EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000002058 (Gene tree)
Gene ID: 102026424
Gene Symbol: PPARGC1A
Alias: PGC-1alpha|PGC1|PGC1A|PPARGC1
Full Name: PPARG coactivator 1 alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 110114 bases
Position: chrJH721940.1:1078322-1188435
Accession: 102026424
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSCLAP00000002859	RRM_1	PF00076.22	2.1e-07	1	1

Transcripts

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ENSCLAT00000002917	PPARGC1A-203	2088	-	ENSCLAP00000002860	695 (aa)	-	-

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Paralogs

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ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	66	49.630	ENSCLAG00000015452	PPARGC1B	51	49.630

Orthologs

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ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	58	51.042	ENSG00000155846	PPARGC1B	52	48.052	Homo_sapiens
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.865	ENSG00000109819	PPARGC1A	99	97.015	Homo_sapiens
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	72	79.581	ENSAPOG00000018632	ppargc1a	100	56.169	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	94.598	ENSAMEG00000010421	PPARGC1A	100	94.598	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	72	80.105	ENSAOCG00000006754	ppargc1a	100	56.235	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	73	70.954	ENSATEG00000016702	ppargc1a	100	55.451	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	88.065	ENSAPLG00000005303	PPARGC1A	100	88.065	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	82.707	ENSACAG00000000741	PPARGC1A	100	82.707	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	69	49.265	ENSACAG00000015737	PPARGC1B	50	49.265	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	58	51.042	ENSANAG00000021830	PPARGC1B	52	48.052	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.614	ENSANAG00000035930	PPARGC1A	100	95.614	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	70	76.963	ENSACLG00000001002	ppargc1a	86	72.124	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	96	70.435	ENSAMXG00000002461	ppargc1a	99	55.779	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	92.472	ENSBTAG00000017024	PPARGC1A	100	93.225	Bos_taurus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.238	ENSCJAG00000013024	PPARGC1A	100	95.238	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	94.849	ENSCAFG00000016519	PPARGC1A	100	94.849	Canis_familiaris
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	70	46.753	ENSCAFG00000018275	PPARGC1B	54	46.753	Canis_familiaris
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	97	94.819	ENSCAFG00020027242	PPARGC1A	99	94.819	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	57	48.980	ENSCAFG00020023524	PPARGC1B	52	46.753	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	57	47.826	ENSCHIG00000004409	PPARGC1B	52	47.794	Capra_hircus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	93.350	ENSCHIG00000015991	PPARGC1A	100	93.350	Capra_hircus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	66	48.092	ENSTSYG00000034354	PPARGC1B	58	48.092	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	96.366	ENSTSYG00000010439	PPARGC1A	100	96.366	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	97	93.498	ENSCAPG00000005150	PPARGC1A	96	93.498	Cavia_aperea
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	57	49.020	ENSCPOG00000001958	PPARGC1B	51	48.120	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	96.985	ENSCPOG00000001518	PPARGC1A	100	96.985	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.238	ENSCCAG00000024681	PPARGC1A	100	95.238	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.849	ENSCATG00000032575	PPARGC1A	100	95.849	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	70	47.403	ENSCATG00000030402	PPARGC1B	53	47.403	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	58	51.042	ENSCSAG00000011792	PPARGC1B	55	51.908	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.739	ENSCSAG00000016575	PPARGC1A	100	95.739	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	58	50.000	ENSCANG00000037487	PPARGC1B	51	51.908	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.614	ENSCANG00000033426	PPARGC1A	100	95.614	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	59	52.128	ENSCGRG00001017949	Ppargc1b	57	46.104	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	93.844	ENSCGRG00001015534	Ppargc1a	100	93.844	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	57	52.128	ENSCGRG00000008387	Ppargc1b	57	48.905	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	93.844	ENSCGRG00000000200	Ppargc1a	100	93.844	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	91	76.410	ENSCSEG00000006884	ppargc1a	79	81.098	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	70	47.193	ENSCVAG00000016547	ppargc1a	73	47.734	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	88	78.652	ENSDARG00000067829	ppargc1a	91	80.488	Danio_rerio
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	94.724	ENSDNOG00000041106	PPARGC1A	100	94.724	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	99	94.656	ENSDORG00000016276	Ppargc1a	99	94.656	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.729	ENSEASG00005007984	PPARGC1A	100	95.729	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	58	50.735	ENSEASG00005002826	PPARGC1B	51	50.735	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	99	95.414	ENSECAG00000009164	PPARGC1A	98	95.414	Equus_caballus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	98	89.885	ENSEEUG00000009219	PPARGC1A	100	92.318	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	51.394	ENSELUG00000017027	ppargc1a	100	51.390	Esox_lucius
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ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	98	86.300	ENSFALG00000009211	PPARGC1A	99	86.300	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	55	49.505	ENSFDAG00000008719	PPARGC1B	53	48.855	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	96.106	ENSFDAG00000005659	PPARGC1A	100	96.106	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	53	74.211	ENSFHEG00000021990	ppargc1a	100	52.061	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	87.563	ENSGALG00000042851	PPARGC1A	100	87.563	Gallus_gallus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	53	74.490	ENSGAFG00000015514	ppargc1a	100	53.873	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	99	84.528	ENSGAGG00000007043	PPARGC1A	100	85.248	Gopherus_agassizii
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ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	58	51.042	ENSGGOG00000009505	PPARGC1B	53	48.052	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	87	81.212	ENSHBUG00000005269	ppargc1a	99	88.525	Haplochromis_burtoni
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ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	54	50.562	ENSHGLG00000005967	PPARGC1B	53	48.889	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	96.985	ENSHGLG00100000133	PPARGC1A	100	96.985	Heterocephalus_glaber_male
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ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	95	72.414	ENSLBEG00000019562	ppargc1a	85	72.414	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	71.339	ENSLACG00000014054	PPARGC1A	99	71.556	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	89	36.735	ENSLACG00000011232	PPARGC1B	53	47.619	Latimeria_chalumnae
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ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.489	ENSMFAG00000000534	PPARGC1A	100	95.489	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	58	51.042	ENSMMUG00000004749	PPARGC1B	53	47.403	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.614	ENSMMUG00000001844	PPARGC1A	100	95.614	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.723	ENSMNEG00000028682	PPARGC1A	100	95.723	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	58	51.042	ENSMNEG00000034121	PPARGC1B	53	47.403	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	58	51.042	ENSMLEG00000040973	PPARGC1B	54	47.403	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.739	ENSMLEG00000034233	PPARGC1A	100	95.739	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	96	71.784	ENSMAMG00000005531	ppargc1a	100	53.015	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	72	76.963	ENSMZEG00005001739	ppargc1a	70	71.369	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	87.437	ENSMGAG00000012485	PPARGC1A	100	87.437	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	93.719	ENSMAUG00000011811	Ppargc1a	100	93.719	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	71	47.403	ENSMAUG00000014191	Ppargc1b	53	47.403	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	95.865	ENSMICG00000015390	PPARGC1A	100	95.865	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	57	51.020	ENSMICG00000002702	PPARGC1B	54	47.403	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	93.593	ENSMOCG00000008765	Ppargc1a	100	93.593	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	71	44.805	ENSMOCG00000014885	Ppargc1b	55	44.805	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	88	82.424	ENSMMOG00000011847	ppargc1a	98	82.317	Mola_mola
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	90.327	ENSMODG00000000549	PPARGC1A	100	90.327	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	92	71.784	ENSMALG00000004625	ppargc1a	93	71.784	Monopterus_albus
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ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	93.216	MGP_CAROLIEiJ_G0027213	Ppargc1a	100	93.216	Mus_caroli
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	93.350	ENSMUSG00000029167	Ppargc1a	100	93.350	Mus_musculus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	55	52.128	ENSMUSG00000033871	Ppargc1b	53	44.156	Mus_musculus
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	57	51.064	MGP_PahariEiJ_G0019053	Ppargc1b	54	44.156	Mus_pahari
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ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	100	74.497	ENSXETG00000020468	ppargc1a	100	72.236	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	78	45.856	ENSXETG00000012711	ppargc1b	58	46.250	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000002058	PPARGC1A	50	78.313	ENSXCOG00000004835	ppargc1a	95	78.049	Xiphophorus_couchianus
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