EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000002914 (Gene tree)
Gene ID: 102007936
Gene Symbol: IPO13
Alias: IMP13|KIAA0724|RANBP13
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21687 bases
Position: chrJH721997.1:3472866-3494552
Accession: 102007936
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000004081	Xpo1	PF08389.12	6.7e-28	1	1
ENSCLAP00000004081	IBN_N	PF03810.19	4.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000004162	IPO13-201	3724	XM_005410689	ENSCLAP00000004081	963 (aa)	XP_005410746	UPI00038EBB3E

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.377	ENSG00000117408	IPO13	100	99.377	Homo_sapiens
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	66.701	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	66.841	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.656	ENSAPOG00000003308	ipo13	99	81.962	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.858	ENSAMEG00000001123	IPO13	100	98.858	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000002914	IPO13	97	66.878	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	66.878	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000002914	IPO13	95	77.972	ENSACIG00000008146	ipo13	100	77.972	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	65.765	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	98	65.900	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.447	ENSAOCG00000004943	ipo13	99	81.751	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.447	ENSAPEG00000011282	ipo13	99	81.751	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	65.869	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	98	66.004	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.237	ENSATEG00000018367	ipo13	99	81.540	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000002914	IPO13	97	65.217	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	65.217	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	88.797	ENSAPLG00000001349	IPO13	100	88.797	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	88.162	ENSACAG00000014300	IPO13	99	89.312	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.962	ENSANAG00000034183	IPO13	100	98.962	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000002914	IPO13	95	80.911	ENSACLG00000011458	ipo13	100	80.911	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	67.286	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	67.678	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000002914	IPO13	98	60.064	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	60.064	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	82.027	ENSAMXG00000005200	ipo13	98	82.664	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.442	ENSBTAG00000018887	IPO13	100	98.442	Bos_taurus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.962	ENSCJAG00000007453	IPO13	100	98.962	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.962	ENSCAFG00000004875	IPO13	100	98.962	Canis_familiaris
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.962	ENSCAFG00020017359	IPO13	100	98.962	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.546	ENSCHIG00000008341	IPO13	100	98.546	Capra_hircus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.858	ENSTSYG00000035980	IPO13	100	98.858	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000002914	IPO13	85	99.792	ENSCAPG00000001972	IPO13	98	97.600	Cavia_aperea
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	99.370	ENSCPOG00000012445	IPO13	99	99.370	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.858	ENSCCAG00000022035	IPO13	100	98.858	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.377	ENSCATG00000041276	IPO13	100	99.377	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.377	ENSCSAG00000001190	IPO13	100	99.377	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000002914	IPO13	95	90.263	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	90.263	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000002914	IPO13	98	37.722	ENSCING00000001863	-	99	37.722	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000002914	IPO13	97	35.887	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.097	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.273	ENSCANG00000009091	IPO13	100	99.273	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.339	ENSCGRG00001021177	Ipo13	100	98.339	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.339	ENSCGRG00000012411	Ipo13	100	98.339	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	79.396	ENSCSEG00000007713	ipo13	99	80.063	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	60.372	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	98	60.856	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.061	ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.751	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000002914	IPO13	95	63.391	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	99	63.391	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000002914	IPO13	98	82.489	ENSDARG00000060618	ipo13	99	82.558	Danio_rerio
ENSCLAG00000002914	IPO13	98	62.302	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	62.328	Danio_rerio
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.065	ENSDNOG00000016583	IPO13	100	99.065	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.273	ENSDORG00000005471	Ipo13	100	99.273	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000002914	IPO13	98	67.050	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.234	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.650	ENSEASG00005001738	IPO13	100	98.650	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.650	ENSECAG00000015508	IPO13	100	98.650	Equus_caballus
ENSCLAG00000002914	IPO13	69	98.667	ENSEEUG00000011681	IPO13	83	98.667	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.132	ENSELUG00000001498	ipo13	99	81.435	Esox_lucius
ENSCLAG00000002914	IPO13	98	63.420	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	98	63.382	Esox_lucius
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.858	ENSFCAG00000006488	IPO13	100	98.858	Felis_catus
ENSCLAG00000002914	IPO13	95	90.044	ENSFALG00000005368	IPO13	100	90.044	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.481	ENSFDAG00000015599	IPO13	100	99.481	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	64.730	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	98	64.885	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.002	ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.540	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000002914	IPO13	99	56.934	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	98	57.263	Gadus_morhua
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ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.270	ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.857	Gambusia_affinis
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ENSCLAG00000002914	IPO13	99	64.803	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	98	65.510	Gasterosteus_aculeatus
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ENSCLAG00000002914	IPO13	99	80.853	ENSHBUG00000018605	ipo13	99	81.435	Haplochromis_burtoni
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ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.169	ENSHGLG00100015830	IPO13	100	99.169	Heterocephalus_glaber_male
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ENSCLAG00000002914	IPO13	99	80.733	ENSIPUG00000011283	IPO13	98	81.395	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.273	ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.273	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000002914	IPO13	100	98.962	ENSJJAG00000018591	Ipo13	100	98.962	Jaculus_jaculus
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ENSCLAG00000002914	IPO13	99	66.149	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	98	66.632	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000002914	IPO13	98	64.346	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	99	64.346	Labrus_bergylta
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ENSCLAG00000002914	IPO13	97	79.533	ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.533	Latimeria_chalumnae
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ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.377	ENSMMUG00000015142	IPO13	100	99.377	Macaca_mulatta
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ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.377	ENSMLEG00000044330	IPO13	100	99.377	Mandrillus_leucophaeus
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