EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000005187 (Gene tree)
Gene ID: 102021143
Gene Symbol: POLR1A
Alias: DKFZP586M0122|FLJ21915|RPA1|RPO1-4
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 85072 bases
Position: chrJH721884.1:1508037-1593108
Accession: 102021143
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000007377	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	1.1e-103	1	1
ENSCLAP00000007377	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	3.2e-25	1	1
ENSCLAP00000007377	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	1.7e-69	1	1
ENSCLAP00000007377	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	5.3e-37	1	1
ENSCLAP00000007377	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	2.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000007494	POLR1A-201	5160	XM_005385408	ENSCLAP00000007377	1719 (aa)	XP_005385465	-

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000005187's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000005187's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000005187	POLR1A	59	38.806	ENSCLAG00000012196	-	51	38.806
ENSCLAG00000005187	POLR1A	63	32.841	ENSCLAG00000009629	POLR3A	78	32.841

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000005187	POLR1A	97	91.795	ENSG00000068654	POLR1A	100	88.754	Homo_sapiens
ENSCLAG00000005187	POLR1A	69	67.477	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	67.477	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.863	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	91.598	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	63.663	ENSACIG00000022147	polr1a	100	62.674	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	66.126	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	67.229	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000005187	POLR1A	94	74.306	ENSAPEG00000016105	polr1a	98	74.306	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	66.415	ENSATEG00000016773	polr1a	100	65.719	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	85	71.814	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.196	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	68.696	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	67.876	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.051	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	88.051	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	62.341	ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.415	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.406	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	88.406	Bos_taurus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	38.543	WBGene00012999	rpoa-1	98	38.488	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	87.362	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	87.884	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.321	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	89.495	Canis_familiaris
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.437	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	89.611	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	87.674	ENSCHIG00000018204	POLR1A	100	87.616	Capra_hircus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	86.725	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.725	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000005187	POLR1A	97	89.480	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	89.480	Cavia_aperea
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	94.299	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	94.299	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	87.942	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	88.464	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.159	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	89.333	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.754	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	89.217	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	73.632	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	73.690	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	46.655	ENSCSAVG00000007184	-	91	54.963	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	86.153	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	86.095	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	96	90.620	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	84.544	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000005187	POLR1A	60	88.619	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	88.619	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	61.985	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	61.579	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.240	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	63.972	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	66.357	ENSDARG00000098375	polr1a	100	66.067	Danio_rerio
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	81.370	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	81.370	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.294	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.294	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000005187	POLR1A	80	44.000	FBgn0019938	RpI1	99	43.314	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000005187	POLR1A	72	93.750	ENSETEG00000000412	-	72	93.750	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000005187	POLR1A	88	66.667	ENSEBUG00000005667	-	99	47.674	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.507	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	90.029	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.449	ENSECAG00000030510	-	100	92.037	Equus_caballus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.449	ENSECAG00000036306	-	100	92.037	Equus_caballus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.449	ENSECAG00000010092	POLR1A	100	92.037	Equus_caballus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	85	94.681	ENSEEUG00000000676	POLR1A	85	94.681	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	67.364	ENSELUG00000012769	polr1a	99	67.364	Esox_lucius
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.037	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	89.037	Felis_catus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	70.841	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	70.841	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	94.764	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	94.474	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	61.783	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	61.891	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	59.570	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	59.675	Gadus_morhua
ENSCLAG00000005187	POLR1A	90	68.766	ENSGALG00000038160	-	99	68.766	Gallus_gallus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	63.884	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	64.178	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.598	ENSGACG00000018791	polr1a	100	63.968	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	89	74.432	ENSGAGG00000004984	-	95	80.482	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.638	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	88.812	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000005187	POLR1A	93	64.734	ENSHBUG00000020021	polr1a	99	63.672	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	94.299	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	94.299	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	94.032	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	94.032	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	62.009	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	61.760	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	65.185	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	64.611	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	87.958	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	88.023	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.367	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	89.367	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	65.369	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	64.505	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	94	68.329	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	67.737	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000005187	POLR1A	53	76.522	ENSLACG00000003218	polr1a	100	76.522	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	71.312	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	71.254	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.232	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	88.464	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.870	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	89.333	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.754	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	89.217	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.870	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	89.333	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.290	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	88.754	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	66.067	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	65.511	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	65.975	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	65.152	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	68.721	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	68.837	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000005187	POLR1A	92	89.157	ENSMAUG00000008497	Polr1a	100	89.347	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.166	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	89.050	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.727	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	88.727	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.983	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	64.942	Mola_mola
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	74.570	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	74.384	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	65.159	ENSMALG00000013363	polr1a	100	65.014	Monopterus_albus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	86.702	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	86.818	Mus_caroli
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	87.050	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	87.108	Mus_musculus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	87.856	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	87.914	Mus_pahari
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	85.722	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	86.138	Mus_spretus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.501	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	89.501	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	87.326	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	87.384	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.082	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	89.141	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	65.817	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	65.210	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	86.555	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	86.728	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000005187	POLR1A	75	92.126	ENSMEUG00000011665	-	75	92.126	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	82.325	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.560	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	95.986	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	95.986	Octodon_degus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	66.165	ENSONIG00000015895	polr1a	100	65.365	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	90.006	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	90.180	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.600	ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.000	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	63.521	ENSORLG00020020726	polr1a	99	62.768	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000005187	POLR1A	95	76.596	ENSORLG00015016071	polr1a	98	76.596	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.754	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.754	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.266	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.201	Ovis_aries
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.406	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	88.580	Pan_paniscus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.153	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	89.153	Panthera_pardus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.671	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	88.671	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.348	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	88.522	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.043	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	89.217	Papio_anubis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	94	74.306	ENSPKIG00000005468	polr1a	99	74.306	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000005187	POLR1A	63	70.887	ENSPSIG00000009321	-	99	70.980	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	55	68.085	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.085	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.715	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.483	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000005187	POLR1A	95	78.646	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	78.359	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.290	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	64.290	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.406	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.058	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	62.609	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	62.695	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.542	ENSPREG00000002389	polr1a	100	64.025	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.174	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	88.348	Pongo_abelii
ENSCLAG00000005187	POLR1A	92	100.000	ENSPCAG00000011582	POLR1A	92	100.000	Procavia_capensis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.513	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	89.571	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000005187	POLR1A	95	89.531	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	88.889	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	65.975	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	65.152	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	66.165	ENSPNAG00000019223	polr1a	99	68.668	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.727	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	89.250	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.348	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	88.812	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.290	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	88.754	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	36.798	YOR341W	RPA190	99	36.768	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	87.652	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	88.174	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	73.110	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	73.110	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	67.283	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	66.705	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	65.172	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	64.781	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	66.068	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	66.089	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.120	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	64.265	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	73	97.872	ENSSARG00000003136	-	76	97.872	Sorex_araneus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	95	77.436	ENSSPUG00000004215	POLR1A	98	77.436	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	63	71.769	ENSSPAG00000016341	polr1a	94	71.769	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	83	89.930	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	89.902	Sus_scrofa
ENSCLAG00000005187	POLR1A	99	69.947	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	69.316	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	63.621	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	64.464	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	59.746	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	59.746	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	74	93.805	ENSTBEG00000008646	POLR1A	74	93.805	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	84.000	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	84.406	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	68	88.748	ENSUAMG00000012158	-	94	88.748	Ursus_americanus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.573	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	88.573	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.031	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	89.205	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	67.707	ENSXETG00000001952	polr1a	99	68.934	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	64.389	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	64.583	Xiphophorus_maculatus