EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000012817 (Gene tree)
Gene ID: 102007412
Gene Symbol: IPO4
Alias: FLJ23338|Imp4
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9011 bases
Position: chrJH721869.1:36214704-36223714
Accession: 102007412
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000018690	IBN_N	PF03810.19	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000018873	IPO4-201	3984	XM_005377029	ENSCLAP00000018690	1079 (aa)	XP_005377086	UPI00038EAF2E

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.287	ENSG00000196497	IPO4	100	90.102	Homo_sapiens
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.866	ENSAPOG00000019018	ipo4	93	46.959	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	84.551	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	83.164	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.188	ENSACIG00000004246	ipo4	94	46.569	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.078	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	45.262	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.078	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	45.262	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000012817	IPO4	92	46.315	ENSATEG00000017082	ipo4	99	46.414	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000012817	IPO4	86	52.743	ENSACAG00000003973	-	99	53.059	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	89.444	ENSANAG00000037973	IPO4	100	89.444	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000012817	IPO4	93	46.026	ENSACLG00000019742	ipo4	95	46.116	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.791	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.143	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	88.344	ENSBTAG00000002707	IPO4	100	88.437	Bos_taurus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	89.537	ENSCJAG00000006937	IPO4	100	89.537	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.547	ENSCAFG00000012049	IPO4	100	90.547	Canis_familiaris
ENSCLAG00000012817	IPO4	98	89.671	ENSCAFG00020002873	IPO4	100	87.623	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	88.426	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	88.426	Capra_hircus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.194	ENSTSYG00000002643	IPO4	100	89.917	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	94.347	ENSCPOG00000014783	IPO4	100	94.347	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.278	ENSCCAG00000037929	IPO4	100	90.278	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.657	ENSCATG00000040395	IPO4	100	90.472	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000012817	IPO4	90	56.231	ENSCPBG00000025757	IPO4	94	56.028	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000012817	IPO4	92	37.414	ENSCING00000008639	-	99	37.055	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000012817	IPO4	94	36.267	ENSCSAVG00000011482	-	100	36.047	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.009	ENSCANG00000029513	IPO4	100	89.917	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	83.904	ENSCGRG00001001217	Ipo4	100	83.904	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	83.904	ENSCGRG00000014404	Ipo4	100	83.904	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	43.911	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	44.004	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000012817	IPO4	98	44.414	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.190	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	47.544	ENSDARG00000041493	ipo4	94	48.630	Danio_rerio
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	89.435	ENSDNOG00000000366	IPO4	100	89.435	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	89.805	ENSDORG00000009274	Ipo4	100	89.805	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	85.411	ENSETEG00000018381	IPO4	100	85.411	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000012817	IPO4	91	90.705	ENSEASG00005011954	IPO4	96	90.705	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.454	ENSECAG00000009909	IPO4	100	90.454	Equus_caballus
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	47.286	ENSELUG00000020628	ipo4	99	47.286	Esox_lucius
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.639	ENSFCAG00000005587	IPO4	100	90.639	Felis_catus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	87.061	ENSFDAG00000000725	IPO4	100	86.285	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	39.352	ENSFHEG00000009351	ipo4	96	47.826	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	46.366	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.359	Gadus_morhua
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.812	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.577	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	46.090	ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.899	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.379	ENSGGOG00000016062	IPO4	100	90.194	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.060	ENSHBUG00000023269	ipo4	94	46.411	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	94.439	ENSHGLG00000002923	IPO4	100	94.439	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	94.069	ENSHGLG00100003725	IPO4	100	94.069	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.283	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	44.364	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	47.549	ENSIPUG00000001185	ipo4	99	47.500	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	91.111	ENSSTOG00000002288	IPO4	100	91.111	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	87.708	ENSJJAG00000019002	Ipo4	100	87.708	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.505	ENSKMAG00000004627	ipo4	94	46.289	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.659	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.742	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	49.863	ENSLACG00000001428	IPO4	99	49.909	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000012817	IPO4	75	48.196	ENSLOCG00000001149	ipo4	82	48.196	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	86.204	ENSLAFG00000015852	IPO4	100	86.111	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.749	ENSMFAG00000000743	IPO4	100	90.564	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.657	ENSMMUG00000012481	IPO4	100	90.472	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.564	ENSMNEG00000043531	IPO4	100	90.379	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.749	ENSMLEG00000042067	IPO4	100	90.564	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.471	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	45.656	Mastacembelus_armatus
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ENSCLAG00000012817	IPO4	100	81.054	ENSMOCG00000020462	Ipo4	100	81.423	Microtus_ochrogaster
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ENSCLAG00000012817	IPO4	99	81.036	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	81.869	Mus_caroli
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ENSCLAG00000012817	IPO4	100	80.759	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	100	81.591	Mus_pahari
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	81.146	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	100	81.146	Mus_spretus
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ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.706	ENSONIG00000014574	ipo4	99	45.614	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	88.089	ENSOCUG00000002881	IPO4	100	88.550	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.069	ENSORLG00000006457	ipo4	99	45.446	Oryzias_latipes
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ENSCLAG00000012817	IPO4	98	45.438	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	45.572	Oryzias_melastigma
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ENSCLAG00000012817	IPO4	100	86.691	ENSOARG00000019188	IPO4	100	86.691	Ovis_aries
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	89.177	ENSPPAG00000035476	IPO4	100	88.622	Pan_paniscus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.454	ENSPPRG00000023607	IPO4	100	90.454	Panthera_pardus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.547	ENSPTIG00000008720	IPO4	100	90.547	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.472	ENSPTRG00000006200	IPO4	100	90.287	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.564	ENSPANG00000026278	IPO4	100	90.379	Papio_anubis
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	46.574	ENSPKIG00000007683	-	99	46.389	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	48.527	ENSPKIG00000007830	ipo4	94	50.293	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	43.923	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	43.923	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	82.870	ENSPEMG00000016160	Ipo4	100	83.241	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000012817	IPO4	95	74.829	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	75.418	Phascolarctos_cinereus
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ENSCLAG00000012817	IPO4	100	88.519	ENSPCOG00000015319	IPO4	100	88.519	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000012817	IPO4	100	90.185	ENSPVAG00000010755	IPO4	100	90.185	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.700	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	44.875	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000012817	IPO4	99	47.919	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	48.011	Pygocentrus_nattereri
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