EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000008603 (Gene tree)
Gene ID: 102027760
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 31306 bases
Position: chrJH721884.1:23003107-23034412
Accession: 102027760
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000012448	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.5e-28	1	2
ENSCLAP00000012448	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.5e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000012593	PAPOLG-201	6655	XM_005385754	ENSCLAP00000012448	741 (aa)	XP_005385811	UPI00038F1089

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000008603's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000008603's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	61.022	ENSCLAG00000016342	PAPOLA	99	61.015
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	67	72.233	ENSCLAG00000004689	PAPOLB	79	72.233

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.007	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	72.812	ENSAPOG00000004798	papolg	99	71.024	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	95.528	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	95.528	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.407	ENSACIG00000010546	papolg	99	69.717	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	72.812	ENSAOCG00000010254	papolg	89	73.077	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	72.944	ENSAPEG00000006944	papolg	89	73.210	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	72.606	ENSATEG00000009007	papolg	96	72.872	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	73.768	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.768	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	81	64.648	ENSACAG00000015048	-	100	64.648	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.007	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	95.007	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.638	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.741	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	73.148	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.148	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.547	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	95.547	Bos_taurus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.142	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.142	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.682	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.509	Canis_familiaris
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.047	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	95.047	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.277	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.277	Capra_hircus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.547	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	95.547	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	51	91.864	ENSCAPG00000014901	-	100	91.864	Cavia_aperea
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	97.301	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	97.301	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.142	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.142	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	91	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.277	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	95.277	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	89	92.716	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	92.716	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	67	64.752	ENSCING00000024664	-	94	64.752	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	65	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.412	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	95.412	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	94.134	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	94.134	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	94.134	ENSCGRG00000005552	-	100	94.134	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.705	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.241	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	75	82.226	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	73.148	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.148	Danio_rerio
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	93.792	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	93.792	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	58	99.301	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	73.577	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.514	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	65	56.695	ENSEBUG00000005042	-	82	56.695	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	60	70.833	ENSEBUG00000004020	papolg	90	70.833	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	96.221	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	96.221	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	96.086	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	95.664	Equus_caballus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	83.671	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.671	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	65.348	ENSELUG00000014497	papolg	99	65.868	Esox_lucius
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.682	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	95.682	Felis_catus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	65.786	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.786	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	96.896	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	96.896	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	66	61.877	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.035	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	83	83.032	ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.032	Gadus_morhua
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.400	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.400	Gallus_gallus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	68.668	ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.132	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	71.202	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.450	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.277	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	95.277	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.638	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.741	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	96.883	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	96.883	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	97.301	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	97.301	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.706	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.105	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	73.016	ENSIPUG00000021642	papolg	100	73.056	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	96.086	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	58	99.068	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	99.068	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.557	ENSKMAG00000016439	papolg	97	68.910	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	68.582	ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.582	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	69.920	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	69.920	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	73.368	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.368	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	93.809	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.547	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	95.547	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.547	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	95.547	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	86.595	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	86.595	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.142	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	95.142	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	71.979	ENSMAMG00000010667	papolg	99	70.013	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.638	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.708	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.817	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.817	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	94.407	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	94.407	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.951	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	95.951	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	94.467	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.467	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	71.258	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.523	Mola_mola
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	87.668	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.668	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	71.580	ENSMALG00000007012	papolg	89	71.788	Monopterus_albus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.412	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.533	Mus_caroli
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.142	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	Mus_musculus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	94.737	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.737	Mus_pahari
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.007	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	Mus_spretus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.682	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	95.682	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	93.360	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	93.360	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	94.737	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	94.737	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	62.929	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.456	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	58	98.834	ENSNLEG00000009507	-	100	98.834	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	82	77.397	ENSMEUG00000013605	-	88	77.397	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.412	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	95.412	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	57	94.601	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	Octodon_degus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	65.333	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.867	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	85.925	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	85.925	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	96.356	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	96.356	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.306	ENSORLG00000001577	papolg	97	70.238	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.948	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.784	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.306	ENSORLG00015008836	papolg	97	70.238	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.907	ENSOMEG00000001406	papolg	89	70.252	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	58	89.302	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	89.302	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.412	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	95.412	Ovis_aries
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.007	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	95.007	Pan_paniscus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.816	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	95.816	Panthera_pardus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.682	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.682	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.007	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	95.007	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	91.117	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	91.117	Papio_anubis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	72.836	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.836	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	95	70.506	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.506	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	98	79.155	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	79.155	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	93.724	ENSPEMG00000008960	-	100	93.724	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	66	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	53.203	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.203	Petromyzon_marinus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	88.251	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	88.251	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	68.799	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.669	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.079	ENSPLAG00000018445	papolg	89	70.106	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	68.840	ENSPMEG00000003961	papolg	89	70.185	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	68.401	ENSPREG00000010358	papolg	89	69.645	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.142	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.142	Pongo_abelii
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	82.449	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.449	Procavia_capensis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	84.615	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	84.615	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	89	93.440	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.440	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.889	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.889	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	73.698	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.698	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	94.737	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	94.737	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	89.339	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	89.339	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.277	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	95.277	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	94.872	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.872	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	94	88.369	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.369	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	63.575	ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.575	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.804	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.804	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	75	83.214	ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.375	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	72.289	ENSSDUG00000000912	papolg	99	71.024	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	72.244	ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.377	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	78.828	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.828	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.350	ENSSPAG00000009004	papolg	99	70.350	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.682	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.682	Sus_scrofa
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	73	76.994	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	76.994	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	70.643	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.643	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	66.316	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.316	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	87.755	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	87.755	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	90.418	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	90.418	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	95.498	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.498	Ursus_americanus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	95.498	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	95.498	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	91.293	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.293	Vicugna_pacos
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.951	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.951	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	74.403	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	67	85.170	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.170	Xiphophorus_couchianus
ENSCLAG00000008603	PAPOLG	74	82.600	ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	Xiphophorus_maculatus