EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000008474 (Gene tree)
Gene ID: 102005883
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8456 bases
Position: chrJH721912.1:4848659-4857114
Accession: 102005883
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000012275	SYF2	PF08231.12	3.7e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000012417	SYF2-201	2820	XM_005394818	ENSCLAP00000012275	244 (aa)	XP_005394875	-

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000008474's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000008474's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000008474	SYF2	95	96.996	ENSG00000117614	SYF2	96	96.996	Homo_sapiens
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	84.685	ENSAPOG00000001174	syf2	98	82.833	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000008474	SYF2	80	96.410	ENSAMEG00000010134	-	100	96.410	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000008474	SYF2	96	93.249	ENSAMEG00000010115	-	98	93.249	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	81.532	ENSACIG00000023688	syf2	89	81.532	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000008474	SYF2	87	81.193	ENSAOCG00000010912	syf2	68	81.193	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000008474	SYF2	93	83.550	ENSAOCG00000022046	syf2	98	83.550	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000008474	SYF2	96	80.328	ENSAPEG00000018858	syf2	94	80.328	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000008474	SYF2	89	83.871	ENSATEG00000007745	syf2	98	81.116	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000008474	SYF2	82	89.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000008474	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000008474	SYF2	68	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.262	ENSANAG00000032473	SYF2	100	94.262	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	81.081	ENSACLG00000019916	syf2	99	78.723	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	78.279	ENSAMXG00000004051	syf2	100	78.279	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.469	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.915	Bos_taurus
ENSCLAG00000008474	SYF2	85	51.429	WBGene00019402	syf-2	99	47.845	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.672	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	94.672	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.276	ENSCAFG00000012895	-	100	92.276	Canis_familiaris
ENSCLAG00000008474	SYF2	96	85.897	ENSCAFG00000030331	-	99	85.897	Canis_familiaris
ENSCLAG00000008474	SYF2	74	88.462	ENSCAFG00020021094	-	83	96.795	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.276	ENSCAFG00020021091	-	100	92.276	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.469	ENSCHIG00000020874	SYF2	98	95.763	Capra_hircus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.443	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.443	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000008474	SYF2	81	98.485	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.485	Cavia_aperea
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	96.721	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	96.721	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.672	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	94.672	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.852	ENSCATG00000026917	SYF2	100	93.852	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.852	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	93.852	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000008474	SYF2	71	78.736	ENSCHOG00000005273	-	96	78.736	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000008474	SYF2	92	90.179	ENSCPBG00000025073	SYF2	92	89.083	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000008474	SYF2	86	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000008474	SYF2	86	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	80.738	ENSCANG00000037322	SYF2	100	80.738	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	91.803	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.803	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000008474	SYF2	82	96.482	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.482	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000008474	SYF2	89	78.899	ENSCSEG00000000117	syf2	99	74.684	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	82.353	ENSCVAG00000019543	syf2	99	78.151	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	78.279	ENSDARG00000004706	syf2	100	78.279	Danio_rerio
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.469	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.469	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.443	ENSDORG00000001274	Syf2	100	93.443	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000008474	SYF2	93	56.522	FBgn0033556	CG12343	99	56.522	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	77.828	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.522	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000008474	SYF2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	81.967	ENSEASG00005004232	-	100	81.967	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.061	ENSEASG00005004224	-	100	93.061	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000008474	SYF2	98	93.305	ENSECAG00000010440	-	100	93.305	Equus_caballus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.878	ENSECAG00000012023	-	100	93.878	Equus_caballus
ENSCLAG00000008474	SYF2	75	80.874	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.874	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000008474	SYF2	94	82.051	ENSELUG00000003465	syf2	98	82.051	Esox_lucius
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.089	ENSFCAG00000043095	-	100	93.089	Felis_catus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.902	ENSFCAG00000010324	-	85	93.902	Felis_catus
ENSCLAG00000008474	SYF2	84	85.784	ENSFALG00000000460	SYF2	93	81.624	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	96.311	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	96.311	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	67.411	ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000008474	SYF2	89	83.945	ENSGMOG00000019138	syf2	97	83.945	Gadus_morhua
ENSCLAG00000008474	SYF2	92	88.839	ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.349	Gallus_gallus
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	79.730	ENSGAFG00000019435	syf2	93	79.730	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000008474	SYF2	88	84.186	ENSGACG00000007305	syf2	98	79.915	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	92	90.625	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	89.520	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000008474	SYF2	95	97.425	ENSGGOG00000012796	SYF2	96	97.425	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000008474	SYF2	94	78.970	ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.970	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	96.311	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	96.311	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000008474	SYF2	93	84.581	ENSHGLG00000004304	-	100	79.508	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	96.311	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	96.311	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	78.279	ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.279	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000008474	SYF2	90	84.545	ENSIPUG00000019859	syf2	92	84.545	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	60	97.260	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	82	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000008474	SYF2	93	80.870	ENSKMAG00000013856	syf2	97	80.870	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000008474	SYF2	90	84.018	ENSLBEG00000014425	syf2	98	81.545	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000008474	SYF2	89	86.239	ENSLACG00000012064	SYF2	92	86.239	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	81.148	ENSLOCG00000002728	syf2	93	81.933	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	75	64.674	ENSLAFG00000030814	-	100	64.674	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.469	ENSLAFG00000023150	-	100	93.469	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.262	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	94.262	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.852	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.852	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.262	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	94.262	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.852	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.852	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000008474	SYF2	89	82.488	ENSMAMG00000010403	syf2	97	78.059	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	93	79.399	ENSMZEG00005006429	syf2	98	79.399	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000008474	SYF2	82	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.623	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.623	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000008474	SYF2	82	98.492	ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.852	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.852	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	80.180	ENSMMOG00000002396	syf2	93	80.180	Mola_mola
ENSCLAG00000008474	SYF2	92	89.427	ENSMODG00000013951	-	99	89.427	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	77.143	ENSMALG00000010706	syf2	100	77.551	Monopterus_albus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.033	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	93.033	Mus_caroli
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.033	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	93.033	Mus_musculus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.033	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	93.033	Mus_pahari
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.033	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	93.033	Mus_spretus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	91.870	ENSMPUG00000015801	-	100	91.870	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.276	ENSMPUG00000015802	-	100	92.276	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000008474	SYF2	94	95.633	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	95.633	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.089	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.089	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000008474	SYF2	95	72.034	ENSNBRG00000010720	syf2	99	72.034	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.672	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	94.672	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.623	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.623	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	85.656	ENSODEG00000014338	-	100	85.656	Octodon_degus
ENSCLAG00000008474	SYF2	98	95.798	ENSODEG00000017664	-	100	95.798	Octodon_degus
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	81.081	ENSONIG00000008213	syf2	99	78.723	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000008474	SYF2	83	91.089	ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	95.492	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	95.492	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000008474	SYF2	94	80.435	ENSORLG00000028820	syf2	99	80.435	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000008474	SYF2	99	78.099	ENSORLG00020018333	syf2	99	78.099	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000008474	SYF2	89	83.486	ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000008474	SYF2	96	80.335	ENSOMEG00000013911	syf2	99	80.335	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	95.492	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	95.492	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000008474	SYF2	80	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	67.179	Ovis_aries
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.713	ENSOARG00000006348	-	100	92.713	Ovis_aries
ENSCLAG00000008474	SYF2	95	97.425	ENSPPAG00000036579	SYF2	96	97.425	Pan_paniscus
ENSCLAG00000008474	SYF2	97	95.378	ENSPPRG00000001638	-	97	95.378	Panthera_pardus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.089	ENSPPRG00000001651	-	100	93.089	Panthera_pardus
ENSCLAG00000008474	SYF2	93	96.903	ENSPTIG00000005711	-	82	96.903	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.089	ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000008474	SYF2	95	97.425	ENSPTRG00000000352	SYF2	96	97.425	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.262	ENSPANG00000008139	SYF2	100	94.262	Papio_anubis
ENSCLAG00000008474	SYF2	94	81.034	ENSPKIG00000008130	syf2	99	81.034	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000008474	SYF2	96	86.383	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.383	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000008474	SYF2	98	78.151	ENSPMGG00000008755	syf2	92	78.151	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.443	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	93.443	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000008474	SYF2	92	94.222	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	93.450	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000008474	SYF2	98	76.471	ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.778	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000008474	SYF2	96	77.778	ENSPLAG00000006691	syf2	99	77.778	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000008474	SYF2	96	75.214	ENSPMEG00000011684	syf2	95	77.477	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000008474	SYF2	89	81.944	ENSPREG00000003009	syf2	97	78.205	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.672	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	94.672	Pongo_abelii
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	64.344	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.934	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	81.224	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.224	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	81.081	ENSPNYG00000004979	syf2	99	78.723	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	80.738	ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.738	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.033	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	93.033	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	91.803	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	91.803	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.262	ENSRROG00000001347	SYF2	100	94.262	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.443	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.443	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000008474	SYF2	84	94.175	ENSSHAG00000007152	-	100	94.175	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	86.747	ENSSHAG00000015630	-	100	86.747	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000008474	SYF2	97	79.661	ENSSFOG00015023647	syf2	99	79.661	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000008474	SYF2	93	79.399	ENSSMAG00000009867	syf2	98	79.399	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000008474	SYF2	89	83.486	ENSSDUG00000013072	syf2	100	77.049	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000008474	SYF2	89	83.486	ENSSLDG00000012677	syf2	100	77.049	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	74.694	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.694	Sorex_araneus
ENSCLAG00000008474	SYF2	94	87.773	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	87.773	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	95	79.149	ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.149	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.061	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.061	Sus_scrofa
ENSCLAG00000008474	SYF2	61	60.265	ENSTGUG00000001126	SYF2	87	59.887	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	76.639	ENSTRUG00000001499	syf2	95	77.083	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000008474	SYF2	91	79.372	ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	71.721	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	71.311	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.245	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.469	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	91.057	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.057	Ursus_americanus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	91.463	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.463	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.245	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.245	Vicugna_pacos
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.276	ENSVVUG00000027175	-	100	92.276	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000008474	SYF2	100	89.516	ENSVVUG00000027181	-	100	89.516	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000008474	SYF2	97	82.700	ENSXETG00000022797	syf2	95	82.700	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000008474	SYF2	88	81.860	ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.730	Xiphophorus_maculatus