	81.061	ENSPCOG00000015222	NOM1	99	81.061	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000000267	NOM1	83	71.588	ENSPVAG00000014760	NOM1	84	69.824	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	64.607	ENSPNYG00000006975	nom1	96	64.607	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000000267	NOM1	61	64.054	ENSPNAG00000011085	nom1	78	55.226	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000000267	NOM1	86	67.619	ENSRNOG00000048969	AABR07059041.1	86	67.842	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000000267	NOM1	87	71.696	ENSRBIG00000037042	NOM1	83	73.157	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000000267	NOM1	87	71.429	ENSRROG00000037293	NOM1	83	72.879	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000000267	NOM1	65	30.153	YLR336C	-	54	30.400	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCLAG00000000267	NOM1	59	61.078	ENSSHAG00000002835	-	99	70.588	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000000267	NOM1	68	73.838	ENSSHAG00000017998	-	98	68.452	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000000267	NOM1	56	64.407	ENSSFOG00015003196	nom1	97	64.271	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	56.300	ENSSMAG00000011047	nom1	81	57.864	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	68.113	ENSSDUG00000006834	nom1	81	60.058	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	67.730	ENSSLDG00000021812	nom1	81	59.884	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000000267	NOM1	83	53.485	ENSSPUG00000002556	NOM1	86	75.410	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000000267	NOM1	81	63.053	ENSTGUG00000000702	-	97	61.816	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000000267	NOM1	62	65.720	ENSTRUG00000010239	nom1	81	57.245	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000000267	NOM1	82	57.123	ENSTNIG00000012783	nom1	89	54.937	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000000267	NOM1	79	73.099	ENSTTRG00000009691	NOM1	84	72.409	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000000267	NOM1	83	68.082	ENSUAMG00000025450	NOM1	83	68.681	Ursus_americanus
ENSCLAG00000000267	NOM1	83	69.437	ENSUMAG00000014275	NOM1	100	68.961	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000000267	NOM1	84	68.975	ENSVVUG00000002608	NOM1	83	69.348	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000000267	NOM1	85	56.818	ENSXETG00000021611	nom1	82	74.634	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000000267	NOM1	63	65.370	ENSXMAG00000002451	nom1	85	58.543	Xiphophorus_maculatus