EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000002810 (Gene tree)
Gene ID: 102026890
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12322 bases
Position: chrJH721961.1:4784266-4796587
Accession: 102026890
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000003946	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000004025	SRPRB-201	1951	XM_005406808	ENSCLAP00000003946	271 (aa)	XP_005406865	UPI00038EB1A5

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000002810's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000002810's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000002810	SRPRB	54	30.137	ENSCLAG00000017139	-	74	30.137

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.882	ENSG00000144867	SRPRB	99	94.969	Homo_sapiens
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.668	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	89.668	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.930	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	88.930	Bos_taurus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.668	ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.668	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.930	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	88.930	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	87.823	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	87.823	Capra_hircus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	87.823	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	87.823	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.930	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	88.930	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	87.823	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	87.823	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.513	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	91.513	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.513	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	91.513	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	82.657	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	82.657	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	74.908	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	74.908	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	90.037	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	90.037	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000002810	SRPRB	94	91.406	ENSCGRG00000014367	Srprb	98	91.406	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	87.085	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	87.085	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	90	81.569	ENSDORG00000000764	Srprb	85	89.908	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.668	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	89.668	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.668	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	89.668	Equus_caballus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.192	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	88.192	Felis_catus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	93.358	ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	93.358	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.882	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	91.882	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	95.572	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	95.572	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	95.572	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	95.572	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	85.240	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	85.240	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.513	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	91.513	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.513	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	91.513	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.513	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	91.513	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.513	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	91.513	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	90.406	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	90.406	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.513	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	91.513	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	97	83.588	ENSMODG00000018493	SRPRB	98	83.588	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.930	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	88.930	Mus_caroli
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.561	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	88.561	Mus_musculus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.668	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	89.668	Mus_pahari
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.299	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	89.299	Mus_spretus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	87.454	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	87.454	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.668	ENSNGAG00000024311	-	100	89.668	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	90.775	ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.775	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	95.941	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	95.941	Octodon_degus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.668	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	89.668	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	90.775	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	90.775	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000002810	SRPRB	86	86.638	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	90.367	Ovis_aries
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.882	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	91.882	Pan_paniscus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.192	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	88.192	Panthera_pardus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.192	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	88.192	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.882	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	91.882	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.144	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	91.144	Papio_anubis
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	90.406	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	90.406	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	92.620	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	92.620	Pongo_abelii
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	80.812	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	80.812	Procavia_capensis
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.561	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	88.561	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.144	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	91.144	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	91.144	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	91.144	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000002810	SRPRB	74	88.060	ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	87.085	ENSSARG00000012943	SRPRB	100	87.085	Sorex_araneus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.299	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	89.299	Sus_scrofa
ENSCLAG00000002810	SRPRB	93	88.538	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.015	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	81.550	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	81.550	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	88.192	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	88.192	Ursus_americanus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	87.823	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	87.823	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.299	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	89.299	Vulpes_vulpes