EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCPBG00000007544 (Gene tree)
Gene ID: 101948523
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Chrysemys_picta_bellii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3697 bases
Position: chrKK082932.1:4608402-4612098
Accession: 8829
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPBP00000009785	eRF1_2	PF03464.15	2.6e-36	1	1
ENSCPBP00000009785	eRF1_3	PF03465.15	1.2e-25	1	1
ENSCPBP00000009785	eRF1_1	PF03463.15	4.3e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPBT00000011751	PELO-201	1668	-	ENSCPBP00000009785	385 (aa)	XP_005282232	UPI000388C8AA

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cpic03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSG00000152684	PELO	98	93.351	Homo_sapiens
ENSCPBG00000007544	PELO	64	79.352	ENSAPOG00000023700	-	90	79.352	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000007544	PELO	64	79.352	ENSAPOG00000000616	pelo	90	79.352	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	ENSAMEG00000007734	PELO	98	93.883	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000007544	PELO	97	75.603	ENSACIG00000014386	pelo	97	79.882	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.740	ENSAOCG00000023717	pelo	97	80.267	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.740	ENSAPEG00000011235	pelo	97	80.267	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.519	ENSATEG00000019550	pelo	97	80.800	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000007544	PELO	77	87.584	ENSAPLG00000013265	PELO	97	87.543	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000007544	PELO	98	90.957	ENSACAG00000004352	PELO	98	90.957	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.766	ENSANAG00000014096	PELO	98	94.149	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	ENSACLG00000010305	pelo	97	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000007544	PELO	97	80.697	ENSAMXG00000020299	pelo	97	80.533	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSBTAG00000003268	PELO	97	93.617	Bos_taurus
ENSCPBG00000007544	PELO	98	58.511	WBGene00011280	pelo-1	99	58.511	Caenorhabditis_elegans
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	ENSCJAG00000035190	PELO	98	93.883	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	ENSCAFG00020023234	PELO	98	93.883	Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSCHIG00000016410	PELO	97	93.351	Capra_hircus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSTSYG00000005203	PELO	98	93.351	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.766	ENSCPOG00000027406	PELO	98	94.149	Cavia_porcellus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	ENSCCAG00000035600	PELO	98	93.883	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSCATG00000011829	PELO	98	93.617	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSCLAG00000005043	PELO	98	93.617	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSCSAG00000016692	PELO	98	93.617	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.727	ENSCHOG00000000523	PELO	98	93.085	Choloepus_hoffmanni
ENSCPBG00000007544	PELO	97	67.828	ENSCING00000001979	-	98	68.000	Ciona_intestinalis
ENSCPBG00000007544	PELO	100	69.091	ENSCSAVG00000006158	-	98	69.333	Ciona_savignyi
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSCANG00000023382	PELO	98	93.617	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPBG00000007544	PELO	97	91.689	ENSCGRG00001024665	Pelo	98	91.755	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000007544	PELO	97	93.029	ENSCGRG00000004570	Pelo	98	93.085	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000007544	PELO	100	78.961	ENSCSEG00000008807	pelo	97	79.200	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.299	ENSCVAG00000016082	pelo	97	81.867	Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.558	ENSDARG00000055477	pelo	97	81.867	Danio_rerio
ENSCPBG00000007544	PELO	100	89.896	ENSDNOG00000036721	PELO	98	90.186	Dasypus_novemcinctus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSDORG00000016689	Pelo	98	93.351	Dipodomys_ordii
ENSCPBG00000007544	PELO	96	67.027	FBgn0011207	pelo	95	66.933	Drosophila_melanogaster
ENSCPBG00000007544	PELO	71	77.778	ENSEBUG00000004955	pelo	95	77.778	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSEASG00005013348	PELO	98	93.351	Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.000	ENSELUG00000023229	pelo	98	81.127	Esox_lucius
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSFCAG00000032341	PELO	98	93.351	Felis_catus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	96.623	ENSFALG00000004559	PELO	100	96.623	Ficedula_albicollis
ENSCPBG00000007544	PELO	74	93.310	ENSFDAG00000002076	PELO	88	93.310	Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.000	ENSFHEG00000009769	pelo	97	80.533	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000007544	PELO	98	78.780	ENSGMOG00000005849	pelo	97	78.933	Gadus_morhua
ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.260	ENSGAFG00000019350	pelo	97	81.067	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.000	ENSGACG00000007245	pelo	97	81.868	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	99.481	ENSGAGG00000004018	PELO	100	99.481	Gopherus_agassizii
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSGGOG00000012635	PELO	98	93.617	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	ENSHBUG00000005866	pelo	97	80.000	Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSHGLG00000005932	PELO	98	93.351	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000007544	PELO	100	90.649	ENSHGLG00100017627	PELO	98	90.957	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000007544	PELO	100	77.143	ENSHCOG00000016782	pelo	97	77.600	Hippocampus_comes
ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.221	ENSIPUG00000020627	pelo	97	79.467	Ictalurus_punctatus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	ENSSTOG00000027378	PELO	98	93.883	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	90.390	ENSJJAG00000015032	Pelo	98	90.691	Jaculus_jaculus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.779	ENSKMAG00000021305	pelo	97	81.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000007544	PELO	99	79.948	ENSLBEG00000022399	pelo	98	80.800	Labrus_bergylta
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSLAFG00000020551	PELO	98	93.617	Loxodonta_africana
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSMFAG00000000651	PELO	98	93.617	Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSMMUG00000039101	PELO	98	93.617	Macaca_mulatta
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSMNEG00000035538	PELO	98	93.617	Macaca_nemestrina
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSMLEG00000039113	PELO	98	93.617	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000007544	PELO	97	82.038	ENSMAMG00000013260	pelo	97	81.867	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	ENSMZEG00005014258	pelo	97	80.000	Maylandia_zebra
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.468	ENSMAUG00000009770	Pelo	98	92.819	Mesocricetus_auratus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	ENSMICG00000044040	PELO	98	93.883	Microcebus_murinus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.727	ENSMOCG00000017554	Pelo	98	93.085	Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000007544	PELO	100	78.442	ENSMMOG00000001324	pelo	97	79.467	Mola_mola
ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.000	ENSMALG00000008194	pelo	97	80.800	Monopterus_albus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	98	93.617	Mus_caroli
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSMUSG00000042275	Pelo	98	93.617	Mus_musculus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	98	93.883	Mus_pahari
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	98	93.617	Mus_spretus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	90.390	ENSMLUG00000024132	PELO	98	90.691	Myotis_lucifugus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSNGAG00000019331	Pelo	98	93.351	Nannospalax_galili
ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	ENSNBRG00000011799	pelo	97	80.000	Neolamprologus_brichardi
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSNLEG00000035970	PELO	98	93.617	Nomascus_leucogenys
ENSCPBG00000007544	PELO	100	91.948	ENSMEUG00000005468	PELO	98	92.287	Notamacropus_eugenii
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ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSODEG00000017579	PELO	98	93.617	Octodon_degus
ENSCPBG00000007544	PELO	96	79.784	ENSONIG00000011511	pelo	97	79.733	Oreochromis_niloticus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSOCUG00000023902	PELO	98	93.617	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.039	ENSORLG00000005827	pelo	97	81.600	Oryzias_latipes
ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.299	ENSORLG00020016456	pelo	97	81.867	Oryzias_latipes_hni
ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.558	ENSORLG00015014447	pelo	97	82.133	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPBG00000007544	PELO	100	82.857	ENSOMEG00000021567	pelo	97	83.200	Oryzias_melastigma
ENSCPBG00000007544	PELO	100	94.286	ENSOGAG00000027940	PELO	98	94.681	Otolemur_garnettii
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSOARG00000008324	PELO	97	93.617	Ovis_aries
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSPPAG00000038951	PELO	98	93.617	Pan_paniscus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSPPRG00000018800	PELO	98	93.351	Panthera_pardus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSPTIG00000019988	PELO	98	93.351	Panthera_tigris_altaica
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSPTRG00000034409	PELO	98	93.617	Pan_troglodytes
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSPANG00000010902	PELO	98	93.617	Papio_anubis
ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.818	ENSPKIG00000015190	pelo	97	82.667	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCPBG00000007544	PELO	100	98.701	ENSPSIG00000004971	PELO	100	98.701	Pelodiscus_sinensis
ENSCPBG00000007544	PELO	67	75.969	ENSPMGG00000014561	pelo	95	75.969	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.468	ENSPEMG00000015584	Pelo	98	92.819	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPBG00000007544	PELO	100	91.948	ENSPCIG00000004880	PELO	98	92.553	Phascolarctos_cinereus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.039	ENSPFOG00000007277	pelo	97	81.600	Poecilia_formosa
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ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.039	ENSPMEG00000016964	pelo	97	81.600	Poecilia_mexicana
ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.039	ENSPREG00000023071	pelo	97	81.600	Poecilia_reticulata
ENSCPBG00000007544	PELO	97	93.298	ENSPPYG00000015451	PELO	94	93.351	Pongo_abelii
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.506	ENSPCOG00000021178	PELO	98	93.883	Propithecus_coquereli
ENSCPBG00000007544	PELO	100	79.481	ENSPNYG00000017325	pelo	97	80.000	Pundamilia_nyererei
ENSCPBG00000007544	PELO	97	81.501	ENSPNAG00000012458	pelo	97	81.333	Pygocentrus_nattereri
ENSCPBG00000007544	PELO	100	92.987	ENSRNOG00000061128	Pelo	98	93.351	Rattus_norvegicus
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSRBIG00000007299	PELO	98	93.617	Rhinopithecus_bieti
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSRROG00000035507	PELO	98	93.617	Rhinopithecus_roxellana
ENSCPBG00000007544	PELO	98	34.115	YNL001W	-	97	34.211	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	ENSSBOG00000036140	PELO	98	93.617	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCPBG00000007544	PELO	63	92.213	ENSSHAG00000010770	PELO	96	92.766	Sarcophilus_harrisii
ENSCPBG00000007544	PELO	98	82.493	ENSSFOG00015013399	pelo	97	82.667	Scleropages_formosus
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