EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000002487 (Gene tree)
Gene ID: 102015311
Gene Symbol: ACO1
Alias: IREB1|IREBP|IRP1
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29703 bases
Position: chrJH721932.1:3141257-3170959
Accession: 102015311
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000003480	Aconitase	PF00330.20	2.1e-182	1	1
ENSCLAP00000003480	Aconitase_C	PF00694.19	1.4e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000003551	ACO1-201	3628	XM_013522946	ENSCLAP00000003480	889 (aa)	XP_013378400	UPI00038EEC6A

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000002487's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000002487's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	63.636	ENSCLAG00000008985	IREB2	91	63.636

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.238	ENSG00000122729	ACO1	100	92.238	Homo_sapiens
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.765	ENSAPOG00000008670	aco1	99	80.765	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.236	ENSAMEG00000003746	ACO1	100	91.236	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.990	ENSACIG00000014377	aco1	99	80.990	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	81.215	ENSAOCG00000007699	aco1	99	81.215	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	81.102	ENSAPEG00000014370	aco1	99	81.102	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.982	ENSATEG00000000560	aco1	99	81.982	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	86.937	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	86.937	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000002487	ACO1	97	85.930	ENSACAG00000001541	ACO1	99	85.930	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	91.104	ENSANAG00000003359	ACO1	99	91.104	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.877	ENSACLG00000007755	aco1	99	80.877	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.757	ENSAMXG00000002499	aco1	99	81.757	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.789	ENSBTAG00000000555	ACO1	100	91.789	Bos_taurus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.564	ENSCJAG00000007687	ACO1	100	91.564	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.348	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	91.348	Canis_familiaris
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.451	ENSCAFG00020014553	ACO1	100	91.451	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.901	ENSCHIG00000007667	ACO1	100	91.901	Capra_hircus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.238	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	92.238	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	75.393	ENSCAPG00000007254	ACO1	100	75.281	Cavia_aperea
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	93.701	ENSCPOG00000003768	ACO1	100	93.701	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.451	ENSCCAG00000022465	ACO1	100	91.451	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.676	ENSCATG00000045333	ACO1	100	91.676	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.564	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	91.564	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000002487	ACO1	90	73.244	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	73.123	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	86.712	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	86.712	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.564	ENSCANG00000014847	ACO1	100	91.564	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.801	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	92.801	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.901	ENSCGRG00000004877	-	100	91.901	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	77.452	ENSCSEG00000018262	aco1	99	77.452	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	74.859	ENSCVAG00000020264	aco1	99	74.859	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	81.890	ENSDARG00000026376	aco1	99	81.890	Danio_rerio
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.013	ENSDNOG00000003951	ACO1	100	92.013	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.789	ENSDORG00000014246	Aco1	100	91.789	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000002487	ACO1	86	71.958	ENSETEG00000012415	-	85	71.958	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	56.917	ENSEBUG00000015441	aco1	97	56.917	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.238	ENSEASG00005004602	ACO1	100	92.238	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.126	ENSECAG00000014846	ACO1	100	92.126	Equus_caballus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.202	ENSEEUG00000015174	ACO1	100	80.202	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.765	ENSELUG00000016812	aco1	97	80.765	Esox_lucius
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.564	ENSFCAG00000001293	ACO1	100	91.564	Felis_catus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	86.824	ENSFALG00000001167	ACO1	99	86.824	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	93.701	ENSFDAG00000016058	ACO1	100	93.701	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.060	ENSFHEG00000005619	aco1	99	81.060	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	77.878	ENSGMOG00000005514	aco1	99	77.878	Gadus_morhua
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	87.162	ENSGALG00000002162	ACO1	99	87.162	Gallus_gallus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.315	ENSGACG00000001637	aco1	99	80.315	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	86.599	ENSGAGG00000023315	ACO1	100	86.502	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.013	ENSGGOG00000016306	ACO1	100	92.013	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.765	ENSHBUG00000008952	aco1	99	80.765	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	94.376	ENSHGLG00000018922	Aco1	100	94.376	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	94.376	ENSHGLG00100000149	Aco1	100	94.376	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	78.016	ENSHCOG00000015881	aco1	99	78.016	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	81.327	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.327	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	93.026	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	93.026	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.238	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	92.238	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	80.518	ENSKMAG00000015759	aco1	99	80.518	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	76.854	ENSLBEG00000013866	aco1	99	76.854	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000002487	ACO1	75	72.849	ENSLACG00000000936	ACO1	99	72.836	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	83.015	ENSLOCG00000011082	aco1	99	83.015	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.001	ENSLAFG00000013470	ACO1	100	91.001	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.789	ENSMFAG00000001702	ACO1	100	91.789	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.901	ENSMMUG00000008196	ACO1	100	91.901	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.676	ENSMNEG00000045040	ACO1	100	91.676	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.789	ENSMLEG00000005636	ACO1	100	91.789	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	82.002	ENSMAMG00000002915	aco1	99	82.002	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	77.380	ENSMZEG00005012733	aco1	99	77.044	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	71.429	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	71.429	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.238	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	92.238	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.901	ENSMICG00000006540	ACO1	100	91.901	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	93.251	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	93.251	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.202	ENSMMOG00000020282	aco1	99	80.202	Mola_mola
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	88.526	ENSMODG00000004463	ACO1	100	88.526	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	81.215	ENSMALG00000019764	aco1	99	81.215	Monopterus_albus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.013	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	100	92.013	Mus_caroli
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.901	ENSMUSG00000028405	Aco1	100	91.901	Mus_musculus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.463	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.463	Mus_pahari
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.351	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.351	Mus_spretus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.901	ENSMPUG00000004340	ACO1	100	91.901	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	90.101	ENSMLUG00000003029	ACO1	100	90.101	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.688	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	92.688	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	62.752	ENSNBRG00000008973	aco1	99	62.975	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.789	ENSNLEG00000003409	ACO1	100	91.789	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000002487	ACO1	90	81.549	ENSMEUG00000014756	ACO1	90	81.549	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	88.976	ENSOPRG00000016791	ACO1	100	88.976	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	93.588	ENSODEG00000001240	-	100	93.588	Octodon_degus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	90.889	ENSODEG00000015432	-	100	90.439	Octodon_degus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.540	ENSONIG00000019869	aco1	99	80.540	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000002487	ACO1	81	89.765	ENSOANG00000012132	ACO1	100	89.765	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	90.879	ENSOCUG00000015960	ACO1	100	90.656	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.644	ENSORLG00000020656	aco1	99	81.644	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.419	ENSORLG00020010991	aco1	99	81.419	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.532	ENSORLG00015011785	aco1	99	81.532	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	79.797	ENSOMEG00000000660	aco1	99	79.797	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.451	ENSOGAG00000010522	ACO1	100	91.451	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.901	ENSOARG00000014707	ACO1	98	91.901	Ovis_aries
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.238	ENSPPAG00000033498	ACO1	100	92.238	Pan_paniscus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.451	ENSPPRG00000009875	ACO1	100	91.451	Panthera_pardus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.339	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	91.339	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.238	ENSPTRG00000020843	ACO1	100	92.238	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.789	ENSPANG00000025270	ACO1	100	91.789	Papio_anubis
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	79.978	ENSPKIG00000023168	aco1	99	79.978	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	87.275	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	87.275	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.511	ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.511	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.576	ENSPEMG00000018464	Aco1	100	92.576	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	88.189	ENSPCIG00000029321	ACO1	100	88.429	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	80.045	ENSPFOG00000013405	aco1	99	80.045	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000002487	ACO1	90	81.250	ENSPLAG00000023422	aco1	98	81.250	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000002487	ACO1	90	81.172	ENSPMEG00000011800	aco1	98	81.172	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	80.271	ENSPREG00000021791	aco1	99	80.271	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.013	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	92.013	Pongo_abelii
ENSCLAG00000002487	ACO1	78	90.566	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	90.566	Procavia_capensis
ENSCLAG00000002487	ACO1	89	91.519	ENSPCOG00000021198	ACO1	100	91.519	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000002487	ACO1	96	86.550	ENSPVAG00000002372	ACO1	99	86.550	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.765	ENSPNYG00000009425	aco1	99	80.765	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	82.227	ENSPNAG00000017918	aco1	100	82.227	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.463	ENSRNOG00000005849	Aco1	100	92.463	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.564	ENSRBIG00000034592	ACO1	100	91.564	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.676	ENSRROG00000042672	ACO1	100	91.676	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.676	ENSSBOG00000026008	ACO1	100	91.676	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	88.539	ENSSHAG00000008924	ACO1	100	88.539	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	81.440	ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.440	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000002487	ACO1	75	82.388	ENSSMAG00000018908	aco1	80	82.282	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.623	ENSSDUG00000002984	aco1	99	81.623	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.962	ENSSLDG00000013952	aco1	99	81.962	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000002487	ACO1	96	89.123	ENSSARG00000008437	ACO1	99	89.123	Sorex_araneus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	85.344	ENSSPUG00000002916	ACO1	99	85.344	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	81.552	ENSSPAG00000019147	aco1	99	81.552	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.351	ENSSSCG00000023807	ACO1	100	92.351	Sus_scrofa
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	86.486	ENSTGUG00000001505	ACO1	99	86.486	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	80.813	ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.700	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	78.442	ENSTNIG00000005288	aco1	99	78.442	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	87.964	ENSTBEG00000012369	ACO1	100	87.964	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.126	ENSTTRG00000016991	ACO1	99	92.126	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.451	ENSUAMG00000020699	ACO1	100	91.451	Ursus_americanus
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.451	ENSUMAG00000005807	ACO1	100	91.451	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000002487	ACO1	96	91.667	ENSVPAG00000009876	ACO1	100	91.667	Vicugna_pacos
ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.226	ENSVVUG00000021152	ACO1	91	91.226	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	83.708	ENSXETG00000009184	aco1	99	83.708	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000002487	ACO1	50	79.819	ENSXCOG00000005638	aco1	96	79.819	Xiphophorus_couchianus
ENSCLAG00000002487	ACO1	99	80.383	ENSXMAG00000023603	aco1	99	80.383	Xiphophorus_maculatus