EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000007473 (Gene tree)
Gene ID: 102022939
Gene Symbol: POLRMT
Alias: APOLMT|MTRNAP|MTRPOL|h-mtRPOL
Full Name: RNA polymerase mitochondrial
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13032 bases
Position: chrJH721955.1:7111260-7124291
Accession: 102022939
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000010827	RNA_pol	PF00940.19	4.7e-164	1	1
ENSCLAP00000010826	RNA_pol	PF00940.19	3.8e-156	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000010959	POLRMT-201	4714	-	ENSCLAP00000010826	1437 (aa)	-	-
ENSCLAT00000010960	POLRMT-202	4634	XM_005406033	ENSCLAP00000010827	1419 (aa)	XP_005406090	UPI00038EF595

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000007473's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000007473's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000007473	POLRMT	90	64.948	ENSG00000099821	POLRMT	100	64.948	Homo_sapiens
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	50.633	ENSAPOG00000003942	polrmt	87	46.998	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	87	66.150	ENSAMEG00000002745	POLRMT	99	66.913	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000007473	POLRMT	73	49.431	ENSACIG00000016078	polrmt	88	50.049	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	82	47.804	ENSAOCG00000020208	polrmt	91	45.875	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000007473	POLRMT	82	47.889	ENSAPEG00000007949	polrmt	87	47.635	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.027	ENSATEG00000024025	polrmt	85	45.844	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	51.462	ENSAPLG00000003051	POLRMT	99	51.325	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000007473	POLRMT	87	64.065	ENSANAG00000032916	POLRMT	99	64.000	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.609	ENSACLG00000003766	polrmt	89	46.003	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000007473	POLRMT	66	61.218	ENSAMXG00000018258	polrmt	77	61.218	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	64.862	ENSBTAG00000015051	POLRMT	99	64.862	Bos_taurus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	64.167	ENSCJAG00000012913	POLRMT	99	64.167	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	81	70.403	ENSCAFG00000019711	POLRMT	94	70.635	Canis_familiaris
ENSCLAG00000007473	POLRMT	81	70.403	ENSCAFG00020016843	POLRMT	94	70.635	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	65.527	ENSCHIG00000013267	POLRMT	99	65.402	Capra_hircus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	80	85.714	ENSCAPG00000016900	POLRMT	100	85.714	Cavia_aperea
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	77.531	ENSCPOG00000023061	POLRMT	97	78.649	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	63.919	ENSCCAG00000025014	POLRMT	99	64.418	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	68.436	ENSCATG00000040393	POLRMT	99	68.436	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	65.985	ENSCSAG00000012942	POLRMT	99	65.985	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	81	51.466	ENSCPBG00000009869	POLRMT	99	51.088	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000007473	POLRMT	56	42.752	ENSCSAVG00000000440	-	99	42.752	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	67.628	ENSCANG00000038011	POLRMT	100	67.628	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	84	69.109	ENSCGRG00001021311	Polrmt	99	75.566	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	65.799	ENSCGRG00000011134	Polrmt	99	65.799	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000007473	POLRMT	79	46.632	ENSCSEG00000002734	polrmt	85	46.282	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	95	46.829	ENSCVAG00000005949	polrmt	86	46.333	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.271	ENSDARG00000101220	polrmt	79	48.976	Danio_rerio
ENSCLAG00000007473	POLRMT	79	75.733	ENSDORG00000014125	Polrmt	93	75.733	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000007473	POLRMT	72	41.023	FBgn0261938	mtRNApol	77	41.188	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	61.382	ENSETEG00000003476	POLRMT	99	61.198	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000007473	POLRMT	64	48.925	ENSEBUG00000013453	-	99	48.817	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	66.970	ENSEASG00005021493	POLRMT	99	67.243	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	66.879	ENSECAG00000032711	POLRMT	93	71.230	Equus_caballus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	78	47.861	ENSELUG00000019319	polrmt	86	46.167	Esox_lucius
ENSCLAG00000007473	POLRMT	84	68.426	ENSFCAG00000018808	POLRMT	94	70.833	Felis_catus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	67	49.656	ENSFALG00000013910	POLRMT	99	47.071	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	90	77.325	ENSFDAG00000020312	POLRMT	100	77.160	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	84	49.661	ENSFHEG00000021239	polrmt	99	45.000	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	79	45.170	ENSGMOG00000011829	polrmt	98	44.303	Gadus_morhua
ENSCLAG00000007473	POLRMT	72	51.367	ENSGALG00000001377	POLRMT	99	47.089	Gallus_gallus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	50.342	ENSGAFG00000003953	polrmt	77	50.344	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	48.828	ENSGACG00000012957	polrmt	86	48.821	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	73	51.147	ENSGAGG00000005522	POLRMT	88	51.575	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000007473	POLRMT	69	81.470	ENSGGOG00000023264	-	94	81.470	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.706	ENSHBUG00000010005	polrmt	86	46.088	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000007473	POLRMT	99	78.162	ENSHGLG00000019286	POLRMT	100	75.496	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000007473	POLRMT	97	78.603	ENSHGLG00100005762	POLRMT	100	80.129	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.312	ENSHCOG00000001565	polrmt	81	49.018	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000007473	POLRMT	84	46.569	ENSIPUG00000000789	polrmt	98	46.078	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	80	81.100	ENSSTOG00000003431	POLRMT	93	81.100	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	81	69.020	ENSJJAG00000012916	Polrmt	94	74.032	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.265	ENSKMAG00000004426	polrmt	79	49.070	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.366	ENSLBEG00000016529	polrmt	90	45.100	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000007473	POLRMT	77	48.405	ENSLACG00000011518	POLRMT	90	48.314	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000007473	POLRMT	80	42.450	ENSLOCG00000005222	polrmt	86	42.182	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	82	67.857	ENSLAFG00000001860	POLRMT	96	67.575	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	68.000	ENSMFAG00000031466	POLRMT	99	68.000	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	67.814	ENSMNEG00000039129	POLRMT	99	68.000	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000007473	POLRMT	75	77.183	ENSMLEG00000037404	POLRMT	99	77.183	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.805	ENSMAMG00000019284	polrmt	76	49.804	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.609	ENSMZEG00005009932	polrmt	89	46.003	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000007473	POLRMT	73	50.577	ENSMGAG00000003243	POLRMT	96	50.888	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000007473	POLRMT	81	76.214	ENSMAUG00000019392	Polrmt	95	76.214	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	69.501	ENSMICG00000016701	POLRMT	100	69.224	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	87	63.956	ENSMOCG00000008868	Polrmt	100	63.303	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000007473	POLRMT	67	45.979	ENSMMOG00000000705	polrmt	76	45.842	Mola_mola
ENSCLAG00000007473	POLRMT	82	53.998	ENSMODG00000006478	POLRMT	94	54.377	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000007473	POLRMT	87	44.789	ENSMALG00000021224	polrmt	92	45.959	Monopterus_albus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	76	76.129	MGP_CAROLIEiJ_G0015538	Polrmt	100	70.208	Mus_caroli
ENSCLAG00000007473	POLRMT	78	76.613	ENSMUSG00000020329	Polrmt	96	76.613	Mus_musculus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	75	76.774	MGP_PahariEiJ_G0030951	Polrmt	100	70.439	Mus_pahari
ENSCLAG00000007473	POLRMT	76	76.774	MGP_SPRETEiJ_G0016356	Polrmt	100	70.901	Mus_spretus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	66.451	ENSMPUG00000009910	POLRMT	99	66.543	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	66.299	ENSMLUG00000009223	POLRMT	99	65.993	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	78	77.097	ENSNGAG00000005498	Polrmt	96	76.960	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000007473	POLRMT	83	49.208	ENSNBRG00000023530	polrmt	86	46.140	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	67.688	ENSNLEG00000000718	POLRMT	99	67.595	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000007473	POLRMT	60	73.266	ENSOPRG00000013579	POLRMT	73	73.266	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000007473	POLRMT	72	49.855	ENSONIG00000002405	polrmt	88	49.951	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	80	46.805	ENSORLG00000004329	polrmt	84	46.799	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	50.049	ENSORLG00020003896	polrmt	78	50.147	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	50.097	ENSORLG00015022238	polrmt	75	50.098	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	51.315	ENSOMEG00000008292	polrmt	78	51.322	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	69.778	ENSOGAG00000007912	POLRMT	100	69.593	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000007473	POLRMT	75	75.826	ENSOARG00000008898	POLRMT	91	75.826	Ovis_aries
ENSCLAG00000007473	POLRMT	89	62.762	ENSPPAG00000043321	-	99	62.762	Pan_paniscus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	90	63.613	ENSPPAG00000030853	POLRMT	99	63.613	Pan_paniscus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	74	76.547	ENSPPRG00000001547	POLRMT	87	76.547	Panthera_pardus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	90	63.724	ENSPTRG00000010157	POLRMT	96	63.724	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000007473	POLRMT	89	63.024	ENSPTRG00000039638	-	99	63.024	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000007473	POLRMT	87	68.279	ENSPANG00000006649	POLRMT	99	68.279	Papio_anubis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	84	46.578	ENSPKIG00000024580	polrmt	91	46.327	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.070	ENSPMGG00000014627	polrmt	85	48.966	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	77	76.935	ENSPEMG00000011671	Polrmt	93	76.935	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000007473	POLRMT	61	47.950	ENSPMAG00000005070	-	99	47.936	Petromyzon_marinus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	79	54.771	ENSPCIG00000006103	POLRMT	91	54.492	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.805	ENSPFOG00000003911	polrmt	87	46.082	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000007473	POLRMT	61	48.980	ENSPLAG00000005743	polrmt	76	48.973	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.757	ENSPMEG00000008947	polrmt	82	49.756	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.805	ENSPREG00000007650	polrmt	77	49.561	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000007473	POLRMT	82	71.429	ENSPPYG00000009282	POLRMT	100	71.429	Pongo_abelii
ENSCLAG00000007473	POLRMT	80	72.283	ENSPCAG00000010816	POLRMT	94	72.283	Procavia_capensis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	67.867	ENSPCOG00000014539	POLRMT	99	67.590	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000007473	POLRMT	89	63.209	ENSPVAG00000008403	POLRMT	100	62.976	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.315	ENSPNYG00000020790	polrmt	86	45.833	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000007473	POLRMT	77	47.101	ENSPNAG00000019790	polrmt	78	50.307	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	65.153	ENSRNOG00000024879	Polrmt	93	67.992	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	88	67.535	ENSRBIG00000006728	POLRMT	100	67.535	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000007473	POLRMT	88	67.628	ENSRROG00000040809	POLRMT	100	67.628	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	63.763	ENSSBOG00000025388	POLRMT	99	63.763	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	57	56.473	ENSSHAG00000009387	-	100	56.104	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	50.877	ENSSFOG00015005074	polrmt	89	47.168	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.951	ENSSMAG00000011851	polrmt	76	49.755	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	50.049	ENSSDUG00000004410	polrmt	83	47.438	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.951	ENSSLDG00000010643	polrmt	93	45.222	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	73	49.808	ENSSPAG00000018740	polrmt	90	46.377	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	85	67.278	ENSSSCG00000035693	POLRMT	99	67.745	Sus_scrofa
ENSCLAG00000007473	POLRMT	68	53.313	ENSTGUG00000000621	POLRMT	100	53.096	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000007473	POLRMT	73	48.038	ENSTRUG00000018040	polrmt	80	48.923	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	49.658	ENSTNIG00000010642	polrmt	99	49.462	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	65	78.118	ENSTTRG00000011329	POLRMT	75	78.118	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	86	67.094	ENSUAMG00000019616	POLRMT	100	67.094	Ursus_americanus
ENSCLAG00000007473	POLRMT	79	66.699	ENSVVUG00000022627	POLRMT	94	66.895	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000007473	POLRMT	71	50.888	ENSXETG00000006545	polrmt	83	50.592	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000007473	POLRMT	81	46.655	ENSXMAG00000012464	polrmt	87	46.484	Xiphophorus_maculatus