EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000011507 (Gene tree)
Gene ID: 102023867
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 34279 bases
Position: chrJH721912.1:13934346-13968624
Accession: 102023867
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000016772	PAZ	PF02170.22	8.4e-29	1	1
ENSCLAP00000016771	PAZ	PF02170.22	8.5e-29	1	1
ENSCLAP00000016772	Piwi	PF02171.17	1.1e-110	1	1
ENSCLAP00000016771	Piwi	PF02171.17	1.1e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000016936	AGO1-202	2559	-	ENSCLAP00000016772	852 (aa)	-	-
ENSCLAT00000016935	AGO1-201	6008	XM_005395161	ENSCLAP00000016771	857 (aa)	XP_005395218	UPI000012D07D

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000011507	AGO1	98	83.890	ENSCLAG00000001381	AGO2	99	83.550
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	84.923	ENSCLAG00000013184	AGO3	99	85.006
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	83.372	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	83.372

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSAPOG00000024299	ago1	99	96.576	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000011507	AGO1	82	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSAOCG00000017727	ago1	99	96.576	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.576	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSATEG00000008523	ago1	99	96.576	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	93.794	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.794	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000011507	AGO1	92	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	95.921	ENSACLG00000000890	ago1	99	96.340	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000011507	AGO1	81	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	Bos_taurus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	99.762	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.072	ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	Capra_hircus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	78.763	ENSTSYG00000032426	-	99	79.499	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000011507	AGO1	90	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.301	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000011507	AGO1	86	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.767	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	94.780	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	95.921	ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.140	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.503	ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	Danio_rerio
ENSCLAG00000011507	AGO1	92	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000011507	AGO1	93	99.255	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000011507	AGO1	84	93.204	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.204	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	100	100.000	Equus_caballus
ENSCLAG00000011507	AGO1	92	91.614	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000011507	AGO1	92	97.059	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	100.000	Felis_catus
ENSCLAG00000011507	AGO1	92	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	92.680	ENSFHEG00000017927	ago1	99	93.001	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000011507	AGO1	88	84.646	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.883	Gallus_gallus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.270	ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000011507	AGO1	88	97.204	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000011507	AGO1	92	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	95.921	ENSHBUG00000010459	ago1	99	96.340	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	96.576	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.576	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.883	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSKMAG00000019464	ago1	99	96.576	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.270	ENSLBEG00000007694	ago1	99	96.694	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	93.522	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	94.056	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.340	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	100.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	95.289	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.255	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.033	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSMAMG00000008381	ago1	99	96.576	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	95.921	ENSMZEG00005007996	ago1	99	96.340	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	94.399	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.883	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000011507	AGO1	79	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
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ENSCLAG00000011507	AGO1	99	96.458	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.797	Monopterus_albus
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ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	100.000	Mus_pahari
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	100.000	Mus_spretus
ENSCLAG00000011507	AGO1	84	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000011507	AGO1	61	99.617	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.617	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.767	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.767	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000011507	AGO1	92	97.059	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000011507	AGO1	85	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000011507	AGO1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	100	100.000	Octodon_degus
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	96.340	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	91.003	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.977	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.883	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSORLG00000014965	ago1	99	96.576	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSORLG00020018253	ago1	99	96.576	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSORLG00015003287	ago1	99	96.576	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	ENSOMEG00000020528	ago1	99	96.576	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000011507	AGO1	99	100.000	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	100.000	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.883	Ovis_aries
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	100.000	Pan_paniscus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	100.000	Panthera_pardus
ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.767	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.767	Panthera_tigris_altaica
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ENSCLAG00000011507	AGO1	99	99.050	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
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ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.270	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
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