EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000002718 (Gene tree)
Gene ID: 102013092
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14416 bases
Position: chrJH721949.1:8607629-8622044
Accession: 102013092
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000003819	RRM_1	PF00076.22	4.7e-17	1	2
ENSCLAP00000003819	RRM_1	PF00076.22	4.7e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000003896	HTATSF1-202	804	-	ENSCLAP00000003820	190 (aa)	-	-
ENSCLAT00000003895	HTATSF1-201	2744	XM_005404589	ENSCLAP00000003819	755 (aa)	XP_005404646	UPI00038ECED3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.556	ENSG00000102241	HTATSF1	100	87.295	Homo_sapiens
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.386	ENSAPOG00000009823	htatsf1	90	60.386	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	73.806	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	100	72.123	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	52	60.145	ENSACIG00000020459	htatsf1	90	59.762	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	57.692	ENSATEG00000008903	htatsf1	92	57.692	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	93	73.913	ENSANAG00000025458	-	99	72.511	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	95	65.427	ENSANAG00000027986	-	96	64.463	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.664	ENSACLG00000008096	htatsf1	90	60.664	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	70.909	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	99	71.722	Bos_taurus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	66.446	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	99	68.676	Bos_taurus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	70.909	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	99	71.722	Bos_taurus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	74.770	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	99	73.001	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	75.198	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	99	73.560	Canis_familiaris
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	73.969	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	99	72.379	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	71.883	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	99	73.325	Capra_hircus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	77.219	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	99	77.165	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	75.889	ENSCCAG00000022701	-	99	75.099	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	71.900	ENSCCAG00000025329	-	99	72.032	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.361	ENSCATG00000029963	HTATSF1	99	75.558	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.494	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	99	75.690	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.361	ENSCANG00000028495	HTATSF1	99	75.558	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	81	75.559	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	99	71.338	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	72	68.739	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	65.512	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	71.597	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	100	72.114	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	64	49.795	ENSETEG00000006377	-	67	49.898	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	50	50.617	ENSEBUG00000001534	htatsf1	80	50.864	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	81	77.251	ENSEASG00005003440	HTATSF1	99	74.198	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	81	77.251	ENSECAG00000009156	HTATSF1	99	74.198	Equus_caballus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	62.173	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	100	62.629	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	73.657	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	99	72.739	Felis_catus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	77.778	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	78.010	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	52	61.611	ENSFHEG00000020286	htatsf1	94	61.502	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.190	ENSGAFG00000003041	htatsf1	91	60.190	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.689	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	100	75.885	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.664	ENSHBUG00000004392	htatsf1	90	60.664	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	81.233	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	99	80.921	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.842	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	99	77.937	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	51	60.890	ENSKMAG00000007622	htatsf1	91	60.714	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	51	42.822	ENSLOCG00000015118	htatsf1	85	42.432	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	86	72.154	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	65.921	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.228	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	99	75.427	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.361	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	99	75.427	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	71.846	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	99	69.089	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.361	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	99	76.347	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.664	ENSMZEG00005000485	htatsf1	90	60.664	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	71.056	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	71.186	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.649	ENSMICG00000009348	HTATSF1	99	76.649	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	71.206	ENSMOCG00000023007	-	99	71.005	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	69.588	ENSMOCG00000022370	-	96	68.386	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	51	61.881	ENSMMOG00000011013	htatsf1	88	61.881	Mola_mola
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	52	70.051	ENSMODG00000014087	-	86	70.051	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	51	58.867	ENSMALG00000019977	htatsf1	88	58.867	Monopterus_albus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	69.792	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	69.221	Mus_caroli
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	71.277	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	99	69.948	Mus_musculus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	71.277	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	99	69.948	Mus_spretus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	100	72.762	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	100	71.739	Mustela_putorius_furo
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ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	68.930	ENSMLUG00000028418	-	99	67.270	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	75.134	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	75.526	Nannospalax_galili
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ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.664	ENSONIG00000008638	htatsf1	90	60.664	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	75.326	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	100	74.674	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	74.533	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	100	74.379	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	70.519	ENSOARG00000011215	-	99	71.943	Ovis_aries
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	67.788	ENSOARG00000000481	-	99	68.088	Ovis_aries
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.556	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	100	75.754	Pan_paniscus
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ENSCLAG00000002718	HTATSF1	93	73.870	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	72.881	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.556	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	100	75.754	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	65.073	ENSPANG00000010946	HTATSF1	99	63.732	Papio_anubis
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	61.137	ENSPMGG00000006172	htatsf1	92	60.664	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	71.429	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	71.822	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSCLAG00000002718	HTATSF1	52	67.662	ENSPCIG00000030173	-	92	67.662	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	61.374	ENSPFOG00000007871	htatsf1	89	60.900	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.900	ENSPLAG00000007532	htatsf1	92	60.427	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	61.374	ENSPMEG00000000352	htatsf1	92	60.900	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	61.374	ENSPREG00000007811	htatsf1	92	60.900	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	82	79.645	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	85	78.471	Pongo_abelii
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	62.450	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	99	62.895	Procavia_capensis
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	77.939	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	99	77.939	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	70.173	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	65.662	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.849	ENSPNYG00000016693	htatsf1	90	60.849	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	81	75.439	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	100	69.860	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	66.135	ENSRBIG00000035486	HTATSF1	99	65.046	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	76.361	ENSRROG00000021939	HTATSF1	99	75.558	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	75.729	ENSSBOG00000027186	-	99	75.033	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	72.559	ENSSBOG00000017914	-	99	71.108	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	51	69.036	ENSSHAG00000018908	-	87	69.036	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	50	70.000	ENSSHAG00000006440	-	97	70.000	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	50	63.780	ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.780	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	58.234	ENSSLDG00000016880	htatsf1	91	58.473	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	61.333	ENSSARG00000005193	HTATSF1	98	60.662	Sorex_araneus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	50	68.217	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	82	69.211	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	50	62.087	ENSSPAG00000000732	htatsf1	90	59.569	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	67.062	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	67.484	Sus_scrofa
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.570	ENSTNIG00000016140	htatsf1	90	61.205	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	85	67.233	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	96	67.252	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	100	74.084	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	100	73.987	Ursus_americanus
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ENSCLAG00000002718	HTATSF1	91	68.777	ENSVPAG00000004569	HTATSF1	100	67.932	Vicugna_pacos
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	73.582	ENSVVUG00000024802	HTATSF1	99	71.995	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	61.916	ENSXCOG00000006912	htatsf1	93	61.916	Xiphophorus_couchianus
ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	62.136	ENSXMAG00000000490	htatsf1	92	62.136	Xiphophorus_maculatus