EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000006919 (Gene tree)
Gene ID: 102015878
Gene Symbol: REXO4
Alias: XPMC2H|hPMC2
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6951 bases
Position: chrJH721973.1:2745842-2752792
Accession: 102015878
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000009989	RNase_T	PF00929.24	6.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000010119	REXO4-201	1168	XM_005408440	ENSCLAP00000009989	330 (aa)	XP_005408497	UPI00038F0DD6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000006919	REXO4	52	39.785	ENSCLAG00000008791	AEN	71	37.168

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	75.676	ENSG00000148300	REXO4	100	67.876	Homo_sapiens
ENSCLAG00000006919	REXO4	64	66.512	ENSAPOG00000019264	rexo4	55	63.203	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	73.231	ENSAMEG00000011649	REXO4	78	73.231	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000006919	REXO4	75	61.446	ENSAOCG00000004087	rexo4	51	66.977	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000006919	REXO4	75	61.044	ENSAPEG00000009106	rexo4	51	66.512	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	67.593	ENSATEG00000017662	rexo4	51	67.442	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000006919	REXO4	73	65.726	ENSAPLG00000005865	REXO4	74	65.323	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	70.571	ENSANAG00000028404	REXO4	78	71.171	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	51.807	ENSACLG00000006007	rexo4	72	52.648	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000006919	REXO4	66	62.500	ENSAMXG00000013291	rexo4	51	62.332	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000006919	REXO4	97	70.625	ENSBTAG00000019721	REXO4	78	69.394	Bos_taurus
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	72.973	ENSCJAG00000009774	REXO4	78	72.072	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	70.091	ENSCAFG00000019767	REXO4	81	70.091	Canis_familiaris
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	70.997	ENSCAFG00020000983	-	77	70.997	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	69.394	ENSCHIG00000009517	REXO4	78	69.394	Capra_hircus
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	74.242	ENSTSYG00000027492	REXO4	78	74.242	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	82.067	ENSCAPG00000014583	REXO4	95	82.067	Cavia_aperea
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	80.982	ENSCPOG00000001386	REXO4	73	80.982	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	65.165	ENSCCAG00000027049	REXO4	77	64.865	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	74.096	ENSCATG00000028646	REXO4	78	73.193	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	73.414	ENSCSAG00000015280	REXO4	77	72.508	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000006919	REXO4	85	60.627	ENSCPBG00000021152	REXO4	68	60.279	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000006919	REXO4	64	54.717	ENSCING00000010751	-	77	54.717	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	73.795	ENSCANG00000029855	REXO4	78	72.892	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	71.515	ENSCGRG00001013126	Rexo4	77	71.515	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	71.515	ENSCGRG00000009819	Rexo4	80	71.515	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	65.899	ENSCSEG00000019343	rexo4	51	65.741	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000006919	REXO4	64	62.617	ENSCVAG00000014963	rexo4	58	62.617	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000006919	REXO4	63	63.256	ENSDARG00000088619	rexo4	79	63.084	Danio_rerio
ENSCLAG00000006919	REXO4	93	59.350	ENSDNOG00000002429	REXO4	78	59.211	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	76.398	ENSDORG00000006190	Rexo4	94	76.398	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000006919	REXO4	74	72.358	ENSEASG00005009915	-	79	72.358	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	73.414	ENSECAG00000007896	REXO4	72	73.414	Equus_caballus
ENSCLAG00000006919	REXO4	82	82.514	ENSEEUG00000012135	-	100	60.486	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000006919	REXO4	95	50.862	ENSELUG00000003539	rexo4	70	49.143	Esox_lucius
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	68.902	ENSFCAG00000011652	REXO4	74	69.113	Felis_catus
ENSCLAG00000006919	REXO4	78	64.773	ENSFALG00000001520	REXO4	63	63.569	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	85.758	ENSFDAG00000016050	REXO4	79	85.758	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	63.721	ENSFHEG00000002413	rexo4	83	49.699	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000006919	REXO4	63	55.814	ENSGMOG00000012876	rexo4	64	55.814	Gadus_morhua
ENSCLAG00000006919	REXO4	83	58.781	ENSGACG00000008065	rexo4	66	58.781	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000006919	REXO4	74	66.800	ENSGAGG00000010260	REXO4	61	66.400	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	75.375	ENSGGOG00000014508	REXO4	78	74.474	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	51.183	ENSHBUG00000000542	rexo4	72	52.336	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	83.636	ENSHGLG00000016901	REXO4	79	83.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	83.636	ENSHGLG00100017444	REXO4	79	83.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000006919	REXO4	63	60.190	ENSHCOG00000018196	rexo4	55	60.190	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000006919	REXO4	68	59.227	ENSIPUG00000021084	rexo4	56	59.227	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	80.000	ENSSTOG00000003754	REXO4	79	80.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	74.772	ENSJJAG00000013002	Rexo4	76	74.772	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000006919	REXO4	69	61.570	ENSKMAG00000015039	rexo4	52	65.581	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000006919	REXO4	82	56.902	ENSLBEG00000025570	rexo4	50	68.837	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000006919	REXO4	76	63.602	ENSLACG00000012399	REXO4	60	62.835	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000006919	REXO4	69	65.812	ENSLOCG00000003577	rexo4	50	68.519	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	65.165	ENSLAFG00000011274	REXO4	80	64.865	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	73.193	ENSMFAG00000042425	REXO4	78	72.289	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	73.494	ENSMMUG00000000935	REXO4	78	72.590	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	72.892	ENSMNEG00000031604	REXO4	78	71.988	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	74.699	ENSMLEG00000037716	REXO4	78	73.795	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000006919	REXO4	83	56.884	ENSMAMG00000011251	rexo4	57	62.343	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	51.479	ENSMZEG00005012336	rexo4	62	65.611	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000006919	REXO4	80	64.576	ENSMGAG00000006521	REXO4	72	65.649	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	71.818	ENSMAUG00000015137	Rexo4	77	71.818	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	76.524	ENSMICG00000008422	REXO4	78	75.000	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	74.468	ENSMOCG00000020607	Rexo4	76	74.468	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000006919	REXO4	95	60.736	ENSMODG00000012817	REXO4	75	60.736	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	68.203	ENSMALG00000019705	rexo4	52	68.203	Monopterus_albus
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	72.000	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	79	72.615	Mus_caroli
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	70.606	ENSMUSG00000052406	Rexo4	80	71.212	Mus_musculus
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	70.427	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	79	70.732	Mus_pahari
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	70.303	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	80	70.909	Mus_spretus
ENSCLAG00000006919	REXO4	97	70.031	ENSMPUG00000012315	REXO4	92	70.031	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	70.517	ENSNGAG00000010700	Rexo4	79	70.517	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	51.506	ENSNBRG00000011712	rexo4	76	51.506	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	73.574	ENSNLEG00000013130	-	78	72.973	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	72.372	ENSNLEG00000007556	-	82	71.471	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000006919	REXO4	95	48.287	ENSMEUG00000006513	-	76	47.664	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	79.027	ENSODEG00000015721	REXO4	95	79.027	Octodon_degus
ENSCLAG00000006919	REXO4	77	60.227	ENSONIG00000020052	rexo4	56	63.866	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000006919	REXO4	80	68.030	ENSOANG00000002453	REXO4	69	68.030	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	67.593	ENSORLG00000006904	rexo4	52	67.442	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	67.593	ENSORLG00020013768	rexo4	52	67.442	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	67.130	ENSORLG00015012070	rexo4	52	66.977	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000006919	REXO4	80	57.348	ENSOMEG00000018327	rexo4	65	57.348	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	72.477	ENSOGAG00000014040	REXO4	78	72.477	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	75.375	ENSPPAG00000027911	REXO4	78	74.474	Pan_paniscus
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	69.113	ENSPPRG00000002894	REXO4	79	69.113	Panthera_pardus
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	58.154	ENSPTIG00000012007	REXO4	75	57.231	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	75.375	ENSPTRG00000023363	REXO4	78	74.474	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000006919	REXO4	99	74.699	ENSPANG00000026040	REXO4	78	73.795	Papio_anubis
ENSCLAG00000006919	REXO4	64	67.130	ENSPKIG00000024761	rexo4	51	67.130	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000006919	REXO4	85	61.538	ENSPSIG00000016908	REXO4	67	61.538	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000006919	REXO4	70	61.702	ENSPMGG00000005312	rexo4	61	59.746	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	72.727	ENSPEMG00000017982	Rexo4	80	71.818	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000006919	REXO4	95	61.491	ENSPCIG00000017379	REXO4	75	60.559	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	64.651	ENSPFOG00000017751	rexo4	54	63.182	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	64.651	ENSPLAG00000010487	rexo4	55	60.699	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	64.651	ENSPMEG00000020767	rexo4	56	60.699	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	64.651	ENSPREG00000021841	rexo4	53	63.182	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	75.375	ENSPPYG00000019735	REXO4	78	74.474	Pongo_abelii
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	63.609	ENSPCAG00000010581	REXO4	78	63.609	Procavia_capensis
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	75.831	ENSPCOG00000025466	REXO4	79	74.018	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000006919	REXO4	96	65.831	ENSPVAG00000001429	REXO4	75	65.831	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000006919	REXO4	98	51.807	ENSPNYG00000013712	rexo4	72	53.016	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000006919	REXO4	65	61.468	ENSPNAG00000019227	rexo4	55	56.917	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	70.606	ENSRNOG00000027867	Rexo4	80	70.909	Rattus_norvegicus
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ENSCLAG00000006919	REXO4	99	74.096	ENSRROG00000028864	REXO4	78	73.193	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000006919	REXO4	51	46.746	YOL080C	-	58	46.746	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCLAG00000006919	REXO4	100	58.859	ENSSBOG00000032587	REXO4	75	57.958	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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