EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000010194 (Gene tree)
Gene ID: 102003894
Gene Symbol: RPP38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2209 bases
Position: chrJH721889.1:19358765-19360973
Accession: 102003894
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000014779	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	9.3e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000014938	RPP38-201	1474	XM_005387145	ENSCLAP00000014779	284 (aa)	XP_005387202	UPI00038EFD6D

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	77.465	ENSG00000152464	RPP38	100	77.465	Homo_sapiens
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	42.908	ENSAPOG00000001240	rpp38	96	43.206	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	77.113	ENSAMEG00000018832	RPP38	100	77.113	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000010194	RPP38	92	41.026	ENSACIG00000011592	rpp38	97	41.463	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	41.837	ENSAOCG00000017293	rpp38	97	42.140	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	43.321	ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.617	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000010194	RPP38	96	44.211	ENSATEG00000000731	rpp38	98	44.211	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000010194	RPP38	92	51.711	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	52.727	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	43.173	ENSACLG00000016958	rpp38	99	44.366	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	42.804	ENSACLG00000016962	rpp38	99	44.014	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000010194	RPP38	89	39.608	ENSAMXG00000025023	rpp38	98	40.000	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	70.775	ENSBTAG00000007702	RPP38	100	70.775	Bos_taurus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	73.944	ENSCAFG00000024373	RPP38	100	74.296	Canis_familiaris
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	73.944	ENSCAFG00020008008	RPP38	100	74.296	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	69.366	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	69.366	Capra_hircus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	87.324	ENSCPOG00000003981	RPP38	100	87.324	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	76.316	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	76.056	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	80.282	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	80.282	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	71.930	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	72.982	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	71.930	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	72.982	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	41.912	ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.403	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000010194	RPP38	95	42.857	ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.007	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	44.030	ENSDARG00000040350	rpp38	96	44.118	Danio_rerio
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	76.408	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	76.408	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	70.775	ENSDORG00000009783	Rpp38	100	70.775	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	73.239	ENSETEG00000002839	RPP38	100	73.239	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000010194	RPP38	99	75.532	ENSEASG00005019783	RPP38	98	75.532	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	70.775	ENSEEUG00000014677	RPP38	100	70.775	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000010194	RPP38	88	45.818	ENSELUG00000010160	rpp38	94	46.316	Esox_lucius
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	72.183	ENSFCAG00000022449	RPP38	100	72.887	Felis_catus
ENSCLAG00000010194	RPP38	92	52.091	ENSFALG00000014804	RPP38	94	53.091	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	88.380	ENSFDAG00000018669	RPP38	100	88.380	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000010194	RPP38	95	43.103	ENSFHEG00000013741	rpp38	99	45.485	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000010194	RPP38	92	52.652	ENSGALG00000008794	RPP38	92	53.285	Gallus_gallus
ENSCLAG00000010194	RPP38	58	48.780	ENSGACG00000009258	rpp38	97	48.780	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	42.143	ENSHBUG00000010937	rpp38	97	43.206	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	85.915	ENSHGLG00000012144	RPP38	100	85.915	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000010194	RPP38	88	41.434	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	40.892	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	76.408	ENSSTOG00000025699	RPP38	98	76.408	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	79.298	ENSJJAG00000007523	Rpp38	100	79.298	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000010194	RPP38	88	42.007	ENSKMAG00000003986	rpp38	93	42.254	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000010194	RPP38	92	43.223	ENSLBEG00000006853	rpp38	94	43.590	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000010194	RPP38	95	50.699	ENSLACG00000006502	RPP38	100	51.000	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	48.763	ENSLOCG00000018347	rpp38	94	49.129	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	79.930	ENSLAFG00000000509	RPP38	100	79.930	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	75.940	ENSMMUG00000007679	RPP38	100	75.704	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000010194	RPP38	96	45.329	ENSMAMG00000012774	rpp38	96	44.792	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	43.173	ENSMZEG00005003189	rpp38	97	44.245	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	43.173	ENSMZEG00005003200	rpp38	99	44.366	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000010194	RPP38	92	51.866	ENSMGAG00000008217	RPP38	92	52.518	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	73.684	ENSMAUG00000003644	Rpp38	100	74.386	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	75.088	ENSMOCG00000007020	Rpp38	100	75.088	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000010194	RPP38	93	42.182	ENSMMOG00000003446	rpp38	94	41.818	Mola_mola
ENSCLAG00000010194	RPP38	95	66.052	ENSMODG00000024091	RPP38	100	66.316	Monodelphis_domestica
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ENSCLAG00000010194	RPP38	94	75.188	ENSOCUG00000022768	-	100	75.352	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000010194	RPP38	90	42.424	ENSORLG00000009219	rpp38	96	42.391	Oryzias_latipes
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ENSCLAG00000010194	RPP38	89	42.529	ENSORLG00015017702	rpp38	91	41.758	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000010194	RPP38	89	42.912	ENSOMEG00000005414	rpp38	99	42.955	Oryzias_melastigma
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ENSCLAG00000010194	RPP38	100	69.718	ENSOARG00000004534	RPP38	100	69.718	Ovis_aries
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ENSCLAG00000010194	RPP38	100	72.535	ENSPPRG00000015329	RPP38	100	73.239	Panthera_pardus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	71.831	ENSPTIG00000007188	RPP38	100	72.535	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	77.113	ENSPTRG00000002318	RPP38	91	77.113	Pan_troglodytes
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ENSCLAG00000010194	RPP38	100	74.737	ENSPEMG00000008375	Rpp38	100	76.140	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSCLAG00000010194	RPP38	61	48.588	ENSPFOG00000016823	rpp38	82	48.588	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000010194	RPP38	89	43.233	ENSPLAG00000007626	rpp38	91	43.233	Poecilia_latipinna
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ENSCLAG00000010194	RPP38	96	41.869	ENSPREG00000017744	rpp38	97	41.869	Poecilia_reticulata
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ENSCLAG00000010194	RPP38	94	77.068	ENSPVAG00000007155	RPP38	100	77.113	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	43.173	ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.245	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000010194	RPP38	89	42.023	ENSPNAG00000010633	rpp38	99	42.553	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000010194	RPP38	98	74.194	ENSRNOG00000038025	Rpp38	99	74.194	Rattus_norvegicus
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ENSCLAG00000010194	RPP38	96	53.986	ENSSPUG00000008560	-	97	53.986	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000010194	RPP38	99	56.643	ENSSPUG00000018363	-	99	56.643	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	43.223	ENSSPAG00000020387	rpp38	96	43.525	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	71.080	ENSSSCG00000027110	RPP38	100	71.080	Sus_scrofa
ENSCLAG00000010194	RPP38	92	52.852	ENSTGUG00000001366	RPP38	97	53.818	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000010194	RPP38	94	44.765	ENSTNIG00000001334	rpp38	96	44.765	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	70.423	ENSTTRG00000004420	RPP38	100	70.423	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	77.465	ENSUAMG00000002618	RPP38	100	77.465	Ursus_americanus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	77.544	ENSUMAG00000012382	RPP38	100	77.895	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000010194	RPP38	100	73.239	ENSVVUG00000005272	RPP38	100	73.239	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000010194	RPP38	92	48.529	ENSXETG00000003419	rpp38	97	49.110	Xenopus_tropicalis