EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000000582 (Gene tree)
Gene ID: 102026034
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33432 bases
Position: chrJH721978.1:4937921-4971352
Accession: 102026034
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000000732	RF-1	PF00472.20	7.8e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000000767	MTRF1-201	2109	XM_005409119	ENSCLAP00000000732	446 (aa)	XP_005409176	UPI00038F0507

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000000582	MTRF1	78	45.170	ENSCLAG00000003779	MTRF1L	92	45.170

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.650	ENSG00000120662	MTRF1	100	85.650	Homo_sapiens
ENSCLAG00000000582	MTRF1	77	58.621	ENSAPOG00000010181	mtrf1	86	58.621	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	84.081	ENSAMEG00000008696	MTRF1	100	84.081	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000000582	MTRF1	54	66.946	ENSACIG00000001495	mtrf1	96	66.946	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	86	56.555	ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.555	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000000582	MTRF1	86	55.670	ENSAPEG00000014844	mtrf1	87	55.670	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000000582	MTRF1	79	58.475	ENSATEG00000017403	mtrf1	84	58.475	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	99	64.706	ENSAPLG00000009317	MTRF1	99	64.706	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	64.781	ENSACAG00000000897	MTRF1	88	64.781	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	78.076	ENSANAG00000023063	-	100	78.076	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	79.124	ENSANAG00000025310	-	97	84.022	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	57.069	ENSACLG00000023945	mtrf1	86	57.069	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000000582	MTRF1	52	67.532	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	67.532	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	99	85.553	ENSBTAG00000012260	MTRF1	99	85.553	Bos_taurus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	83.408	ENSCJAG00000017739	MTRF1	100	89.655	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	83.445	ENSCAFG00000004795	MTRF1	100	83.445	Canis_familiaris
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	83.445	ENSCAFG00020018178	MTRF1	100	83.445	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	84.529	ENSCHIG00000011810	MTRF1	100	84.529	Capra_hircus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.426	ENSTSYG00000006976	MTRF1	100	85.426	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000000582	MTRF1	97	93.287	ENSCAPG00000013163	MTRF1	100	93.287	Cavia_aperea
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	92.825	ENSCPOG00000005264	MTRF1	100	92.825	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	83.632	ENSCCAG00000035116	MTRF1	100	83.632	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.650	ENSCATG00000009909	MTRF1	100	85.650	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.650	ENSCSAG00000017835	MTRF1	100	85.650	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	92	76.284	ENSCHOG00000011915	-	100	76.284	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000000582	MTRF1	88	68.905	ENSCPBG00000007969	MTRF1	89	68.905	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.650	ENSCANG00000040353	MTRF1	100	85.650	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	81.390	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	100	81.390	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	81.390	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	100	81.390	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000000582	MTRF1	88	55.216	ENSCSEG00000005667	mtrf1	88	55.216	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	54.404	ENSCVAG00000021729	mtrf1	89	54.404	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	52	59.402	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	59.402	Danio_rerio
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	83.259	ENSDNOG00000034196	MTRF1	100	91.290	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	99	85.169	ENSDORG00000016429	Mtrf1	100	85.169	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	80.045	ENSETEG00000014811	MTRF1	100	80.045	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000000582	MTRF1	52	57.265	ENSEBUG00000000778	mtrf1	96	57.265	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.426	ENSEASG00005015715	MTRF1	100	85.426	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	84.529	ENSECAG00000014389	MTRF1	97	84.529	Equus_caballus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	63.170	ENSEEUG00000004450	-	100	64.062	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	52.756	ENSELUG00000006544	mtrf1	88	52.756	Esox_lucius
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	82.735	ENSFCAG00000031635	MTRF1	100	82.735	Felis_catus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	89	66.416	ENSFALG00000008036	MTRF1	99	66.416	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	89.238	ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	89.238	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000000582	MTRF1	86	53.264	ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.264	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	84	52.381	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	52.381	Gadus_morhua
ENSCLAG00000000582	MTRF1	86	70.130	ENSGALG00000016951	MTRF1	84	70.130	Gallus_gallus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	54.474	ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	54.474	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000000582	MTRF1	84	56.349	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	56.349	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	70	74.760	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	74.760	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.202	ENSGGOG00000002529	MTRF1	100	85.202	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	89.910	ENSHGLG00000003210	MTRF1	100	89.910	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	90.135	ENSHGLG00100011843	MTRF1	100	90.135	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000000582	MTRF1	86	54.450	ENSHCOG00000009449	mtrf1	86	54.450	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.874	ENSSTOG00000021682	MTRF1	100	85.874	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	82.735	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	100	82.735	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	86	55.584	ENSKMAG00000003231	mtrf1	85	55.584	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	52	66.379	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	66.379	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000000582	MTRF1	52	66.379	ENSLBEG00000027169	-	93	66.379	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000000582	MTRF1	97	61.379	ENSLACG00000010582	MTRF1	97	62.385	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000000582	MTRF1	89	57.468	ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.468	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	82.063	ENSLAFG00000022177	-	100	82.063	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000000582	MTRF1	99	68.326	ENSLAFG00000030499	-	99	68.326	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.650	ENSMFAG00000037972	MTRF1	100	85.650	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.874	ENSMNEG00000035487	MTRF1	100	85.874	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.650	ENSMLEG00000033582	MTRF1	100	85.650	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	83	57.796	ENSMAMG00000022048	mtrf1	83	57.796	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	57.069	ENSMZEG00005017922	mtrf1	86	57.069	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000000582	MTRF1	86	69.792	ENSMGAG00000014971	MTRF1	92	69.792	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	81.614	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	100	81.614	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.874	ENSMICG00000033131	MTRF1	100	85.874	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	78.924	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	100	78.924	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000000582	MTRF1	51	59.389	ENSMMOG00000013394	mtrf1	94	59.389	Mola_mola
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	70.470	ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.470	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	56.201	ENSMALG00000013274	mtrf1	87	56.201	Monopterus_albus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	79.372	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	99	79.372	Mus_caroli
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	81.166	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	100	81.166	Mus_musculus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	79.821	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	100	79.821	Mus_pahari
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	80.045	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	100	80.045	Mus_spretus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	99	82.883	ENSMPUG00000001874	MTRF1	99	82.883	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	84.305	ENSMLUG00000017237	MTRF1	100	84.305	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	84.305	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	100	84.305	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000000582	MTRF1	51	67.686	ENSNBRG00000004634	mtrf1	97	67.686	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.202	ENSNLEG00000001236	MTRF1	100	85.202	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	64.430	ENSMEUG00000001846	MTRF1	100	64.430	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000000582	MTRF1	74	54.545	ENSOPRG00000006450	-	100	54.545	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	90.583	ENSODEG00000005782	MTRF1	100	90.583	Octodon_degus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	56.812	ENSONIG00000012476	mtrf1	100	56.812	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	70	71.019	ENSOANG00000003383	-	99	71.019	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	83.632	ENSOCUG00000025207	MTRF1	100	83.632	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	56.283	ENSORLG00000003225	mtrf1	87	56.283	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	56.545	ENSORLG00020021048	mtrf1	86	56.545	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	56.021	ENSORLG00015020957	mtrf1	87	56.021	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	57.743	ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.743	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000000582	MTRF1	73	77.914	ENSOGAG00000026411	-	100	77.914	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	80.942	ENSOGAG00000009719	-	100	80.942	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	84.529	ENSOARG00000006994	MTRF1	100	84.529	Ovis_aries
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.650	ENSPPAG00000000050	MTRF1	100	85.650	Pan_paniscus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	83.632	ENSPPRG00000009511	MTRF1	100	83.632	Panthera_pardus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	84.081	ENSPTIG00000006673	MTRF1	100	84.081	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.650	ENSPTRG00000005815	MTRF1	100	85.650	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	85.874	ENSPANG00000010809	MTRF1	100	85.874	Papio_anubis
ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	55.145	ENSPKIG00000015711	mtrf1	89	55.145	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	69.588	ENSPSIG00000004773	MTRF1	86	69.588	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000000582	MTRF1	53	66.949	ENSPMGG00000006724	mtrf1	96	66.949	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	81.879	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	100	81.879	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000000582	MTRF1	76	51.445	ENSPMAG00000009849	mtrf1	99	51.734	Petromyzon_marinus
ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	69.333	ENSPCIG00000012940	MTRF1	100	69.333	Phascolarctos_cinereus
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