EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000013442 (Gene tree)
Gene ID: 102019909
Gene Symbol: TNPO2
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19219 bases
Position: chrJH721875.1:31807701-31826919
Accession: 102019909
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000019589	IBN_N	PF03810.19	5.6e-16	1	1
ENSCLAP00000019590	IBN_N	PF03810.19	5.8e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000019783	TNPO2-202	4827	XM_013512350	ENSCLAP00000019590	897 (aa)	XP_013367804	UPI00022B5FEE
ENSCLAT00000019782	TNPO2-201	5495	XM_005381021	ENSCLAP00000019589	887 (aa)	XP_005381078	UPI00022B5FED

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000013442	TNPO2	99	84.893	ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	84.893

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.443	ENSG00000105576	TNPO2	100	99.478	Homo_sapiens
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.801	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	92.801	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	82	90.759	ENSAPOG00000013185	-	96	90.759	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	97.770	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	97.770	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000013442	TNPO2	87	91.969	ENSACIG00000009586	-	100	91.969	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	87	92.996	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	93.126	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.801	ENSAOCG00000010152	-	100	92.801	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.801	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	92.801	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.801	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	92.801	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.801	ENSAPEG00000013268	-	100	92.801	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.688	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	92.688	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.576	ENSATEG00000019171	-	100	92.576	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	96.396	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	96.396	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.324	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	99.324	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.913	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	92.913	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	86.502	ENSACLG00000020672	-	100	86.614	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	91.242	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	91.131	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.324	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	99.324	Bos_taurus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.331	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.331	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.549	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	99.549	Canis_familiaris
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.549	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.549	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	95.764	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	95.764	Capra_hircus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.436	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.436	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000013442	TNPO2	94	98.451	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	98.451	Cavia_aperea
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	100.000	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.436	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	99.436	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.443	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	99.443	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.436	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	99.436	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	96.622	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	96.622	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000013442	TNPO2	96	99.532	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	99.532	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.554	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	99.554	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.554	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	99.554	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000013442	TNPO2	87	90.439	ENSCSEG00000011477	-	100	90.568	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	88.876	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	88.764	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	91.348	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	91.348	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.688	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	92.688	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	89.651	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	89.876	Danio_rerio
ENSCLAG00000013442	TNPO2	88	89.103	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	89.103	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	93.764	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	97.810	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	72.707	FBgn0024921	Tnpo	100	72.595	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000013442	TNPO2	92	90.566	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	90.566	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.324	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	99.324	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.436	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	99.436	Equus_caballus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	80	89.793	ENSELUG00000016542	-	99	83.140	Esox_lucius
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.342	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	92.342	Esox_lucius
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.443	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	99.443	Felis_catus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.889	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	99.889	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000013442	TNPO2	97	92.093	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	92.093	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	91.573	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	91.573	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	80	90.865	ENSGMOG00000014237	-	90	90.865	Gadus_morhua
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	85.090	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	85.090	Gadus_morhua
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.688	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	92.688	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	91.910	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	91.910	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	96.734	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	96.734	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.913	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	92.913	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.688	ENSHBUG00000018317	-	100	92.688	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.775	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	99.775	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.220	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	99.270	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	91.564	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	91.339	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.688	ENSHCOG00000020440	-	100	92.688	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.351	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	92.351	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.013	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	92.013	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.443	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	99.443	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.443	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	99.443	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.576	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	92.576	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	90.643	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	90.643	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	93.026	ENSLBEG00000005301	-	100	93.026	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.913	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	92.913	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	90.981	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	90.981	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	94.151	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.220	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.220	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.443	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	99.443	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.443	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	99.443	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.443	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	99.443	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000013442	TNPO2	96	99.537	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	99.537	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	90.899	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	90.899	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.801	ENSMAMG00000011862	-	100	92.801	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	88.652	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.913	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	92.913	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.688	ENSMZEG00005007408	-	100	92.688	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.436	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	99.436	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.549	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	99.549	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000013442	TNPO2	88	91.165	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	92.088	Mola_mola
ENSCLAG00000013442	TNPO2	87	87.468	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	87.209	Mola_mola
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	97.664	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	97.664	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.688	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	92.688	Monopterus_albus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	91.451	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	91.789	Monopterus_albus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.331	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	99.331	Mus_caroli
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.331	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	99.331	Mus_musculus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.108	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	99.108	Mus_pahari
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.331	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	99.331	Mus_spretus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.549	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	99.549	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000013442	TNPO2	96	99.532	ENSMLUG00000012669	TNPO2	99	99.532	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.554	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	99.554	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.688	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	92.688	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	87.739	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	87.739	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	90.078	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	90.078	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	91.546	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	91.546	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.889	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	99.889	Octodon_degus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.102	ENSONIG00000017706	-	100	92.102	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.801	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	92.801	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	96.171	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	96.171	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	80.968	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	80.968	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.576	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	92.576	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000013442	TNPO2	56	90.400	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	90.800	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000013442	TNPO2	56	90.200	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	90.600	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	92.576	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	92.576	Oryzias_latipes_hni
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ENSCLAG00000013442	TNPO2	56	90.400	ENSORLG00015003941	TNPO2	99	90.800	Oryzias_latipes_hsok
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