EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000012953 (Gene tree)
Gene ID: 102022407
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 50563 bases
Position: chrJH721884.1:22370006-22420568
Accession: 102022407
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000018916	CRM1_C	PF08767.11	6.8e-135	1	1
ENSCLAP00000018916	Xpo1	PF08389.12	5e-41	1	1
ENSCLAP00000018916	IBN_N	PF03810.19	2.2e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000019101	XPO1-201	4772	XM_005385738	ENSCLAP00000018916	1071 (aa)	XP_005385795	UPI00038EC16D

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	90.319	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.319	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.078	ENSAPOG00000004984	-	100	96.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.627	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.627	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	92.660	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.660	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	96.383	ENSACIG00000010818	-	100	96.383	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.970	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.970	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.078	ENSAOCG00000010121	-	100	96.078	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.078	ENSAPEG00000007038	-	100	96.078	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000012953	XPO1	91	92.482	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.482	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.597	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.597	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.078	ENSATEG00000008816	-	100	96.078	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.440	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.440	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.253	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.253	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.599	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	92.979	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.979	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	95.892	ENSACLG00000015192	-	100	95.892	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.452	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.452	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	93.750	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.750	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.720	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.720	Bos_taurus
ENSCLAG00000012953	XPO1	99	51.848	WBGene00002078	xpo-1	99	51.848	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.599	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.720	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.720	Canis_familiaris
ENSCLAG00000012953	XPO1	93	99.598	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.598	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.720	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.720	Capra_hircus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.720	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.720	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000012953	XPO1	53	95.390	ENSCAPG00000006454	-	100	95.390	Cavia_aperea
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.786	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	98.786	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	79.592	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.777	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.741	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.404	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.599	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000012953	XPO1	83	99.611	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.611	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.346	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.346	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	81.099	ENSCING00000024562	-	100	81.099	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000012953	XPO1	99	80.112	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.112	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	94.491	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.693	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.693	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.693	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	95.213	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.213	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	95.985	ENSCVAG00000016788	-	100	95.985	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.223	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.223	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	93.091	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.046	Danio_rerio
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.825	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.825	Danio_rerio
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.627	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.627	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000012953	XPO1	92	96.081	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.081	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000012953	XPO1	99	71.321	FBgn0020497	emb	99	71.321	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000012953	XPO1	94	98.155	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.155	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000012953	XPO1	90	79.772	ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.720	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.720	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.720	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.720	Equus_caballus
ENSCLAG00000012953	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	95.000	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.000	Esox_lucius
ENSCLAG00000012953	XPO1	87	92.827	ENSELUG00000014306	-	99	92.827	Esox_lucius
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.720	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.720	Felis_catus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.160	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.160	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.413	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	98.413	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.503	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.503	Fundulus_heteroclitus
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ENSCLAG00000012953	XPO1	88	92.553	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.553	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000012953	XPO1	91	96.087	ENSGAFG00000003355	-	98	96.087	Gambusia_affinis
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	95.798	ENSGACG00000002743	-	100	95.798	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.253	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.253	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.599	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	92.157	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.157	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	95.985	ENSHBUG00000020037	-	100	95.985	Haplochromis_burtoni
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.907	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.907	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	95.213	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.213	Hippocampus_comes
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.533	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.533	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.627	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.627	Jaculus_jaculus
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.410	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.410	Kryptolebias_marmoratus
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.078	ENSLBEG00000005740	-	100	96.078	Labrus_bergylta
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.919	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.919	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.346	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.346	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.599	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.599	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.599	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.744	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.744	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.877	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.877	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	95.985	ENSMAMG00000010568	-	100	95.985	Mastacembelus_armatus
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	95.892	ENSMZEG00005018158	-	98	96.087	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000012953	XPO1	68	99.174	ENSMGAG00000001496	-	100	99.174	Meleagris_gallopavo
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.880	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.880	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	92.553	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.553	Mola_mola
ENSCLAG00000012953	XPO1	87	96.051	ENSMMOG00000008001	-	99	96.051	Mola_mola
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	95.612	ENSMALG00000007085	-	100	95.612	Monopterus_albus
ENSCLAG00000012953	XPO1	88	91.711	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	91.711	Monopterus_albus
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ENSCLAG00000012953	XPO1	100	92.157	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	92.157	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000012953	XPO1	100	94.722	ENSNLEG00000009680	XPO1	100	94.722	Nomascus_leucogenys
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