EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000012701 (Gene tree)
Gene ID: 102006779
Gene Symbol: POLR1E
Alias: FLJ13390|FLJ13970|PAF53|PRAF1
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16780 bases
Position: chrJH721879.1:28967083-28983862
Accession: 102006779
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000018514	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	3.2e-100	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000018696	POLR1E-201	5468	XM_005382878	ENSCLAP00000018514	381 (aa)	XP_005382935	-

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000012701's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000012701's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.978	ENSG00000137054	POLR1E	87	87.978	Homo_sapiens
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.028	ENSAPOG00000012452	polr1e	86	45.028	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	79.419	ENSAMEG00000010193	POLR1E	86	79.419	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000012701	POLR1E	89	46.903	ENSACIG00000009884	polr1e	85	46.903	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	48.895	ENSAOCG00000005665	polr1e	87	48.895	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	48.619	ENSAPEG00000020581	polr1e	87	48.619	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	48.619	ENSATEG00000020609	polr1e	87	48.619	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	74	56.575	ENSAPLG00000010340	POLR1E	86	56.575	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.978	ENSANAG00000038046	POLR1E	87	87.978	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	46.448	ENSACLG00000013685	polr1e	87	46.448	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000012701	POLR1E	93	43.820	ENSAMXG00000018181	polr1e	85	43.820	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	88.525	ENSBTAG00000012243	POLR1E	87	88.525	Bos_taurus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.066	ENSCJAG00000010512	POLR1E	91	86.066	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	88.798	ENSCAFG00000002377	POLR1E	87	88.798	Canis_familiaris
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	89.071	ENSCAFG00020017851	POLR1E	87	89.071	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.158	ENSCHIG00000019479	POLR1E	87	87.158	Capra_hircus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.158	ENSTSYG00000002075	POLR1E	87	87.158	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000012701	POLR1E	62	93.191	ENSCAPG00000015653	POLR1E	81	93.191	Cavia_aperea
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	93.443	ENSCPOG00000009965	POLR1E	88	93.443	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	79.235	ENSCCAG00000029460	POLR1E	86	79.235	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.885	ENSCATG00000031732	POLR1E	87	86.885	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.612	ENSCSAG00000010782	POLR1E	87	86.612	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	90	76.540	ENSCHOG00000013024	POLR1E	71	76.540	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	68.421	ENSCPBG00000006923	POLR1E	87	68.698	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.339	ENSCANG00000036112	POLR1E	87	86.339	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	83.646	ENSCGRG00001006197	Polr1e	86	83.646	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	83.110	ENSCGRG00000006430	Polr1e	86	83.110	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000012701	POLR1E	89	46.471	ENSCSEG00000005121	polr1e	82	46.471	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	44.475	ENSCVAG00000019759	polr1e	87	44.475	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.455	ENSDARG00000006434	polr1e	86	45.455	Danio_rerio
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	77.590	ENSDNOG00000010257	POLR1E	88	77.590	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	80	83.934	ENSETEG00000018204	POLR1E	85	83.934	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	89.344	ENSEASG00005000675	POLR1E	87	89.344	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	89.617	ENSECAG00000014669	POLR1E	87	89.617	Equus_caballus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	90	73.607	ENSEEUG00000011928	POLR1E	76	71.831	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	48.501	ENSELUG00000008150	polr1e	87	48.501	Esox_lucius
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.158	ENSFCAG00000013081	POLR1E	87	87.158	Felis_catus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	89	64.118	ENSFALG00000012950	POLR1E	85	64.118	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	93.716	ENSFDAG00000016917	POLR1E	88	93.716	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	46.133	ENSFHEG00000009801	polr1e	87	46.133	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	92	40.000	ENSGMOG00000003336	POLR1E	83	40.997	Gadus_morhua
ENSCLAG00000012701	POLR1E	94	63.611	ENSGALG00000005395	POLR1E	87	63.611	Gallus_gallus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	46.133	ENSGAFG00000004850	polr1e	87	46.133	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	43.869	ENSGACG00000016087	polr1e	87	43.869	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	93	60.112	ENSGAGG00000001659	POLR1E	85	59.945	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	88.251	ENSGGOG00000001882	POLR1E	87	88.251	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	46.721	ENSHBUG00000002559	polr1e	87	46.721	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	94.536	ENSHGLG00000002036	POLR1E	88	94.536	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	94.809	ENSHGLG00100012784	POLR1E	88	94.809	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.856	ENSHCOG00000002774	polr1e	86	46.685	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.355	ENSIPUG00000003019	polr1e	86	45.355	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	90.710	ENSSTOG00000009810	POLR1E	88	90.710	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	87.903	ENSJJAG00000020731	Polr1e	86	87.903	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.028	ENSKMAG00000000046	polr1e	87	45.028	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	47.671	ENSLBEG00000003104	polr1e	87	47.671	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000012701	POLR1E	80	64.078	ENSLACG00000003416	POLR1E	85	64.078	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	51.507	ENSLOCG00000012859	polr1e	87	51.507	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	88.556	ENSLAFG00000012831	POLR1E	87	88.556	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	86.631	ENSMFAG00000045465	POLR1E	85	86.957	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.158	ENSMMUG00000017892	POLR1E	87	87.158	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	79.787	ENSMNEG00000040283	POLR1E	84	87.861	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.158	ENSMLEG00000031135	POLR1E	87	87.158	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	46.448	ENSMAMG00000001260	polr1e	87	46.448	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	46.448	ENSMZEG00005021536	polr1e	87	46.448	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	85.014	ENSMAUG00000021044	Polr1e	85	85.014	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	89.344	ENSMICG00000003673	POLR1E	87	89.344	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	83.646	ENSMOCG00000012920	Polr1e	86	83.646	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	46.556	ENSMMOG00000007391	polr1e	86	46.556	Mola_mola
ENSCLAG00000012701	POLR1E	94	75.140	ENSMODG00000002884	POLR1E	88	75.140	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	47.268	ENSMALG00000002665	polr1e	87	47.268	Monopterus_albus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	97	82.114	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	94	82.114	Mus_caroli
ENSCLAG00000012701	POLR1E	97	82.385	ENSMUSG00000028318	Polr1e	94	82.385	Mus_musculus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	82.842	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	95	82.842	Mus_pahari
ENSCLAG00000012701	POLR1E	97	82.114	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	94	82.114	Mus_spretus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	78.657	ENSMPUG00000006040	POLR1E	89	78.657	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	85.791	ENSMLUG00000012688	POLR1E	86	85.791	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	90.385	ENSNGAG00000002520	Polr1e	84	90.385	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	46.995	ENSNBRG00000016822	polr1e	87	46.995	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.432	ENSNLEG00000003616	POLR1E	87	87.432	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000012701	POLR1E	70	83.721	ENSMEUG00000015372	-	70	83.721	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000012701	POLR1E	80	74.510	ENSOPRG00000014206	POLR1E	85	74.510	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	93.834	ENSODEG00000014565	POLR1E	87	93.834	Octodon_degus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	46.933	ENSONIG00000008921	polr1e	87	47.268	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.066	ENSOCUG00000024773	POLR1E	87	86.066	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.856	ENSORLG00000005143	polr1e	87	45.856	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000012701	POLR1E	86	46.201	ENSORLG00020007271	polr1e	84	46.201	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.580	ENSORLG00015000137	polr1e	87	45.580	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.304	ENSOMEG00000013264	polr1e	85	45.304	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	87.668	ENSOGAG00000012981	POLR1E	87	87.668	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	86.631	ENSOARG00000011465	POLR1E	86	86.631	Ovis_aries
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.705	ENSPPAG00000034566	POLR1E	87	87.705	Pan_paniscus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.885	ENSPPRG00000005649	POLR1E	87	86.885	Panthera_pardus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.885	ENSPTIG00000009774	POLR1E	87	86.885	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.705	ENSPTRG00000020944	POLR1E	87	87.705	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	87.158	ENSPANG00000025563	POLR1E	87	87.158	Papio_anubis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	47.123	ENSPKIG00000003562	polr1e	87	47.123	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000012701	POLR1E	90	63.953	ENSPSIG00000003274	POLR1E	81	63.953	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	90	47.093	ENSPMGG00000024169	polr1e	82	47.093	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	83.422	ENSPEMG00000019151	-	86	83.422	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	66.133	ENSPEMG00000022300	-	85	66.133	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000012701	POLR1E	94	74.022	ENSPCIG00000014798	POLR1E	88	74.022	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.078	ENSPFOG00000019627	polr1e	87	45.078	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	47.514	ENSPLAG00000022679	polr1e	87	47.514	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000012701	POLR1E	80	47.869	ENSPMEG00000022123	polr1e	78	47.869	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	46.409	ENSPREG00000009470	polr1e	86	46.409	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.885	ENSPPYG00000019061	POLR1E	88	86.885	Pongo_abelii
ENSCLAG00000012701	POLR1E	66	69.721	ENSPCAG00000004891	POLR1E	82	69.721	Procavia_capensis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	89.344	ENSPCOG00000027448	POLR1E	87	89.344	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000012701	POLR1E	90	90.616	ENSPVAG00000007940	POLR1E	72	90.616	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	46.721	ENSPNYG00000001032	polr1e	87	46.721	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000012701	POLR1E	93	43.454	ENSPNAG00000006987	polr1e	88	43.454	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000012701	POLR1E	98	82.038	ENSRNOG00000012664	Polr1e	86	82.038	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	90	86.510	ENSRBIG00000034214	POLR1E	86	86.585	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.612	ENSRROG00000031986	POLR1E	87	86.612	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	86.885	ENSSBOG00000021415	POLR1E	87	86.885	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	80	74.919	ENSSHAG00000016084	POLR1E	85	74.919	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000012701	POLR1E	93	49.020	ENSSFOG00015002293	polr1e	86	49.020	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	49.727	ENSSMAG00000011672	polr1e	81	49.591	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	47.814	ENSSDUG00000022279	polr1e	87	47.814	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	47.541	ENSSLDG00000024918	polr1e	87	47.541	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	70	72.845	ENSSARG00000009810	-	67	72.845	Sorex_araneus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	66.667	ENSSPUG00000009499	POLR1E	88	66.667	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	48.619	ENSSPAG00000021240	polr1e	87	48.619	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	89.344	ENSSSCG00000005347	POLR1E	87	89.344	Sus_scrofa
ENSCLAG00000012701	POLR1E	90	52.956	ENSTGUG00000007169	POLR1E	88	52.956	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	44.751	ENSTRUG00000020779	polr1e	85	45.988	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.730	ENSTNIG00000017812	polr1e	87	45.730	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	94	85.556	ENSTBEG00000013786	POLR1E	75	85.556	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000012701	POLR1E	90	89.244	ENSTTRG00000008294	POLR1E	73	89.244	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	89.617	ENSUAMG00000012474	POLR1E	99	89.617	Ursus_americanus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	89.617	ENSUMAG00000011496	POLR1E	87	89.617	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	90	82.991	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	82.991	Vicugna_pacos
ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	89.071	ENSVVUG00000019954	POLR1E	87	89.071	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	52.473	ENSXETG00000006533	polr1e	87	52.473	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.856	ENSXCOG00000013706	polr1e	86	45.856	Xiphophorus_couchianus
ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	46.961	ENSXMAG00000012484	polr1e	87	46.961	Xiphophorus_maculatus