EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCPBG00000008904 (Gene tree)
Gene ID: 101935404
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Chrysemys_picta_bellii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35903 bases
Position: chrKK082918.1:3620498-3656400
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPBP00000011724	GTP_EFTU	PF00009.27	1.7e-44	1	1
ENSCPBP00000011724	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.9e-12	1	1
ENSCPBP00000011724	EFG_IV	PF03764.18	2.2e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPBT00000014015	EFTUD2-201	3893	XM_005282868	ENSCPBP00000011724	972 (aa)	XP_005282925	UPI000388CD4F

Gene Model

Click here to download ENSCPBG00000008904's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cpic03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCPBG00000008904's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	50	30.233	ENSCPBG00000018367	GFM1	58	30.233
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	82	34.266	ENSCPBG00000017638	EFL1	82	35.577
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	86	38.453	ENSCPBG00000025689	-	98	38.453
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	87	38.832	ENSCPBG00000011117	EEF2	99	38.832

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.181	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	98.663	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	88.580	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.374	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	87	88.000	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.000	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.181	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.975	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.490	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.284	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	99	95.057	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	95.057	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.148	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.663	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.078	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.300	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.300	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	98.457	Bos_taurus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	99	69.835	WBGene00001166	eftu-2	99	69.835	Caenorhabditis_elegans
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.663	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	98.663	Canis_familiaris
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.663	Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.457	Capra_hircus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.251	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.251	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.045	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.045	Cavia_aperea
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.045	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.045	Cavia_porcellus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	98.663	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.663	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.942	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.942	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.663	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	91	85.923	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.923	Choloepus_hoffmanni
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.436	Ciona_intestinalis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	99	78.310	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	98.663	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.148	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	98.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.667	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	90.741	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.581	Danio_rerio
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.354	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.354	Dasypus_novemcinctus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.251	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	98.251	Dipodomys_ordii
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	74.872	FBgn0039566	CG4849	100	74.872	Drosophila_melanogaster
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	92	98.913	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	Echinops_telfairi
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	98.663	Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	98.560	Equus_caballus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.255	Esox_lucius
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.560	Felis_catus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	98.560	Ficedula_albicollis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	98.457	Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.181	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.872	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.049	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.358	Gadus_morhua
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	99.030	Gallus_gallus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.078	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	98.663	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.975	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.148	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.148	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	90.947	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.667	Ictalurus_punctatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.798	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	96.175	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	96	98.397	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.397	Jaculus_jaculus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.078	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	Labrus_bergylta
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	94.444	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.964	Latimeria_chalumnae
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.490	Lepisosteus_oculatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.251	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.251	Loxodonta_africana
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	98.663	Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	98.663	Macaca_nemestrina
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	98.663	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.078	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.078	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.872	Maylandia_zebra
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.665	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.665	Meleagris_gallopavo
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	98.148	Mesocricetus_auratus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	98.663	Microcebus_murinus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.251	ENSMOCG00000009039	-	100	98.251	Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	92	80.674	ENSMOCG00000017653	-	90	80.674	Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	87	93.765	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.765	Mola_mola
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.868	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.868	Monodelphis_domestica
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.942	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	97.942	Mus_caroli
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.942	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	97.942	Mus_musculus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.942	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.942	Mus_pahari
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.942	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	97.942	Mus_spretus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	97	98.411	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	98.411	Mustela_putorius_furo
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	98.663	Myotis_lucifugus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.354	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	98.354	Nannospalax_galili
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.975	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	Neolamprologus_brichardi
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	97	96.812	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.812	Nomascus_leucogenys
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	95.267	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.267	Notamacropus_eugenii
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	90.432	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.432	Ochotona_princeps
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.634	ENSODEG00000018041	-	100	97.634	Octodon_degus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	93	79.310	ENSODEG00000003385	-	100	79.310	Octodon_degus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.078	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.872	Oreochromis_niloticus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.457	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.461	Oryzias_latipes_hni
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.246	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	96.399	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	96.399	Otolemur_garnettii
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	98.457	Ovis_aries
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	98.560	Pan_paniscus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	98.663	Panthera_pardus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	98.663	Panthera_tigris_altaica
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.560	Pan_troglodytes
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	98.663	Papio_anubis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	93	98.236	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	98.236	Pelodiscus_sinensis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	84.671	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.148	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	98.148	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.971	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	98.971	Phascolarctos_cinereus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.078	Poecilia_formosa
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.078	Poecilia_latipinna
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.078	Poecilia_mexicana
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.222	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.222	Pongo_abelii
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	94.547	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.547	Procavia_capensis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.663	Propithecus_coquereli
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	94.033	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.033	Pteropus_vampyrus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.975	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.770	Pundamilia_nyererei
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.564	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.078	Pygocentrus_nattereri
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.045	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.045	Rattus_norvegicus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	98.560	Rhinopithecus_bieti
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.560	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	98.560	Rhinopithecus_roxellana
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	97	33.794	YKL173W	SNU114	97	33.465	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.663	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	97	98.934	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.934	Sarcophilus_harrisii
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.255	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.358	Scleropages_formosus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.872	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.667	Scophthalmus_maximus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.181	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	Seriola_dumerili
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.078	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	89.918	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.918	Sorex_araneus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.942	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.942	Sphenodon_punctatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.078	Stegastes_partitus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.457	Sus_scrofa
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	84	97.932	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.932	Taeniopygia_guttata
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.564	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.358	Takifugu_rubripes
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	86.885	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	Tetraodon_nigroviridis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	93.107	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.107	Tupaia_belangeri
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	89.815	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.815	Tursiops_truncatus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.536	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.536	Ursus_americanus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	98.663	Ursus_maritimus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	98.663	Vulpes_vulpes
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	97	94.989	ENSXETG00000003394	eftud2	98	96.083	Xenopus_tropicalis
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	81	93.622	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	Xiphophorus_couchianus
ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	Xiphophorus_maculatus