EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000016839 (Gene tree)
Gene ID: 102003852
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5995 bases
Position: chrJH721872.1:27287368-27293362
Accession: 102003852
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000024526	SRP54	PF00448.22	1.8e-47	1	1
ENSCLAP00000024526	SRP54_N	PF02881.19	8.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000024762	SRPRA-201	3015	XM_005378499	ENSCLAP00000024526	637 (aa)	XP_005378556	UPI00038EF73F

Gene Model

Click here to download ENSCLAG00000016839's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCLAG00000016839's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.433	ENSG00000182934	SRPRA	100	98.433	Homo_sapiens
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.835	ENSAPOG00000017588	srpra	100	68.702	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.552	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	96.552	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.311	ENSACIG00000021588	srpra	100	66.463	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.445	ENSAOCG00000018884	srpra	100	68.855	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.293	ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.571	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000016839	SRPRA	83	86.984	ENSATEG00000023578	srpra	93	86.728	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	94	77.796	ENSAPLG00000016079	SRPRA	100	77.961	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	76.271	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	76.462	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.962	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	97.962	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.584	ENSACLG00000000518	srpra	100	67.988	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	65.528	ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.008	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.183	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	97.183	Bos_taurus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	99	48.255	WBGene00009521	F38A1.8	99	48.255	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.119	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	98.119	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	94.201	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	94.201	Canis_familiaris
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.238	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	96.238	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.244	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	96.244	Capra_hircus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	81	98.750	ENSTSYG00000005187	SRPRA	97	98.750	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000016839	SRPRA	95	90.099	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	97.744	Cavia_aperea
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.430	ENSCPOG00000014976	SRPRA	100	98.430	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.806	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	97.806	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.433	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	98.433	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.433	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.433	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	55	98.469	ENSCHOG00000010015	-	73	98.469	Choloepus_hoffmanni
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	77.419	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	77.880	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000016839	SRPRA	99	58.410	ENSCING00000008954	-	100	58.716	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	99	59.021	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.084	Ciona_savignyi
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.492	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	97.492	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.174	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	97.174	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.174	ENSCGRG00000009892	Srpr	100	97.174	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.085	ENSCSEG00000002374	srpra	100	68.085	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.372	ENSCVAG00000019881	srpra	100	68.636	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.173	ENSDARG00000061124	srpra	100	66.717	Danio_rerio
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	95.814	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	95.814	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.959	ENSDORG00000016719	Srpr	100	97.959	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000016839	SRPRA	99	51.159	FBgn0010391	Gtp-bp	100	51.852	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	92.523	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	92.523	Echinops_telfairi
ENSCLAG00000016839	SRPRA	51	80.615	ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.675	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	95.618	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	95.305	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	95.775	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	95.462	Equus_caballus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	86.916	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	86.137	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.760	ENSELUG00000017643	srpra	100	68.913	Esox_lucius
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.870	ENSFCAG00000011274	-	100	96.870	Felis_catus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	80	95.695	ENSFCAG00000030894	-	99	95.303	Felis_catus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	99	74.375	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.531	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	99.058	ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	99.058	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.020	ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.474	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.081	ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	Gadus_morhua
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	78.086	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	78.241	Gallus_gallus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.140	ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.389	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.770	ENSGACG00000006550	srpra	100	67.697	Gasterosteus_aculeatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	78.648	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	78.648	Gopherus_agassizii
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.589	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	98.589	Gorilla_gorilla
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.431	ENSHBUG00000000119	srpra	100	67.835	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.273	ENSHGLG00000001597	SRPR	100	98.273	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.273	ENSHGLG00100006449	SRPR	100	98.273	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.278	ENSHCOG00000010749	srpra	100	67.761	Hippocampus_comes
ENSCLAG00000016839	SRPRA	94	64.228	ENSIPUG00000000867	srpra	99	64.390	Ictalurus_punctatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.119	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	98.119	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.174	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	97.174	Jaculus_jaculus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.326	ENSKMAG00000002280	srpra	100	68.882	Kryptolebias_marmoratus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.971	ENSLBEG00000009608	srpra	100	68.085	Labrus_bergylta
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	70.233	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	70.233	Latimeria_chalumnae
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.372	ENSLOCG00000002733	srpra	100	67.273	Lepisosteus_oculatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	95.149	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	95.149	Loxodonta_africana
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.589	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	98.589	Macaca_fascicularis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.589	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	98.589	Macaca_mulatta
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.433	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	98.433	Macaca_nemestrina
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.433	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	98.433	Mandrillus_leucophaeus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.717	ENSMAMG00000000473	srpra	100	66.667	Mastacembelus_armatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.584	ENSMZEG00005013432	srpra	100	67.988	Maylandia_zebra
ENSCLAG00000016839	SRPRA	94	77.851	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	78.017	Meleagris_gallopavo
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.488	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	97.488	Mesocricetus_auratus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.335	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	97.335	Microcebus_murinus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.488	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	97.488	Microtus_ochrogaster
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.538	ENSMMOG00000005019	srpra	100	67.538	Mola_mola
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	90.141	ENSMODG00000004576	-	100	89.655	Monodelphis_domestica
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.237	ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	Monopterus_albus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.331	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	100	97.331	Mus_caroli
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.174	ENSMUSG00000032042	Srpr	100	97.174	Mus_musculus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.331	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	100	97.331	Mus_pahari
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	92.526	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	92.526	Mus_spretus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.708	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	96.708	Mustela_putorius_furo
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	94.828	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	94.828	Myotis_lucifugus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.017	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	97.017	Nannospalax_galili
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.477	ENSNBRG00000017311	srpra	100	68.196	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000016839	SRPRA	95	98.684	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	98.684	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000016839	SRPRA	94	90.667	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	90.333	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	90.297	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.297	Ochotona_princeps
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.645	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	97.645	Octodon_degus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.278	ENSONIG00000005324	srpra	100	67.988	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.276	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	98.276	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.945	ENSORLG00000014676	srpra	100	68.712	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.945	ENSORLG00020009240	srpra	100	68.712	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.945	ENSORLG00015015405	srpra	100	68.865	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.315	ENSOMEG00000005872	srpra	100	68.510	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.645	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	97.645	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	92.356	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	92.980	Ovis_aries
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.433	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	98.433	Pan_paniscus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.870	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	96.870	Panthera_pardus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.714	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	96.714	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.433	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	98.433	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.589	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	98.589	Papio_anubis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.409	ENSPKIG00000016106	srpra	100	66.924	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000016839	SRPRA	94	76.519	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	76.683	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.308	ENSPMGG00000001393	srpra	100	68.098	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.645	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	97.645	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000016839	SRPRA	99	61.350	ENSPMAG00000009559	srpra	99	60.896	Petromyzon_marinus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	90.297	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	90.454	Phascolarctos_cinereus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.982	ENSPFOG00000003114	srpra	100	69.697	Poecilia_formosa
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.982	ENSPLAG00000007323	srpra	100	69.697	Poecilia_latipinna
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.982	ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.697	Poecilia_mexicana
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	69.062	ENSPREG00000004937	srpra	100	69.044	Poecilia_reticulata
ENSCLAG00000016839	SRPRA	89	98.684	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	98.684	Pongo_abelii
ENSCLAG00000016839	SRPRA	64	99.225	ENSPCAG00000003801	-	64	99.225	Procavia_capensis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.649	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	97.649	Propithecus_coquereli
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.238	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	96.238	Pteropus_vampyrus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.584	ENSPNYG00000012371	srpra	100	67.988	Pundamilia_nyererei
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	65.091	ENSPNAG00000013476	srpra	100	66.514	Pygocentrus_nattereri
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.645	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	97.645	Rattus_norvegicus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.276	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	98.276	Rhinopithecus_bieti
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.122	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	98.122	Rhinopithecus_roxellana
ENSCLAG00000016839	SRPRA	68	37.657	YDR292C	-	76	37.657	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	97.962	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.962	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	94	91.030	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.698	Sarcophilus_harrisii
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	65.421	ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.199	Scleropages_formosus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.719	ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.049	Scophthalmus_maximus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	65.938	ENSSDUG00000013920	srpra	100	66.823	Seriola_dumerili
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	65.854	ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.226	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	81	100.000	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	Sorex_araneus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	77.160	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	77.315	Sphenodon_punctatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.768	ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.678	Stegastes_partitus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.552	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.552	Sus_scrofa
ENSCLAG00000016839	SRPRA	94	74.752	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	74.752	Taeniopygia_guttata
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.407	ENSTRUG00000006856	srpra	100	67.431	Takifugu_rubripes
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	64.340	ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	Tetraodon_nigroviridis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.088	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	96.088	Tursiops_truncatus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.401	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	96.401	Ursus_americanus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	96	87.561	ENSUMAG00000002269	SRPRA	99	87.561	Ursus_maritimus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	69	99.225	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	99.225	Vicugna_pacos
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.395	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	96.395	Vulpes_vulpes
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	62.137	ENSXETG00000003920	srpra	100	62.595	Xenopus_tropicalis
ENSCLAG00000016839	SRPRA	84	87.937	ENSXCOG00000001286	srpra	100	71.101	Xiphophorus_couchianus
ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.341	ENSXMAG00000028401	srpra	100	69.138	Xiphophorus_maculatus