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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000016191 (Gene tree)
Gene ID: 102009966
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 82830 bases
Position: chrJH721885.1:27666091-27748920
Accession: 102009966
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000023606	IBN_N	PF03810.19	6.1e-16	1	1
ENSCLAP00000023605	IBN_N	PF03810.19	6.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000023829	TNPO1-201	5585	XM_005386080	ENSCLAP00000023605	898 (aa)	XP_005386137	UPI00038EEE94
ENSCLAT00000023830	TNPO1-202	6358	XM_005386079	ENSCLAP00000023606	890 (aa)	XP_005386136	UPI00038ED317

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	84.893	ENSCLAG00000013442	TNPO2	99	84.893

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSG00000083312	TNPO1	100	99.555	Homo_sapiens
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.371	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.371	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	98.664	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.664	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000016191	TNPO1	87	92.377	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.377	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.483	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.483	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.483	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.483	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.034	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.034	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	92.446	ENSAPLG00000009619	-	97	93.448	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.292	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.292	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	88.202	ENSANAG00000025351	-	100	87.973	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	63.920	ENSANAG00000027118	-	99	63.818	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.109	ENSANAG00000022453	-	100	99.109	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	91.124	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.124	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.265	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.928	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.332	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.332	Bos_taurus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.220	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	99.300	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.300	Canis_familiaris
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.404	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.404	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.220	Capra_hircus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	95.254	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.778	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.109	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.109	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.555	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.443	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.443	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	94	86.659	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.659	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	97.303	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.306	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	75.084	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.084	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.555	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.220	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	99.181	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.181	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.022	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.022	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.034	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.034	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.144	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.807	Danio_rerio
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.169	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.192	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	93	99.277	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.276	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	57.562	FBgn0035693	CG8219	99	57.111	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000016191	TNPO1	86	98.876	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.876	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000016191	TNPO1	94	84.762	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.881	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.555	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.332	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.332	Equus_caballus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	86.166	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.730	Esox_lucius
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.555	Felis_catus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.966	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	96.966	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.889	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.889	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.378	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.378	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	89.698	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.698	Gadus_morhua
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.517	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.517	Gallus_gallus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.152	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.152	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.697	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.697	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	97.303	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.303	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.555	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	82.735	ENSGGOG00000022535	-	99	82.793	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.697	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.697	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.777	ENSHGLG00000000970	-	100	99.777	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	75.947	ENSHGLG00100000963	-	99	77.674	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	99.650	ENSHGLG00100017090	-	99	99.650	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.326	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.326	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.146	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.146	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	91	89.642	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.642	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	88.953	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.953	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	94.944	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	94.855	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	97	98.730	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.730	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.555	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.443	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.443	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.555	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.555	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.034	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.034	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.472	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.472	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.213	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	95.506	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.521	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.213	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.213	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000016191	TNPO1	87	92.010	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.010	Mola_mola
ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	97.447	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.447	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	91.910	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.910	Monopterus_albus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	98.998	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.109	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	98.998	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.443	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.443	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	98.836	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.836	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.220	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.220	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000016191	TNPO1	87	92.248	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.248	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.555	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000016191	TNPO1	91	92.661	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.661	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.777	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.777	Octodon_degus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	91.964	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.964	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	92	97.683	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	92.757	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.757	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	87	92.348	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.348	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	92.672	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	92.785	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.785	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	92.672	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.672	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.443	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.443	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.332	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.332	Ovis_aries
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.555	Pan_paniscus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.555	Panthera_pardus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.555	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.555	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000016191	TNPO1	94	86.602	ENSPTRG00000047731	-	100	86.602	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.555	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.555	Papio_anubis
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	90.112	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.112	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.966	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.548	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	90.236	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.348	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	99.181	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.181	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	97.865	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.865	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.945	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.945	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.945	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.945	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.146	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.146	Poecilia_mexicana
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