EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000005043 (Gene tree)
Gene ID: 102026812
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1813 bases
Position: chrJH721906.1:14564366-14566178
Accession: 102026812
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000007165	eRF1_2	PF03464.15	2.1e-37	1	1
ENSCLAP00000007165	eRF1_3	PF03465.15	5.1e-27	1	1
ENSCLAP00000007165	eRF1_1	PF03463.15	2.3e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000007278	PELO-201	1532	XM_005392726	ENSCLAP00000007165	385 (aa)	XP_005392783	UPI00038EC098

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.662	ENSG00000152684	PELO	100	97.662	Homo_sapiens
ENSCLAG00000005043	PELO	64	80.162	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000005043	PELO	64	80.162	ENSAPOG00000023700	-	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	79.481	ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.481	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSAMEG00000007734	PELO	100	98.442	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000005043	PELO	97	76.944	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	79.740	ENSAOCG00000023717	pelo	100	79.740	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000005043	PELO	100	79.740	ENSAPEG00000011235	pelo	100	79.740	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.299	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.299	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000005043	PELO	77	84.899	ENSAPLG00000013265	PELO	100	84.899	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000005043	PELO	98	90.160	ENSACAG00000004352	PELO	100	89.870	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSANAG00000014096	PELO	100	98.442	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000005043	PELO	97	80.965	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.442	Bos_taurus
ENSCLAG00000005043	PELO	99	58.005	WBGene00011280	pelo-1	100	58.005	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.442	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.701	ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.701	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.182	Capra_hircus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.442	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000005043	PELO	100	99.481	ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.481	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSCCAG00000035600	PELO	100	98.442	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSCATG00000011829	PELO	100	98.182	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.182	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.662	ENSCHOG00000000523	PELO	100	97.662	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000005043	PELO	98	93.617	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000005043	PELO	97	68.633	ENSCING00000001979	-	100	69.091	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000005043	PELO	100	69.870	ENSCSAVG00000006158	-	100	69.870	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSCANG00000023382	PELO	100	98.182	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	95.584	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.584	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000005043	PELO	100	96.883	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	96.883	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.260	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.558	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.299	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.299	Danio_rerio
ENSCLAG00000005043	PELO	100	95.078	ENSDNOG00000036721	PELO	100	95.078	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.182	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000005043	PELO	96	67.116	FBgn0011207	pelo	96	67.018	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000005043	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.701	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.701	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	Esox_lucius
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.701	ENSFCAG00000032341	PELO	100	98.701	Felis_catus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	94.545	ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000005043	PELO	74	98.239	ENSFDAG00000002076	PELO	88	98.239	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000005043	PELO	100	79.740	ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000005043	PELO	98	80.371	ENSGMOG00000005849	pelo	100	80.260	Gadus_morhua
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.779	ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000005043	PELO	98	93.883	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSGGOG00000012635	PELO	100	98.182	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.442	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000005043	PELO	100	96.104	ENSHGLG00100017627	PELO	100	96.104	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000005043	PELO	100	77.922	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.000	ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.000	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	99.481	ENSSTOG00000027378	PELO	100	99.481	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	95.065	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	95.065	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.558	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.558	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000005043	PELO	99	80.208	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.182	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSMFAG00000000651	PELO	100	98.182	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSMMUG00000039101	PELO	100	98.182	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSMNEG00000035538	PELO	100	98.182	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSMLEG00000039113	PELO	100	98.182	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000005043	PELO	97	82.574	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.338	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.260	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000005043	PELO	100	96.883	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	96.883	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.442	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.403	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.403	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000005043	PELO	100	78.701	ENSMMOG00000001324	pelo	100	78.701	Mola_mola
ENSCLAG00000005043	PELO	100	82.078	ENSMALG00000008194	pelo	100	82.078	Monopterus_albus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.662	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.662	Mus_caroli
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.662	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.662	Mus_musculus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.922	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.922	Mus_pahari
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.662	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.662	Mus_spretus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	95.065	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.065	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.662	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.662	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSNLEG00000035970	PELO	100	98.182	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000005043	PELO	100	94.026	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.026	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000005043	PELO	98	97.889	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.889	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.922	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.922	Octodon_degus
ENSCLAG00000005043	PELO	96	80.541	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.260	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.922	ENSOCUG00000023902	PELO	100	97.922	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.299	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.039	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.039	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.299	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.818	ENSOMEG00000021567	pelo	100	81.818	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.662	ENSOGAG00000027940	PELO	100	97.662	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.442	Ovis_aries
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSPPAG00000038951	PELO	100	98.182	Pan_paniscus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.701	ENSPPRG00000018800	PELO	100	98.701	Panthera_pardus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.701	ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.701	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.922	ENSPTRG00000034409	PELO	100	97.922	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSPANG00000010902	PELO	100	98.182	Papio_anubis
ENSCLAG00000005043	PELO	100	82.597	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.597	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000005043	PELO	98	93.351	ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000005043	PELO	67	78.295	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.295	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.403	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.403	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000005043	PELO	100	96.364	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.364	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.558	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.558	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.818	ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.558	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.818	ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.922	ENSPPYG00000015451	PELO	96	97.922	Pongo_abelii
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.442	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.442	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.260	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000005043	PELO	97	81.501	ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000005043	PELO	100	97.403	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.403	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSRBIG00000007299	PELO	100	98.182	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSRROG00000035507	PELO	100	98.182	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000005043	PELO	98	34.545	YNL001W	-	98	34.545	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	ENSSBOG00000036140	PELO	100	98.182	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000005043	PELO	63	95.082	ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.082	Sarcophilus_harrisii
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