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Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000014484 (Gene tree)
Gene ID: 102015233
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 173572 bases
Position: chrJH721894.1:6420854-6594425
Accession: 102015233
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000021139	ResIII	PF04851.15	1.9e-08	1	1
ENSCLAP00000021142	ResIII	PF04851.15	1.9e-08	1	1
ENSCLAP00000021141	ResIII	PF04851.15	2e-08	1	1
ENSCLAP00000021140	ResIII	PF04851.15	2e-08	1	1
ENSCLAP00000021140	BRK	PF07533.16	1.9e-17	1	1
ENSCLAP00000021142	BRK	PF07533.16	2e-17	1	1
ENSCLAP00000021139	BRK	PF07533.16	2.1e-17	1	1
ENSCLAP00000021141	BRK	PF07533.16	2.1e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000021346	SMARCA2-207	204	-	ENSCLAP00000021145	68 (aa)	-	UPI0007699FBA
ENSCLAT00000021347	SMARCA2-208	783	-	ENSCLAP00000021146	260 (aa)	-	-
ENSCLAT00000021344	SMARCA2-205	3436	XM_013516311	ENSCLAP00000021143	276 (aa)	XP_013371765	UPI00038EA45D
ENSCLAT00000021345	SMARCA2-206	837	-	ENSCLAP00000021144	278 (aa)	-	-
ENSCLAT00000021342	SMARCA2-203	4812	-	ENSCLAP00000021141	1603 (aa)	-	-
ENSCLAT00000021343	SMARCA2-204	4755	-	ENSCLAP00000021142	1584 (aa)	-	-
ENSCLAT00000021340	SMARCA2-201	7322	XM_005388600	ENSCLAP00000021139	1573 (aa)	XP_005388657	UPI00038E9523
ENSCLAT00000021341	SMARCA2-202	8469	XM_005388607	ENSCLAP00000021140	1607 (aa)	XP_005388664	-
ENSCLAT00000021348	SMARCA2-209	4684	-	ENSCLAP00000021147	149 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	96	76.316	ENSCLAG00000011946	SMARCA4	98	76.020

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	97.462	ENSG00000080503	SMARCA2	100	99.329	Homo_sapiens
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.653	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.208	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	90	88.247	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	99.135	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	79.537	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.250	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.388	ENSAOCG00000009647	-	97	80.233	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.528	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	80.143	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	80.940	ENSATEG00000006916	SMARCA2	97	80.180	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	89	89.250	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.835	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	89.962	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	89.581	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	97.714	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	97.714	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.643	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.326	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	82.103	ENSAMXG00000012404	smarca2	97	82.288	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.698	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	96.698	Bos_taurus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	97.953	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	97.863	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.317	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	96.508	Canis_familiaris
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	77	94.577	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	98	94.577	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.698	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	96.698	Capra_hircus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.048	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.532	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	95.003	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	100	94.940	Cavia_aperea
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	98.158	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	98.158	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	97.778	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	97.778	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.639	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	96.931	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	94	97.013	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	97.013	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	86	91.327	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	87	91.327	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	91.082	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	95.133	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	97.270	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	97.270	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	89.510	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	89.404	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	77.565	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	97	77.073	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	84	79.689	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	75	86.444	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	82.024	ENSDARG00000008904	smarca2	97	82.066	Danio_rerio
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	94.539	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	94.539	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	97.208	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	97.208	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	79	58.960	FBgn0000212	brm	71	62.932	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	86	62.116	ENSEBUG00000002449	-	89	68.465	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	95	69.902	ENSEBUG00000011442	-	96	70.220	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.762	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	96.762	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	66	97.222	ENSEEUG00000015540	-	69	97.222	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	92	80.923	ENSELUG00000010318	smarca2	96	78.999	Esox_lucius
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	95.873	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	96.063	Felis_catus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	91.614	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	90.167	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	95.948	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	97.318	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.810	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.626	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	98	77.500	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.249	Gadus_morhua
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	92.186	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.550	Gallus_gallus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	95	76.576	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	93	76.119	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	79.962	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	78.544	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	91.387	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	91.741	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	93.071	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	87	94.923	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.112	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	79.717	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	97.643	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	97.643	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.696	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	96.696	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	89	74.805	ENSHCOG00000015348	-	74	86.647	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.495	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	81.441	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	97.714	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	97.714	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	97.022	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	97.022	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.236	ENSKMAG00000015844	-	98	79.669	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	98	83.941	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	84.201	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	93.463	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.561	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.058	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	96.058	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	97.460	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	97.460	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.956	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	96.956	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	94.723	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	94.914	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	81.219	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.428	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.590	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	97	80.273	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	77	77.822	ENSMGAG00000005160	-	100	76.760	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.571	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	96.698	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.576	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	96.576	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	78.914	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	97	78.879	Mola_mola
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	91.719	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	93.261	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	80.653	ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.974	Monopterus_albus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.465	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	96.465	Mus_caroli
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.462	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.707	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	96.707	Mus_pahari
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.275	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	99	100.000	Mus_spretus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	79	98.980	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	98.980	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	90.635	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	83	93.313	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	95.957	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	95.578	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	95	67.787	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	94.469	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.469	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	85.185	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	85.122	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	90.754	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.944	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	97.772	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	97.772	Octodon_degus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	80.730	ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.295	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.715	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	96.715	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	79.762	ENSORLG00000020820	SMARCA2	79	86.193	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	79.912	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	79.198	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	80.934	ENSOMEG00000009736	-	100	79.510	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	93.213	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	80	99.209	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	95.564	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	95.564	Ovis_aries
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	93.071	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	93.903	Pan_paniscus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	95.937	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	96.127	Panthera_pardus
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	95.868	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	95.486	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	90.253	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	90.127	Papio_anubis
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	83.006	ENSPKIG00000018469	-	100	82.338	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	91.053	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	90.926	Pelodiscus_sinensis
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