EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000011800 (Gene tree)
Gene ID: 102009928
Gene Symbol: POLR2I
Alias: RPB9|hRPB14.5
Full Name: RNA polymerase II subunit I
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1459 bases
Position: chrJH721928.1:2494120-2495578
Accession: 102009928
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000017189	RNA_POL_M_15KD	PF02150.16	6.1e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000017358	POLR2I-201	585	XM_005399922	ENSCLAP00000017189	125 (aa)	XP_005399979	UPI0000001B8F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSG00000105258	POLR2I	100	100.000	Homo_sapiens
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ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	96.694	ENSAOCG00000024378	polr2i	96	96.694	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	96.694	ENSAPEG00000021748	polr2i	96	96.694	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	96.694	ENSATEG00000000758	polr2i	96	96.694	Anabas_testudineus
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ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	97.521	ENSAMXG00000030198	polr2i	96	97.521	Astyanax_mexicanus
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ENSCLAG00000011800	POLR2I	99	62.097	WBGene00022400	rpb-9	74	62.097	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSCJAG00000009671	POLR2I	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSCAFG00000006601	POLR2I	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSCAFG00020018113	POLR2I	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSCHIG00000011961	POLR2I	100	100.000	Capra_hircus
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ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSTSYG00000028318	-	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSCPOG00000012097	POLR2I	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSCCAG00000022138	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	98.400	ENSCCAG00000032214	-	100	98.400	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSCATG00000017413	POLR2I	100	100.000	Cercocebus_atys
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ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	95.041	ENSCSEG00000002213	polr2i	96	95.041	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	95.041	ENSCVAG00000014797	polr2i	96	95.041	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	95.868	ENSDARG00000040443	polr2i	96	95.868	Danio_rerio
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ENSCLAG00000011800	POLR2I	91	78.070	ENSDORG00000029259	-	95	78.070	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000011800	POLR2I	89	76.577	ENSDORG00000028728	-	95	76.577	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000011800	POLR2I	77	76.042	ENSDORG00000028026	-	99	76.042	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000011800	POLR2I	94	78.632	FBgn0004855	RpII15	91	78.632	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSETEG00000012679	POLR2I	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	92.562	ENSEBUG00000007333	polr2i	100	95.146	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSEASG00005002231	POLR2I	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSECAG00000013654	POLR2I	100	100.000	Equus_caballus
ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	100.000	ENSEEUG00000002113	POLR2I	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	97.521	ENSELUG00000018012	polr2i	96	97.521	Esox_lucius
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ENSCLAG00000011800	POLR2I	97	94.215	ENSFHEG00000015659	polr2i	96	94.215	Fundulus_heteroclitus
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ENSCLAG00000011800	POLR2I	100	98.400	ENSOPRG00000008681	-	100	98.400	Ochotona_princeps
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