EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000012696 (Gene tree)
Gene ID: 102028505
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8159 bases
Position: chrJH721870.1:22434704-22442862
Accession: 102028505
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000018509	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	4.8e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000018690	TWISTNB-201	1077	XM_005377356	ENSCLAP00000018509	338 (aa)	XP_005377413	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.544	ENSG00000105849	TWISTNB	99	82.544	Homo_sapiens
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	67.013	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	77	92.079	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	54	59.341	ENSATEG00000017956	twistnb	88	46.386	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	50	65.680	ENSACAG00000011817	TWISTNB	86	65.680	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	98	81.627	ENSANAG00000026418	TWISTNB	99	81.548	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	57	56.545	ENSAMXG00000035868	twistnb	51	61.905	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	79.228	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	100	77.811	Bos_taurus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	98	82.583	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	82.493	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	76.232	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	99	78.261	Canis_familiaris
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	78.299	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	79.765	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	78.402	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	100	77.876	Capra_hircus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.301	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	99	82.301	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	91.395	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	100	91.124	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	81.657	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	99	81.657	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	81.953	ENSCATG00000035621	TWISTNB	99	81.953	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.249	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	99	82.249	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	79	88.636	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	78	88.636	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	92	60.502	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	95	59.306	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.544	ENSCANG00000038759	TWISTNB	99	82.544	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	73.810	ENSCGRG00001000499	Twistnb	100	73.810	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	60	57.143	ENSCVAG00000014324	twistnb	52	57.143	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	80.712	ENSDNOG00000006438	-	100	80.473	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	91	80.323	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	80.323	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	84.570	ENSEASG00005021702	TWISTNB	96	84.320	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	84.570	ENSECAG00000014563	TWISTNB	96	84.320	Equus_caballus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	89	45.833	ENSELUG00000000098	TWISTNB	82	45.485	Esox_lucius
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	81.306	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	99	80.952	Felis_catus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	84	52.961	ENSFALG00000009761	TWISTNB	97	52.632	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	98	88.554	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	100	88.166	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	51	60.345	ENSFHEG00000013318	twistnb	54	56.158	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	92	54.630	ENSGALG00000010863	TWISTNB	77	53.704	Gallus_gallus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	64	50.000	ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.544	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	99	82.544	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	89.349	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	89.053	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	98	89.458	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	89.053	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	93	41.916	ENSIPUG00000004117	twistnb	50	55.495	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	81.953	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	81.953	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	75.668	ENSJJAG00000015887	Twistnb	100	75.148	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	51	59.770	ENSKMAG00000001591	twistnb	54	57.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	96	45.349	ENSLBEG00000024225	twistnb	54	55.122	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	92	53.438	ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	50.765	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	54	62.983	ENSLOCG00000011399	twistnb	60	59.701	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	81.899	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	82.196	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.249	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	99	82.249	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	82.493	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	98	82.493	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	81.657	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	99	81.657	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.249	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	99	82.249	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	82.493	ENSMICG00000036489	TWISTNB	99	82.738	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	95	76.636	ENSMOCG00000003458	Twistnb	98	76.636	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	87	61.409	ENSMODG00000001402	-	70	60.248	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	77.286	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	100	77.286	Mus_caroli
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	76.331	ENSMUSG00000020561	Twistnb	100	76.696	Mus_musculus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	75.964	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	77.846	Mus_pahari
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	76.627	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	100	76.991	Mus_spretus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	81.009	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	93	81.250	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	92	78.526	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	100	80.192	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	59	84.422	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	84.422	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	58	55.612	ENSNBRG00000008652	twistnb	91	47.262	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	94	83.386	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	94	82.919	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	75.882	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	99	75.660	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	90.504	ENSODEG00000007222	TWISTNB	100	90.237	Octodon_degus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	86	46.926	ENSORLG00000004005	twistnb	83	43.697	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	91	43.614	ENSORLG00020002579	twistnb	51	59.487	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	91	43.614	ENSORLG00015013403	twistnb	82	43.503	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	81.711	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	99	81.711	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	78.635	ENSOARG00000009803	TWISTNB	99	78.402	Ovis_aries
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.249	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	99	82.544	Pan_paniscus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	79.822	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	99	79.822	Panthera_pardus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	89	79.402	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	79.333	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.840	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	99	82.840	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	81.953	ENSPANG00000015736	TWISTNB	99	81.953	Papio_anubis
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	56	62.632	ENSPKIG00000025635	twistnb	52	62.632	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	94	42.647	ENSPMGG00000019023	twistnb	51	57.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	87	56.229	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	96	55.108	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	81.657	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	99	79.586	Pongo_abelii
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	80.826	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	81.416	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	77.286	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	99	77.581	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	58	55.612	ENSPNYG00000002674	twistnb	52	55.612	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	93	47.059	ENSPNAG00000011956	twistnb	58	54.762	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	95	78.261	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	78.261	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	82.544	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	98	82.544	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	82.789	ENSRROG00000040155	TWISTNB	99	82.789	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	98	81.928	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	99	81.845	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	88	43.887	ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.000	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	91	43.731	ENSSMAG00000012792	twistnb	78	45.890	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	91	51.274	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	96	50.331	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	81.361	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	78.698	Sus_scrofa
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	85	46.575	ENSTNIG00000017778	twistnb	84	46.996	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	81.361	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	99	80.769	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	82.196	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.440	Ursus_americanus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	81.899	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	99	82.143	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	78.886	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	99	80.352	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000012696	TWISTNB	60	57.143	ENSXCOG00000020199	twistnb	55	57.143	Xiphophorus_couchianus