EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000005232 (Gene tree)
Gene ID: 102025803
Gene Symbol: PUSL1
Alias: FLJ90811
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3015 bases
Position: chrJH721946.1:9491506-9494520
Accession: 102025803
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000007447	PseudoU_synth_1	PF01416.20	2.3e-36	1	2
ENSCLAP00000007447	PseudoU_synth_1	PF01416.20	2.3e-36	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000007564	PUSL1-201	1382	XM_005404237	ENSCLAP00000007447	305 (aa)	XP_005404294	UPI00038ECAB3

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000005232's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000005232's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	82.724	ENSG00000169972	PUSL1	100	81.600	Homo_sapiens
ENSCLAG00000005232	PUSL1	94	47.423	ENSAPOG00000016290	pusl1	97	47.423	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	94	80.488	ENSAMEG00000013752	PUSL1	95	80.488	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	45.520	ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.715	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	48.582	ENSAOCG00000019419	pusl1	84	48.582	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000005232	PUSL1	94	47.766	ENSAPEG00000005452	pusl1	97	47.766	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	49.275	ENSATEG00000024154	pusl1	92	49.275	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	55.235	ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	55.235	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000005232	PUSL1	83	53.906	ENSACAG00000014111	PUSL1	96	53.906	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	82.724	ENSANAG00000037456	PUSL1	98	82.724	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.561	ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.178	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	46.909	ENSAMXG00000044007	pusl1	93	46.909	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	81.754	ENSBTAG00000007619	PUSL1	98	81.754	Bos_taurus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	82.724	ENSCJAG00000010972	PUSL1	98	82.724	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	80.282	ENSCAFG00000019291	PUSL1	93	80.282	Canis_familiaris
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	81.754	ENSCAFG00020011568	PUSL1	93	81.754	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000005232	PUSL1	92	81.851	ENSCHIG00000012615	PUSL1	98	81.851	Capra_hircus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	62	30.256	ENSCPOG00000001027	PUS1	50	30.256	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	98	90.000	ENSCPOG00000005149	PUSL1	98	90.000	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	83.389	ENSCCAG00000027475	PUSL1	98	83.389	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	97	83.108	ENSCATG00000018260	PUSL1	97	83.108	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000005232	PUSL1	97	83.108	ENSCSAG00000000680	PUSL1	97	83.108	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	57.762	ENSCPBG00000022621	PUSL1	94	57.762	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	81.728	ENSCANG00000034373	PUSL1	98	81.728	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	77.032	ENSCGRG00001012429	Pusl1	97	77.032	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	30.102	ENSCGRG00001019592	Pus1	50	30.102	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	30.102	ENSCGRG00000004048	Pus1	50	30.102	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	77.032	ENSCGRG00000006466	Pusl1	97	77.032	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000005232	PUSL1	95	46.416	ENSCSEG00000005159	pusl1	93	49.281	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	76	45.690	ENSCVAG00000012923	pusl1	89	45.690	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	48.214	ENSDARG00000074565	pusl1	98	48.214	Danio_rerio
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	31.475	FBgn0083976	CG34140	98	31.475	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	78.808	ENSECAG00000006248	PUSL1	99	78.808	Equus_caballus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	95	75.342	ENSEEUG00000000837	PUSL1	98	75.342	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	50.178	ENSELUG00000015945	pusl1	95	50.178	Esox_lucius
ENSCLAG00000005232	PUSL1	96	80.612	ENSFCAG00000007617	PUSL1	97	80.612	Felis_catus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	52.143	ENSFHEG00000006370	pusl1	93	52.143	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	51.786	ENSGMOG00000019388	pusl1	98	51.786	Gadus_morhua
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	54.152	ENSGALG00000001714	PUSL1	95	54.152	Gallus_gallus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	50.714	ENSGAFG00000007546	pusl1	95	50.714	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.387	ENSGACG00000007848	pusl1	91	48.387	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	58.484	ENSGAGG00000004730	PUSL1	94	58.484	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000005232	PUSL1	84	83.203	ENSGGOG00000005364	PUSL1	98	83.203	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.561	ENSHBUG00000001264	pusl1	92	48.561	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000005232	PUSL1	100	87.908	ENSHGLG00000017570	PUSL1	99	87.908	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000005232	PUSL1	87	89.513	ENSHGLG00100007641	PUSL1	88	89.513	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	49.104	ENSHCOG00000010077	pusl1	99	49.635	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	46.619	ENSIPUG00000023921	pusl1	96	46.619	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	80.702	ENSSTOG00000001783	PUSL1	89	80.702	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	30.102	ENSJJAG00000000088	Pus1	50	30.102	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	94	82.578	ENSJJAG00000020471	Pusl1	97	82.578	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	81	50.400	ENSKMAG00000005154	pusl1	84	50.400	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	51.625	ENSLBEG00000013469	pusl1	95	51.625	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	55.155	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	55.155	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000005232	PUSL1	95	49.488	ENSLOCG00000002210	pusl1	94	50.542	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	86	81.579	ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	81.579	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	82.392	ENSMFAG00000046288	PUSL1	98	82.392	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	73.090	ENSMMUG00000016279	PUSL1	98	73.090	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000005232	PUSL1	97	83.446	ENSMNEG00000037989	PUSL1	97	83.446	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.921	ENSMAMG00000016538	pusl1	91	48.921	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.561	ENSMZEG00005026990	pusl1	96	44.803	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	53.901	ENSMGAG00000003037	PUSL1	95	53.901	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	30.102	ENSMAUG00000001482	Pus1	50	30.102	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	77.385	ENSMAUG00000019924	Pusl1	97	77.385	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	96	78.912	ENSMICG00000014171	PUSL1	100	78.912	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	92	77.305	ENSMOCG00000005602	Pusl1	97	77.305	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000005232	PUSL1	62	30.964	ENSMOCG00000022311	Pus1	50	30.964	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	49.104	ENSMMOG00000003269	pusl1	99	48.561	Mola_mola
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	49.462	ENSMALG00000021686	pusl1	91	49.462	Monopterus_albus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	78.092	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	97	78.092	Mus_caroli
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	30.102	MGP_CAROLIEiJ_G0027551	Pus1	50	30.102	Mus_caroli
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	30.208	ENSMUSG00000029507	Pus1	50	30.102	Mus_musculus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	78.445	ENSMUSG00000051557	Pusl1	97	78.445	Mus_musculus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	78.445	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	97	78.445	Mus_pahari
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	30.208	MGP_PahariEiJ_G0024133	Pus1	50	30.102	Mus_pahari
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	78.799	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	97	78.799	Mus_spretus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	30.208	MGP_SPRETEiJ_G0028549	Pus1	50	30.102	Mus_spretus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	80.919	ENSMPUG00000014313	PUSL1	93	80.919	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000005232	PUSL1	92	78.092	ENSNGAG00000004647	Pusl1	85	78.092	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000005232	PUSL1	84	47.490	ENSNBRG00000014762	pusl1	94	47.490	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	82.182	ENSNLEG00000000051	PUSL1	98	82.182	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	50.909	ENSMEUG00000005176	-	99	50.909	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000005232	PUSL1	92	62.898	ENSMEUG00000011649	-	99	62.898	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000005232	PUSL1	94	89.547	ENSODEG00000008247	PUSL1	91	89.547	Octodon_degus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	62	30.366	ENSODEG00000008248	PUS1	52	30.366	Octodon_degus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	50.178	ENSONIG00000019361	pusl1	94	50.178	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	47.518	ENSORLG00000016228	pusl1	95	47.518	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	48.936	ENSORLG00020013710	pusl1	95	48.936	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	49.110	ENSORLG00015008715	pusl1	98	49.110	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	47.842	ENSOMEG00000018897	pusl1	95	47.842	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000005232	PUSL1	94	80.488	ENSOGAG00000031692	PUSL1	100	80.488	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000005232	PUSL1	86	81.749	ENSOARG00000004905	PUSL1	99	81.749	Ovis_aries
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	82.392	ENSPPAG00000029283	PUSL1	98	82.392	Pan_paniscus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	96	79.592	ENSPPRG00000023329	PUSL1	97	79.592	Panthera_pardus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	86	82.061	ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	82.061	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000005232	PUSL1	99	83.056	ENSPTRG00000000021	PUSL1	98	83.056	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000005232	PUSL1	97	83.051	ENSPANG00000000591	PUSL1	96	83.051	Papio_anubis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	47.331	ENSPKIG00000002447	pusl1	96	47.331	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000005232	PUSL1	83	58.824	ENSPSIG00000002781	PUSL1	94	58.824	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	97	45.151	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	47.653	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	63	30.102	ENSPEMG00000013448	Pus1	50	30.102	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000005232	PUSL1	94	79.167	ENSPEMG00000013541	Pusl1	99	79.167	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000005232	PUSL1	92	63.251	ENSPCIG00000007816	-	65	63.251	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	52.878	ENSPFOG00000015448	pusl1	93	51.673	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	52.500	ENSPLAG00000004348	pusl1	94	52.500	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	52.500	ENSPMEG00000000931	pusl1	94	52.500	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	53.261	ENSPREG00000002324	pusl1	93	53.261	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000005232	PUSL1	85	80.385	ENSPPYG00000002014	PUSL1	92	80.385	Pongo_abelii
ENSCLAG00000005232	PUSL1	80	70.782	ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	70.782	Procavia_capensis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	70	85.915	ENSPVAG00000001016	PUSL1	69	85.915	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	77	47.899	ENSPNYG00000006588	pusl1	98	47.899	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	49.281	ENSPNAG00000024441	pusl1	96	49.281	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	80.565	ENSRNOG00000022354	Pusl1	98	82.258	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	97	82.770	ENSRBIG00000036842	PUSL1	97	82.770	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000005232	PUSL1	97	82.432	ENSRROG00000030704	PUSL1	97	82.432	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	81.655	ENSSBOG00000032249	PUSL1	99	81.655	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	49.821	ENSSFOG00015008281	pusl1	92	49.821	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.029	ENSSMAG00000007187	pusl1	91	48.029	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.201	ENSSDUG00000000287	pusl1	93	45.161	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.201	ENSSLDG00000009605	pusl1	88	48.201	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	62	80.851	ENSSARG00000005323	-	100	80.851	Sorex_araneus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	92	41.497	ENSSPAG00000002528	pusl1	99	44.322	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	93	80.919	ENSSSCG00000003338	PUSL1	92	80.919	Sus_scrofa
ENSCLAG00000005232	PUSL1	89	54.710	ENSTGUG00000003214	PUSL1	99	54.545	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	48.921	ENSTRUG00000010102	pusl1	93	48.921	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000005232	PUSL1	59	43.956	ENSTNIG00000005789	pusl1	81	43.956	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	92	59.220	ENSTBEG00000005001	PUSL1	92	59.220	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000005232	PUSL1	98	71.333	ENSTTRG00000017030	PUSL1	98	71.333	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	80	81.557	ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	81.557	Ursus_americanus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	80	81.148	ENSUMAG00000002084	PUSL1	81	81.148	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	98	78.859	ENSVVUG00000004320	PUSL1	94	71.605	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000005232	PUSL1	73	52.889	ENSXETG00000011145	pusl1	98	52.889	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	49.110	ENSXCOG00000017748	pusl1	99	49.110	Xiphophorus_couchianus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	60	31.527	ENSXMAG00000028945	pus3	59	31.527	Xiphophorus_maculatus
ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	52.158	ENSXMAG00000018846	pusl1	93	52.158	Xiphophorus_maculatus