EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000007678 (Gene tree)
Gene ID: 102005746
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9620 bases
Position: chrJH721897.1:473192-482811
Accession: 102005746
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000011115	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.4e-41	1	1
ENSCLAP00000011115	DEAD	PF00270.29	9.6e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000011251	SKIV2L-201	3874	XM_005389400	ENSCLAP00000011115	1246 (aa)	XP_005389457	UPI00038EEB8B

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000007678's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000007678's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	76	36.886	ENSCLAG00000006622	MTREX	88	36.886

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.937	ENSG00000204351	SKIV2L	98	96.067	Homo_sapiens
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.270	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.178	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.178	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.128	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.113	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.270	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.285	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.190	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.124	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.845	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	61.142	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	65.255	ENSACAG00000011746	SKIV2L	98	66.348	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.339	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	93.339	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.252	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.303	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	59.377	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.298	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.258	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	93.258	Bos_taurus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	96	39.813	WBGene00008502	skih-2	99	39.593	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.178	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.178	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.857	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	92.857	Canis_familiaris
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.857	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	92.857	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.499	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	93.499	Capra_hircus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.697	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	92.697	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	94.783	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	94.783	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.018	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	93.018	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.777	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	92.777	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.857	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	92.857	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	87	64.912	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	64.912	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	94	50.934	ENSCING00000005576	-	99	50.764	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	93.012	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	93.012	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.184	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	93.184	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.102	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	61.322	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.053	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	61.075	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.079	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.176	Danio_rerio
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	94	93.333	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	87.740	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	93	44.313	FBgn0039117	tst	97	44.398	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	69	91.902	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	91.902	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	89	56.698	ENSEBUG00000013680	-	95	57.769	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	93	94.143	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	94.143	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	96	92.941	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	93.559	Equus_caballus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	54	98.419	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	98.419	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	59.921	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.081	Esox_lucius
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.579	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	93.579	Felis_catus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	90.537	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.457	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	59.952	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.236	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	59.185	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.286	Gadus_morhua
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	77	61.019	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.174	Gallus_gallus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.265	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.458	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.000	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.435	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.018	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	93.018	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.173	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.223	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.067	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	92.548	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	89.503	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	89.984	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	59.886	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.723	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	59.953	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	60.144	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.740	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	93.740	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	71	59.712	ENSLACG00000002986	-	73	59.548	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	91.894	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	91.894	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.098	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	93.098	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.018	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	93.018	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.018	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.018	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.777	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	92.777	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.952	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.223	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.094	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.142	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	70	51.572	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	51.572	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.221	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.548	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.857	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	92.857	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	91.179	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.259	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.531	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	59.464	Mola_mola
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	86.709	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	86.709	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	59.968	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.032	Monopterus_albus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.542	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	92.542	Mus_caroli
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.622	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	92.622	Mus_musculus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.783	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	92.783	Mus_pahari
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.221	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	92.221	Mus_spretus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.178	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	93.178	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.697	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	92.697	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.575	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	60.565	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	90.220	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.302	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	78	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.777	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	92.777	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	95.024	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	95.024	Octodon_degus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.833	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.167	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	94.061	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	94.061	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.551	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.847	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.472	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.779	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.283	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	61.285	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.795	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	61.997	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.419	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	93.419	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	87.940	ENSOARG00000002411	-	100	87.940	Ovis_aries
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	92.382	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	92.382	Pan_paniscus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.740	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	93.740	Panthera_pardus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.419	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	93.419	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.178	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	93.178	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	91.646	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	91.646	Papio_anubis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	59.811	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.984	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.016	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	60.325	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.943	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	92.943	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	86.960	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	86.960	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.966	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.156	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.094	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.285	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.887	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.075	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	58.734	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	59.951	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	92.536	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	92.536	Pongo_abelii
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	77	92.545	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	92.545	Procavia_capensis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.820	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	93.820	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	91.734	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	91.734	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	93	66.012	ENSPNYG00000017853	skiv2l	97	66.012	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	60.689	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	60.866	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.023	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	93.023	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	90.445	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	90.445	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.018	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	93.018	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	93	38.207	YLR398C	-	93	38.387	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.339	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	93.339	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	86.309	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	85.268	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.133	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.342	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.800	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	60.835	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.441	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.637	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.177	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.244	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	62.016	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	62.352	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	94	60.720	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.984	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	94.141	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.141	Sus_scrofa
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	85	54.982	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.268	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	59.522	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.097	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	94	92.638	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.638	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	88.764	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.764	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	93.660	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	93.660	Ursus_americanus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	93	93.971	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	93.971	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	93.073	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	93.073	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	58.983	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	59.239	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.606	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.688	Xiphophorus_couchianus
ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.076	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	61.267	Xiphophorus_maculatus