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Description

Ensembl ID: ENSCPBG00000000260 (Gene tree)
Gene ID: 101944355
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chrysemys_picta_bellii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 146461 bases
Position: chrKK082917.1:9791028-9937488
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPBP00000000292	IBN_N	PF03810.19	5.2e-16	1	1
ENSCPBP00000000272	IBN_N	PF03810.19	5.6e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPBT00000000384	TNPO1-202	2707	-	ENSCPBP00000000292	834 (aa)	-	-
ENSCPBT00000000361	TNPO1-201	2891	-	ENSCPBP00000000272	943 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	87.373	ENSCPBG00000023892	TNPO2	99	87.373

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSG00000083312	TNPO1	100	97.927	Homo_sapiens
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.270	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.270	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	96.885	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	96.885	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000000260	TNPO1	82	93.540	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.540	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.382	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.382	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.382	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.382	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.157	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.157	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	93	94.025	ENSAPLG00000009619	-	99	94.025	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	98.876	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.876	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	63.315	ENSANAG00000027118	-	99	63.425	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.306	ENSANAG00000022453	-	99	97.306	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	86.801	ENSANAG00000025351	-	99	86.801	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	91.910	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.910	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	92.937	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.937	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	97.643	Bos_taurus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.419	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.419	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	97.666	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	97.666	Canis_familiaris
ENSCPBG00000000260	TNPO1	99	93.127	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	95.056	Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.531	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	97.531	Capra_hircus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.898	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.374	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.306	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	97.303	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	99	93.326	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	97.753	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.306	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	97.303	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	97.755	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	89	85.238	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	84.970	Choloepus_hoffmanni
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	75.645	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.533	Ciona_savignyi
ENSCPBG00000000260	TNPO1	99	93.887	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	97.755	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.643	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	97.778	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	97.778	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.042	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.034	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.708	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.708	Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.378	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.378	Danio_rerio
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	91.611	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	91.611	Dasypus_novemcinctus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	88	97.711	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	97.708	Dipodomys_ordii
ENSCPBG00000000260	TNPO1	99	53.950	FBgn0035693	CG8219	99	58.014	Drosophila_melanogaster
ENSCPBG00000000260	TNPO1	85	98.876	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.876	Echinops_telfairi
ENSCPBG00000000260	TNPO1	89	85.357	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.476	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	97.753	Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	97.643	Equus_caballus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	87.255	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.443	Esox_lucius
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	97.753	Felis_catus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	99.663	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	99.663	Ficedula_albicollis
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.419	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.419	Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.052	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	90.716	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.828	Gadus_morhua
ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	98.322	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	98.539	Gallus_gallus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	92.937	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.713	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.378	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.378	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	99.775	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	99.775	Gopherus_agassizii
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	81.523	ENSGGOG00000022535	-	98	81.411	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000000260	TNPO1	99	93.880	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	97.753	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.596	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.596	Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	96.760	ENSHGLG00000000970	-	99	97.082	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	76.047	ENSHGLG00100000963	-	99	75.465	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	97.079	ENSHGLG00100017090	-	99	97.079	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	97.324	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	97.324	Jaculus_jaculus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.270	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.270	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	86	90.999	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.506	Labrus_bergylta
ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	89.884	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.884	Latimeria_chalumnae
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	96.633	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	96.633	Lepisosteus_oculatus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	92	97.344	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	97.344	Loxodonta_africana
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	97.755	Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	97.318	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	96.656	Macaca_mulatta
ENSCPBG00000000260	TNPO1	99	93.887	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	97.755	Macaca_nemestrina
ENSCPBG00000000260	TNPO1	99	93.887	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	97.755	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.157	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.157	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.258	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.258	Maylandia_zebra
ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	97.324	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.753	Mesocricetus_auratus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.715	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	93.715	Microcebus_murinus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.643	Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000000260	TNPO1	82	93.557	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.655	Mola_mola
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	98.085	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	98.085	Monodelphis_domestica
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	92.809	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.809	Monopterus_albus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.419	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	97.753	Mus_caroli
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	97.893	Mus_musculus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.531	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.770	Mus_pahari
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.419	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	97.753	Mus_spretus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	97.643	Mustela_putorius_furo
ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	97.206	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	97.206	Myotis_lucifugus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	97.643	Nannospalax_galili
ENSCPBG00000000260	TNPO1	82	93.411	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.411	Neolamprologus_brichardi
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	97.753	Nomascus_leucogenys
ENSCPBG00000000260	TNPO1	90	90.798	ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	90.798	Ochotona_princeps
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.082	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	97.082	Octodon_degus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	92.865	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.865	Oreochromis_niloticus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	87	98.902	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.902	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	91.355	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.355	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	82	93.645	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.645	Oryzias_latipes
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.574	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.574	Oryzias_latipes_hni
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.799	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.799	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.687	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.687	Oryzias_melastigma
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	97.755	Otolemur_garnettii
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	97.643	Ovis_aries
ENSCPBG00000000260	TNPO1	99	93.887	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	97.755	Pan_paniscus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	97.753	Panthera_pardus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	97.753	Panthera_tigris_altaica
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	97.755	Pan_troglodytes
ENSCPBG00000000260	TNPO1	89	85.635	ENSPTRG00000047731	-	100	85.497	Pan_troglodytes
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.755	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	97.755	Papio_anubis
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	90.899	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.899	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	99.664	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	99.664	Pelodiscus_sinensis
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	90.797	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.685	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	97.778	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.778	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.729	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.833	Poecilia_formosa
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ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.834	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.937	Poecilia_reticulata
ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.643	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	97.643	Pongo_abelii
ENSCPBG00000000260	TNPO1	100	93.563	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	97.755	Propithecus_coquereli
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