EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCLAG00000017269 (Gene tree)
Gene ID: 102012183
Gene Symbol: TRMU
Alias: FLJ10140|MTO2|TRMT
Full Name: tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase
Gene Type: protein_coding
Species: Chinchilla_lanigera
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13579 bases
Position: chrJH721873.1:30440282-30453860
Accession: 102012183
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCLAP00000025148	tRNA_Me_trans	PF03054.16	2.2e-142	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCLAT00000025394	TRMU-201	2010	XM_005379512	ENSCLAP00000025148	421 (aa)	XP_005379569	UPI00038ED631

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	89.021	ENSG00000100416	TRMU	100	93.333	Homo_sapiens
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	70.120	ENSAPOG00000014458	trmu	99	70.120	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	90.215	ENSAMEG00000003319	TRMU	100	90.215	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	69.118	ENSACIG00000002101	trmu	98	69.118	Amphilophus_citrinellus
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	71.960	ENSAOCG00000013155	trmu	97	71.960	Amphiprion_ocellaris
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	71.464	ENSAPEG00000013350	trmu	97	71.464	Amphiprion_percula
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	70.343	ENSATEG00000007814	trmu	99	70.343	Anabas_testudineus
ENSCLAG00000017269	TRMU	91	79.319	ENSAPLG00000016380	TRMU	97	79.319	Anas_platyrhynchos
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	79.901	ENSACAG00000007720	TRMU	97	79.901	Anolis_carolinensis
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	86.461	ENSANAG00000038053	TRMU	99	86.461	Aotus_nancymaae
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	70.471	ENSACLG00000005395	trmu	98	69.919	Astatotilapia_calliptera
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	70.588	ENSAMXG00000005282	trmu	99	70.588	Astyanax_mexicanus
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	89.311	ENSBTAG00000005595	TRMU	100	89.311	Bos_taurus
ENSCLAG00000017269	TRMU	90	40.722	WBGene00007114	mttu-1	98	40.722	Caenorhabditis_elegans
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	85.000	ENSCJAG00000000198	TRMU	99	85.000	Callithrix_jacchus
ENSCLAG00000017269	TRMU	98	91.283	ENSCAFG00000000779	TRMU	99	90.692	Canis_familiaris
ENSCLAG00000017269	TRMU	98	91.283	ENSCAFG00020009184	TRMU	99	90.692	Canis_lupus_dingo
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	89.928	ENSCHIG00000017074	TRMU	99	89.524	Capra_hircus
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	89.762	ENSTSYG00000003853	TRMU	99	89.762	Carlito_syrichta
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	88.000	ENSCAPG00000013034	TRMU	99	88.000	Cavia_aperea
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	93.824	ENSCPOG00000020780	TRMU	100	93.824	Cavia_porcellus
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	86.905	ENSCCAG00000021641	TRMU	99	86.905	Cebus_capucinus
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	87.648	ENSCATG00000032800	TRMU	100	87.648	Cercocebus_atys
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	88.361	ENSCSAG00000005279	TRMU	100	88.361	Chlorocebus_sabaeus
ENSCLAG00000017269	TRMU	88	80.914	ENSCPBG00000011621	TRMU	93	80.914	Chrysemys_picta_bellii
ENSCLAG00000017269	TRMU	92	48.454	ENSCING00000019371	-	95	48.454	Ciona_intestinalis
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	87.173	ENSCANG00000041645	TRMU	100	87.173	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	90.261	ENSCGRG00001001739	Trmu	99	90.261	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	82.898	ENSCGRG00000002781	Trmu	100	82.898	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	67.548	ENSCSEG00000012382	trmu	100	67.548	Cynoglossus_semilaevis
ENSCLAG00000017269	TRMU	98	69.976	ENSCVAG00000001366	trmu	99	69.976	Cyprinodon_variegatus
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	68.059	ENSDARG00000043734	trmu	98	68.059	Danio_rerio
ENSCLAG00000017269	TRMU	54	83.700	ENSDNOG00000047245	-	84	82.083	Dasypus_novemcinctus
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	91.133	ENSDORG00000007455	Trmu	99	91.133	Dipodomys_ordii
ENSCLAG00000017269	TRMU	89	45.040	FBgn0040337	CG3021	95	45.573	Drosophila_melanogaster
ENSCLAG00000017269	TRMU	92	55.357	ENSEBUG00000007454	trmu	99	54.094	Eptatretus_burgeri
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	91.198	ENSEASG00005021725	TRMU	99	90.238	Equus_asinus_asinus
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	91.198	ENSECAG00000000467	TRMU	99	90.238	Equus_caballus
ENSCLAG00000017269	TRMU	70	68.919	ENSEEUG00000000074	-	77	96.296	Erinaceus_europaeus
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	68.215	ENSELUG00000009464	trmu	99	68.750	Esox_lucius
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	91.443	ENSFCAG00000006533	TRMU	99	90.714	Felis_catus
ENSCLAG00000017269	TRMU	90	77.378	ENSFALG00000010035	TRMU	98	77.378	Ficedula_albicollis
ENSCLAG00000017269	TRMU	93	93.639	ENSFDAG00000017472	TRMU	100	93.639	Fukomys_damarensis
ENSCLAG00000017269	TRMU	95	72.682	ENSFHEG00000003162	trmu	98	72.207	Fundulus_heteroclitus
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	64.373	ENSGMOG00000001323	trmu	100	64.373	Gadus_morhua
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ENSCLAG00000017269	TRMU	95	72.932	ENSGAFG00000013331	trmu	96	72.932	Gambusia_affinis
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	67.952	ENSGACG00000019024	trmu	98	67.952	Gasterosteus_aculeatus
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ENSCLAG00000017269	TRMU	96	69.975	ENSHBUG00000023421	trmu	98	69.377	Haplochromis_burtoni
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	92.637	ENSHGLG00000009278	TRMU	100	92.637	Heterocephalus_glaber_female
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	92.637	ENSHGLG00100018863	TRMU	100	92.637	Heterocephalus_glaber_male
ENSCLAG00000017269	TRMU	94	72.544	ENSHCOG00000013459	trmu	96	72.544	Hippocampus_comes
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ENSCLAG00000017269	TRMU	98	91.019	ENSMICG00000029046	TRMU	99	91.019	Microcebus_murinus
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ENSCLAG00000017269	TRMU	98	68.357	ENSMMOG00000007229	trmu	99	68.357	Mola_mola
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ENSCLAG00000017269	TRMU	99	90.000	MGP_PahariEiJ_G0020139	Trmu	99	90.000	Mus_pahari
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	90.238	MGP_SPRETEiJ_G0021031	Trmu	99	90.238	Mus_spretus
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ENSCLAG00000017269	TRMU	96	70.223	ENSNBRG00000022690	trmu	100	69.704	Neolamprologus_brichardi
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	88.067	ENSNLEG00000015773	TRMU	99	88.067	Nomascus_leucogenys
ENSCLAG00000017269	TRMU	78	70.122	ENSMEUG00000000216	TRMU	99	70.122	Notamacropus_eugenii
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	93.824	ENSODEG00000014745	TRMU	100	93.824	Octodon_degus
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	69.608	ENSONIG00000009821	trmu	98	69.608	Oreochromis_niloticus
ENSCLAG00000017269	TRMU	93	77.919	ENSOANG00000001891	TRMU	99	77.919	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCLAG00000017269	TRMU	94	91.878	ENSOCUG00000003664	TRMU	98	90.049	Oryctolagus_cuniculus
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	69.727	ENSORLG00000019015	trmu	97	69.727	Oryzias_latipes
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	69.479	ENSORLG00020006830	trmu	97	69.479	Oryzias_latipes_hni
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	69.479	ENSORLG00015003907	trmu	97	69.479	Oryzias_latipes_hsok
ENSCLAG00000017269	TRMU	55	67.234	ENSOMEG00000015541	trmu	85	67.234	Oryzias_melastigma
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	89.311	ENSOGAG00000008096	TRMU	100	89.311	Otolemur_garnettii
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	81.429	ENSOARG00000019475	TRMU	99	81.429	Ovis_aries
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	88.783	ENSPPAG00000033944	TRMU	99	88.783	Pan_paniscus
ENSCLAG00000017269	TRMU	96	92.556	ENSPPRG00000004197	TRMU	99	90.952	Panthera_pardus
ENSCLAG00000017269	TRMU	65	91.209	ENSPTIG00000014122	TRMU	98	92.135	Panthera_tigris_altaica
ENSCLAG00000017269	TRMU	99	88.783	ENSPTRG00000014510	TRMU	99	88.783	Pan_troglodytes
ENSCLAG00000017269	TRMU	98	88.350	ENSPANG00000023074	TRMU	97	87.397	Papio_anubis
ENSCLAG00000017269	TRMU	95	70.398	ENSPKIG00000002849	trmu	97	70.398	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCLAG00000017269	TRMU	86	80.769	ENSPSIG00000013020	TRMU	95	80.769	Pelodiscus_sinensis
ENSCLAG00000017269	TRMU	97	71.324	ENSPMGG00000004083	trmu	98	71.324	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCLAG00000017269	TRMU	100	90.736	ENSPEMG00000014007	Trmu	100	90.736	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCLAG00000017269	TRMU	95	78.500	ENSPCIG00000009923	TRMU	97	77.295	Phascolarctos_cinereus
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ENSCLAG00000017269	TRMU	98	70.218	ENSPMEG00000004326	trmu	99	70.218	Poecilia_mexicana
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