EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000012270 (Gene tree)
Gene ID: 102009620
Gene Symbol: XPO6
Alias: FLJ22519|KIAA0370|RANBP20
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 126592 bases
Position: chrJH721953.1:6172860-6299451
Accession: 102009620
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000017884	Xpo1	PF08389.12	1.3e-25	1	1
ENSCLAP00000017883	Xpo1	PF08389.12	6.4e-25	1	1
ENSCLAP00000017883	IBN_N	PF03810.19	1.8e-09	1	1
ENSCLAP00000017884	IBN_N	PF03810.19	1.9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000018062	XPO6-202	3644	-	ENSCLAP00000017884	1138 (aa)	-	-
ENSCLAT00000018061	XPO6-201	3906	XM_005405146	ENSCLAP00000017883	1124 (aa)	XP_005405203	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.598	ENSG00000169180	XPO6	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	75.997	ENSAPOG00000012873	xpo6	99	76.368	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.598	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	97.598	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.418	ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	77.511	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	77.511	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	77.422	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	77.422	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	77.196	ENSATEG00000002273	xpo6	99	77.148	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	94.217	ENSAPLG00000007480	XPO6	100	94.133	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	79.528	ENSACAG00000016883	XPO6	99	79.528	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.420	ENSANAG00000031761	XPO6	99	97.420	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.827	ENSACLG00000007048	xpo6	99	76.827	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	72.664	ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.664	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.242	ENSBTAG00000010309	XPO6	99	97.242	Bos_taurus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.687	ENSCJAG00000006014	XPO6	99	97.687	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.865	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	97.865	Canis_familiaris
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.954	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	98.002	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.153	ENSCHIG00000022341	XPO6	99	97.153	Capra_hircus
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	93.488	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	93.488	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	98.310	ENSCPOG00000012824	XPO6	99	98.310	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.331	ENSCCAG00000036360	XPO6	99	97.331	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.776	ENSCATG00000034030	XPO6	99	97.776	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000012270	XPO6	91	96.871	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	96.871	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000012270	XPO6	89	92.585	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	97.059	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	47.239	ENSCING00000006884	-	99	47.239	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	45.626	ENSCSAVG00000000850	-	100	45.587	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.598	ENSCANG00000041578	XPO6	99	97.598	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	96.797	ENSCGRG00001013173	Xpo6	99	96.797	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	76.089	ENSCSEG00000013622	xpo6	99	76.089	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.169	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	76.169	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000012270	XPO6	97	71.903	ENSDARG00000041217	xpo6	99	71.903	Danio_rerio
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.064	ENSDNOG00000012449	XPO6	99	97.064	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	96.975	ENSDORG00000000919	Xpo6	99	96.975	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000012270	XPO6	82	92.664	ENSETEG00000018768	XPO6	85	92.664	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	61.736	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	61.791	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.687	ENSEASG00005017296	XPO6	99	97.687	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.598	ENSECAG00000008601	XPO6	99	97.598	Equus_caballus
ENSCLAG00000012270	XPO6	97	90.284	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	90.284	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	78.390	ENSELUG00000009159	xpo6	99	79.375	Esox_lucius
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.687	ENSFCAG00000010309	XPO6	99	97.687	Felis_catus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	91.961	ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.961	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.598	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	97.598	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	75.798	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	75.798	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	93.861	ENSGALG00000035360	XPO6	99	93.861	Gallus_gallus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	74.911	ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.804	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000012270	XPO6	95	93.527	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	93.527	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.509	ENSGGOG00000005609	XPO6	99	97.509	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	75.239	ENSHBUG00000019504	xpo6	99	75.586	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.687	ENSHGLG00000009679	-	99	97.687	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000012270	XPO6	94	78.707	ENSHGLG00000003865	-	99	78.707	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.687	ENSHGLG00100003673	-	99	97.687	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000012270	XPO6	94	82.019	ENSHGLG00100001081	-	99	82.019	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	74.978	ENSHCOG00000004987	xpo6	99	75.153	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	72.067	ENSIPUG00000006516	xpo6	99	72.154	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	98.221	ENSSTOG00000012161	XPO6	99	98.221	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	96.708	ENSJJAG00000019392	Xpo6	99	96.708	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.046	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	76.046	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.730	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	76.730	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	85.320	ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.320	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000012270	XPO6	94	81.232	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.232	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	96.619	ENSLAFG00000011960	XPO6	98	99.176	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.776	ENSMFAG00000045067	XPO6	99	97.776	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.776	ENSMMUG00000018623	XPO6	99	97.776	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.776	ENSMNEG00000028587	XPO6	99	97.776	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.776	ENSMLEG00000029685	XPO6	99	97.776	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	75.737	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	76.377	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.916	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	76.916	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000012270	XPO6	97	93.254	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	93.254	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	86.185	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	85.918	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	98.043	ENSMICG00000001923	XPO6	99	98.043	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	96.619	ENSMOCG00000008015	Xpo6	99	96.619	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	76.800	ENSMMOG00000011992	xpo6	99	76.800	Mola_mola
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	95.018	ENSMODG00000015516	XPO6	99	95.018	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	70.328	ENSMALG00000020612	xpo6	99	70.593	Monopterus_albus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.420	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	98.901	Mus_caroli
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.331	ENSMUSG00000000131	Xpo6	99	97.331	Mus_musculus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.153	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	97.153	Mus_pahari
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.064	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	99	97.064	Mus_spretus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	96.708	ENSMPUG00000012920	XPO6	99	96.032	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	96.441	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	96.441	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.420	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	97.420	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	75.239	ENSNBRG00000007275	xpo6	99	75.586	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.598	ENSNLEG00000011518	XPO6	99	97.598	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000012270	XPO6	87	97.933	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	97.933	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.420	ENSODEG00000012917	XPO6	99	97.420	Octodon_degus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	75.065	ENSONIG00000019366	xpo6	99	75.326	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.598	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.598	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	74.956	ENSORLG00000011231	xpo6	100	74.384	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.649	ENSORLG00020000386	xpo6	99	76.649	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	74.867	ENSORLG00015003636	xpo6	99	74.867	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	75.196	ENSOMEG00000016505	xpo6	99	75.196	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	98.310	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	98.310	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.153	ENSOARG00000000960	XPO6	100	97.153	Ovis_aries
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.509	ENSPPAG00000033668	XPO6	99	97.509	Pan_paniscus
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	97.660	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	97.660	Panthera_pardus
ENSCLAG00000012270	XPO6	97	97.145	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	97.145	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.509	ENSPTRG00000007919	XPO6	99	97.509	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.776	ENSPANG00000017103	XPO6	99	97.776	Papio_anubis
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	79.804	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.804	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	91.457	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	91.457	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000012270	XPO6	99	76.439	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	76.439	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	96.797	ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	96.797	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	71.579	ENSPMAG00000003127	xpo6	100	71.516	Petromyzon_marinus
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ENSCLAG00000012270	XPO6	100	74.652	ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.652	Poecilia_formosa
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ENSCLAG00000012270	XPO6	97	74.217	ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.217	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.509	ENSPPYG00000007218	XPO6	99	97.509	Pongo_abelii
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