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Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000014766 (Gene tree)
Gene ID: 102004180
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27785 bases
Position: chrJH721884.1:19393589-19421373
Accession: 102004180
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000021577	MMR_HSR1	PF01926.23	1.4e-05	1	1
ENSCLAP00000021580	MMR_HSR1	PF01926.23	1.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000021782	RAB1A-203	381	-	ENSCLAP00000021579	126 (aa)	-	UPI0000208584
ENSCLAT00000021783	RAB1A-204	624	-	ENSCLAP00000021580	207 (aa)	-	-
ENSCLAT00000021780	RAB1A-201	1501	XM_005385692	ENSCLAP00000021577	205 (aa)	XP_005385749	UPI0000001259
ENSCLAT00000021781	RAB1A-202	417	-	ENSCLAP00000021578	138 (aa)	-	UPI00004704BB

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000014766	RAB1A	80	38.415	ENSCLAG00000005888	NRAS	86	38.415
ENSCLAG00000014766	RAB1A	81	35.503	ENSCLAG00000017218	-	73	35.503
ENSCLAG00000014766	RAB1A	94	38.384	ENSCLAG00000015536	RAB6A	94	38.384
ENSCLAG00000014766	RAB1A	86	43.820	ENSCLAG00000000113	RAB39B	84	43.820
ENSCLAG00000014766	RAB1A	57	30.252	ENSCLAG00000008391	-	56	30.252
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	53.960	ENSCLAG00000013339	RAB35	100	53.960
ENSCLAG00000014766	RAB1A	97	46.465	ENSCLAG00000002400	RAB2B	99	46.465
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	45.581	ENSCLAG00000003207	RAB11B	99	45.581
ENSCLAG00000014766	RAB1A	79	42.236	ENSCLAG00000006992	RAB31	83	42.236
ENSCLAG00000014766	RAB1A	80	35.928	ENSCLAG00000002057	MRAS	80	35.928
ENSCLAG00000014766	RAB1A	80	47.619	ENSCLAG00000005031	RAB33A	71	47.619
ENSCLAG00000014766	RAB1A	86	43.258	ENSCLAG00000008913	RAB37	83	42.778
ENSCLAG00000014766	RAB1A	95	43.590	ENSCLAG00000016650	RAB5C	89	43.590
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	93.069	ENSCLAG00000015776	RAB1B	100	93.069
ENSCLAG00000014766	RAB1A	85	52.299	ENSCLAG00000007435	RAB11A	81	52.299
ENSCLAG00000014766	RAB1A	81	50.602	ENSCLAG00000014030	RAB30	82	50.602
ENSCLAG00000014766	RAB1A	77	39.752	ENSCLAG00000009672	RAB34	62	39.752
ENSCLAG00000014766	RAB1A	80	50.909	ENSCLAG00000004324	RAB15	78	50.909
ENSCLAG00000014766	RAB1A	83	43.429	ENSCLAG00000003133	RAB33B	76	43.429
ENSCLAG00000014766	RAB1A	84	34.104	ENSCLAG00000000797	RAB23	73	34.104
ENSCLAG00000014766	RAB1A	87	33.514	ENSCLAG00000016162	RERG	90	33.514
ENSCLAG00000014766	RAB1A	57	32.231	ENSCLAG00000017139	-	61	32.231
ENSCLAG00000014766	RAB1A	57	31.092	ENSCLAG00000010525	ARL4C	61	31.092
ENSCLAG00000014766	RAB1A	81	31.325	ENSCLAG00000006333	RAB7A	77	31.325
ENSCLAG00000014766	RAB1A	89	56.150	ENSCLAG00000006603	-	92	56.150
ENSCLAG00000014766	RAB1A	77	33.333	ENSCLAG00000015766	RAB24	79	34.568
ENSCLAG00000014766	RAB1A	81	46.988	ENSCLAG00000003784	RAB25	78	46.988
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	44.554	ENSCLAG00000009500	RAB14	93	44.554
ENSCLAG00000014766	RAB1A	90	48.108	ENSCLAG00000005708	RAB2A	99	45.714
ENSCLAG00000014766	RAB1A	84	34.463	ENSCLAG00000002823	HRAS	93	34.463
ENSCLAG00000014766	RAB1A	57	30.252	ENSCLAG00000006259	ARL4A	59	30.252
ENSCLAG00000014766	RAB1A	80	37.805	ENSCLAG00000016519	KRAS	95	35.912
ENSCLAG00000014766	RAB1A	95	43.299	ENSCLAG00000006053	-	90	43.299
ENSCLAG00000014766	RAB1A	76	38.994	ENSCLAG00000000494	RAB9A	79	38.994

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	100.000	Capra_hircus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	97.537	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	97.549	ENSHGLG00100007994	RAB1A	99	97.549	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	93	98.507	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000014766	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	95.588	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	93.627	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	100.000	Ovis_aries
ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	100.000	Pan_paniscus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	Panthera_pardus
ENSCLAG00000014766	RAB1A	96	100.000	ENSPTIG00000013471	RAB1A	99	98.522	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	ENSPANG00000010485	RAB1A	100	100.000	Papio_anubis
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