EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000014733 (Gene tree)
Gene ID: 102020875
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36993 bases
Position: chrJH721911.1:17653125-17690117
Accession: 102020875
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000021525	GTP_EFTU	PF00009.27	2.6e-45	1	1
ENSCLAP00000021526	GTP_EFTU	PF00009.27	8.7e-40	1	1
ENSCLAP00000021526	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	7.4e-13	1	1
ENSCLAP00000021525	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	7.8e-13	1	1
ENSCLAP00000021525	EFG_IV	PF03764.18	2.1e-23	1	1
ENSCLAP00000021526	EFG_IV	PF03764.18	2.1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000021728	EFTUD2-201	5709	XM_005394553	ENSCLAP00000021525	972 (aa)	XP_005394610	UPI00038EF52E
ENSCLAT00000021729	EFTUD2-202	2898	-	ENSCLAP00000021526	965 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000014733's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000014733's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	74	33.803	ENSCLAG00000010155	EFL1	90	34.444
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	87	38.832	ENSCLAG00000014112	EEF2	99	38.832
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	51	31.944	ENSCLAG00000002503	GFM1	58	31.944

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.975	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.074	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	88.477	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.374	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	87	88.000	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.000	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.975	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.387	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.284	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	99	93.718	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	93.718	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	96.811	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.811	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.868	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.975	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.709	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	98.971	Bos_taurus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	99	69.938	WBGene00001166	eftu-2	99	69.628	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.868	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.074	Canis_familiaris
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.074	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.971	Capra_hircus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.663	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.663	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.177	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	99.177	Cavia_aperea
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.177	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	98.868	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.868	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.868	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	91	86.261	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.261	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.942	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.942	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	77.949	ENSCING00000009372	-	100	77.949	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	99	77.699	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.599	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	98.868	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.765	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	98.765	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.358	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.255	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.975	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.872	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.059	Danio_rerio
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.251	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.251	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.971	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	74.872	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	87.204	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.074	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	98.971	Equus_caballus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.638	Esox_lucius
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.971	Felis_catus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.428	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.428	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.975	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	90.741	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.255	Gadus_morhua
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.325	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.060	Gallus_gallus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.461	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.152	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	98.868	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.872	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.868	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	90.844	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.844	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	93.107	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.107	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	96	98.718	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.718	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.564	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.255	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	95	91.478	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	94.136	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.770	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	91.770	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.354	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.354	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	98.868	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	98.868	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	98.868	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.181	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.078	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.975	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.872	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.228	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.228	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	98.971	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	98.868	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSMOCG00000009039	-	100	98.868	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	92	81.236	ENSMOCG00000017653	-	90	81.236	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	87	93.765	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.765	Mola_mola
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.765	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	87	92.000	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.000	Monopterus_albus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	98.765	Mus_caroli
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	98.765	Mus_musculus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.765	Mus_pahari
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	98.765	Mus_spretus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	97	98.835	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	98.835	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.074	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.971	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.872	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	97	97.024	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.024	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	95.062	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.062	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	90.638	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.638	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSODEG00000018041	-	100	98.868	Octodon_degus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.975	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.872	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.868	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.255	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.255	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.358	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.358	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.358	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.246	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	96.708	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	96.708	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	98.971	Ovis_aries
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	98.971	Pan_paniscus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.074	Panthera_pardus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.074	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.971	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	98.868	Papio_anubis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	93	96.582	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	84.568	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.362	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.971	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	98.971	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	98.765	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.428	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.428	Pongo_abelii
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	94.547	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.547	Procavia_capensis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.765	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	94.342	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.342	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.872	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.770	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.765	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	98.765	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.765	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	97	33.992	YKL173W	SNU114	97	33.696	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.868	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	97	98.721	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.721	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.255	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.255	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.564	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.461	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.181	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.078	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	90.226	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.226	Sorex_araneus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	96.914	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.914	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.181	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.078	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.868	Sus_scrofa
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	84	96.715	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.715	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.255	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	86.783	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	93.210	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.210	Tupaia_belangeri
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	90.432	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.432	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.947	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.947	Ursus_americanus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.074	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.074	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.074	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	96	94.872	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.543	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	81	93.367	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.367	Xiphophorus_couchianus
ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus