EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000003222 (Gene tree)
Gene ID: 102020245
Gene Symbol: FTSJ3
Alias: SPB1
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6829 bases
Position: chrJH721938.1:8002263-8009091
Accession: 102020245
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000004530	FtsJ	PF01728.19	3.7e-56	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000004615	FTSJ3-201	3243	XM_005402186	ENSCLAP00000004530	837 (aa)	XP_005402243	UPI00038EC28A

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000003222's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000003222's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.144	ENSG00000108592	FTSJ3	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	72	69.250	ENSAPOG00000005543	ftsj3	82	69.598	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	89.367	ENSAMEG00000003148	FTSJ3	98	88.835	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	63	59.524	ENSACIG00000012880	ftsj3	67	59.158	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	59.765	ENSAOCG00000023196	ftsj3	96	60.595	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	60.118	ENSAPEG00000004250	ftsj3	97	60.714	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	92	58.172	ENSATEG00000010069	ftsj3	96	57.623	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	92	60.870	ENSAPLG00000010362	-	98	61.111	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	88	64.069	ENSACAG00000017930	FTSJ3	98	64.651	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.817	ENSANAG00000033774	FTSJ3	98	88.299	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	84	69.101	ENSACLG00000019137	ftsj3	97	69.101	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.329	ENSAMXG00000021571	ftsj3	94	62.024	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.620	ENSBTAG00000021060	FTSJ3	98	88.862	Bos_taurus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	40.668	WBGene00019168	H06I04.3	60	48.444	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	86.232	ENSCJAG00000019631	FTSJ3	98	86.715	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	88.109	ENSCAFG00000012770	FTSJ3	98	87.093	Canis_familiaris
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	88.305	ENSCAFG00020026630	FTSJ3	98	87.651	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	89.091	ENSCHIG00000025676	FTSJ3	98	89.697	Capra_hircus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	95	83.730	ENSTSYG00000001393	FTSJ3	97	83.206	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	71	86.000	ENSCAPG00000016654	FTSJ3	98	85.200	Cavia_aperea
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	94.189	ENSCPOG00000011384	FTSJ3	98	94.189	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.560	ENSCCAG00000023533	-	98	91.589	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.755	ENSCATG00000018510	FTSJ3	98	87.755	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	88.389	ENSCSAG00000003921	FTSJ3	98	88.207	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	69.002	ENSCPBG00000010032	FTSJ3	98	74.248	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	58	57.655	ENSCSAVG00000003607	-	83	57.009	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.605	ENSCANG00000042921	FTSJ3	98	87.846	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.772	ENSCGRG00001018068	FTSJ3	98	87.288	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.772	ENSCGRG00000010648	FTSJ3	98	87.288	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	60.070	ENSCSEG00000013468	ftsj3	96	59.312	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.249	ENSCVAG00000007484	ftsj3	97	61.271	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.246	ENSDARG00000104938	ftsj3	97	61.871	Danio_rerio
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	87.028	ENSDNOG00000002392	FTSJ3	98	87.186	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	89.988	ENSDORG00000004200	Ftsj3	98	89.867	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	85.225	ENSETEG00000019228	FTSJ3	98	85.354	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	51.319	ENSEBUG00000007828	ftsj3	97	51.146	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	89.655	ENSEASG00005013565	FTSJ3	98	89.372	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	90.206	ENSECAG00000011995	FTSJ3	98	89.843	Equus_caballus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	60.613	ENSELUG00000013501	ftsj3	95	60.166	Esox_lucius
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	87.738	ENSFCAG00000013983	FTSJ3	98	87.515	Felis_catus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	68.698	ENSFALG00000013635	FTSJ3	99	69.332	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	93.204	ENSFDAG00000010274	FTSJ3	98	92.597	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.932	ENSFHEG00000007639	ftsj3	97	61.957	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	51	70.938	ENSGMOG00000017184	ftsj3	100	70.709	Gadus_morhua
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	70.476	ENSGALG00000032993	FTSJ3	99	70.588	Gallus_gallus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	51	72.131	ENSGACG00000009841	ftsj3	100	72.131	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	71.040	ENSGAGG00000006236	FTSJ3	99	71.463	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.341	ENSGGOG00000006794	FTSJ3	98	88.087	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.871	ENSHBUG00000022331	ftsj3	96	61.410	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	93.568	ENSHGLG00000012282	FTSJ3	98	92.961	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	93.584	ENSHGLG00100003578	FTSJ3	98	92.961	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.262	ENSHCOG00000018770	ftsj3	96	60.264	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.447	ENSIPUG00000024942	ftsj3	94	61.649	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	89.410	ENSSTOG00000021265	FTSJ3	98	88.513	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.000	ENSJJAG00000012822	Ftsj3	98	87.273	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.396	ENSKMAG00000021997	ftsj3	96	61.474	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.237	ENSLBEG00000027142	ftsj3	96	59.547	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	82	49.091	ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.577	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.072	ENSLOCG00000008979	ftsj3	98	61.950	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	87.990	ENSLAFG00000003252	FTSJ3	98	88.164	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.688	ENSMFAG00000003764	FTSJ3	98	88.448	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	83.112	ENSMMUG00000016768	FTSJ3	98	83.133	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.462	ENSMNEG00000029254	FTSJ3	98	88.462	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.462	ENSMLEG00000029091	FTSJ3	98	88.221	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.712	ENSMZEG00005001992	ftsj3	96	61.124	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	64.612	ENSMGAG00000000953	FTSJ3	99	64.699	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.923	ENSMAUG00000015688	Ftsj3	98	87.167	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	89.372	ENSMICG00000045996	FTSJ3	98	89.976	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	87.589	ENSMOCG00000017809	Ftsj3	98	86.804	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	57.920	ENSMMOG00000019522	ftsj3	89	58.186	Mola_mola
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	79.167	ENSMODG00000009901	FTSJ3	98	78.865	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.620	MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	88.620	Mus_caroli
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.029	ENSMUSG00000020706	Ftsj3	98	88.150	Mus_musculus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	89.023	MGP_PahariEiJ_G0018445	Ftsj3	98	89.023	Mus_pahari
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.015	MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	88.015	Mus_spretus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	88.109	ENSMPUG00000014911	FTSJ3	98	87.893	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	89.273	ENSMLUG00000011667	FTSJ3	98	89.346	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	89.614	ENSNGAG00000005899	Ftsj3	98	88.848	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	85	69.519	ENSNBRG00000017453	ftsj3	97	69.663	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	88.207	ENSNLEG00000004188	FTSJ3	98	88.420	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	74.554	ENSMEUG00000013252	FTSJ3	98	73.671	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	86.707	ENSOPRG00000014985	FTSJ3	98	86.228	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	93.802	ENSODEG00000008167	FTSJ3	98	93.584	Octodon_degus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.945	ENSONIG00000001654	ftsj3	96	61.210	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	86.564	ENSOCUG00000004319	FTSJ3	98	86.232	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.396	ENSORLG00000005910	ftsj3	96	62.275	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.233	ENSORLG00020021255	ftsj3	89	72.159	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.114	ENSORLG00015018416	ftsj3	96	62.201	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	62.470	ENSOMEG00000014432	ftsj3	96	62.455	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	88.019	ENSOGAG00000032479	FTSJ3	98	88.207	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.741	ENSOARG00000013637	FTSJ3	98	89.104	Ovis_aries
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.650	ENSPPAG00000027297	FTSJ3	98	87.530	Pan_paniscus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	87.262	ENSPPRG00000003042	FTSJ3	98	87.758	Panthera_pardus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	86.036	ENSPTIG00000012576	FTSJ3	98	86.867	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.144	ENSPTRG00000009524	FTSJ3	98	87.545	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.448	ENSPANG00000020978	FTSJ3	98	88.207	Papio_anubis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	63.145	ENSPKIG00000012838	ftsj3	96	62.455	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	59	82.222	ENSPSIG00000004632	FTSJ3	67	86.957	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	88	66.832	ENSPMGG00000012959	ftsj3	98	53.511	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.471	ENSPEMG00000000248	Ftsj3	98	87.879	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	78.266	ENSPCIG00000009088	FTSJ3	98	78.031	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.420	ENSPFOG00000023101	ftsj3	97	60.595	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	61.131	ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.476	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.538	ENSPMEG00000012692	ftsj3	97	60.714	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	60.915	ENSPREG00000014874	ftsj3	97	60.284	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	86.353	ENSPPYG00000008532	FTSJ3	98	86.232	Pongo_abelii
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	85.322	ENSPCAG00000002560	FTSJ3	98	85.455	Procavia_capensis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	89.855	ENSPCOG00000023921	FTSJ3	98	89.734	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	89.324	ENSPVAG00000000162	FTSJ3	98	88.675	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	85	69.110	ENSPNYG00000005108	ftsj3	96	69.663	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	97	59.805	ENSPNAG00000022474	ftsj3	94	60.195	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	87.947	ENSRNOG00000009857	Ftsj3	99	88.242	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.485	ENSRBIG00000039259	FTSJ3	98	87.605	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.590	ENSRROG00000045002	FTSJ3	98	87.831	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	54	42.585	YCL054W	-	53	41.915	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	88.087	ENSSBOG00000031794	FTSJ3	92	87.560	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	77.224	ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.952	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.786	ENSSFOG00015018053	ftsj3	97	62.110	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	66	64.158	ENSSMAG00000002863	ftsj3	96	59.905	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	60.689	ENSSDUG00000003385	ftsj3	95	58.893	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	60.808	ENSSLDG00000017970	ftsj3	95	59.689	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	92	70.361	ENSSPUG00000012959	FTSJ3	99	69.121	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	60.517	ENSSPAG00000002390	ftsj3	96	60.357	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.150	ENSSSCG00000017288	FTSJ3	98	87.666	Sus_scrofa
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.374	ENSTRUG00000017550	ftsj3	88	69.886	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	60.284	ENSTNIG00000015549	ftsj3	98	61.011	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	83.758	ENSTBEG00000010295	FTSJ3	98	84.000	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	87.787	ENSTTRG00000006973	FTSJ3	98	87.666	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	82	99.254	ENSUAMG00000007332	FTSJ3	95	99.020	Ursus_americanus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	88.663	ENSUMAG00000017450	FTSJ3	98	88.242	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	100	88.544	ENSVVUG00000006106	FTSJ3	98	88.242	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	97	59.011	ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.109	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	59.524	ENSXCOG00000002999	ftsj3	66	64.193	Xiphophorus_couchianus
ENSCLAG00000003222	FTSJ3	99	61.045	ENSXMAG00000018139	ftsj3	96	59.167	Xiphophorus_maculatus