EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCPBG00000018594 (Gene tree)
Gene ID: 101946412
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Chrysemys_picta_bellii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 44189 bases
Position: chr19:3711165-3755353
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPBP00000026204	PAZ	PF02170.22	1.3e-28	1	1
ENSCPBP00000026204	Piwi	PF02171.17	1.6e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPBT00000030856	AGO1-201	4609	-	ENSCPBP00000026204	857 (aa)	XP_008165340	UPI000388F7F0

Gene Model

Click here to download ENSCPBG00000018594's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCPBG00000018594's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	83.217	ENSCPBG00000018602	AGO4	99	83.217
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	84.046	ENSCPBG00000018583	AGO3	99	85.338
ENSCPBG00000018594	AGO1	98	83.790	ENSCPBG00000019183	AGO2	98	82.730

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSG00000092847	AGO1	100	99.872	Homo_sapiens
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSAPOG00000024299	ago1	100	96.037	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	99.767	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000018594	AGO1	82	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSAOCG00000017727	ago1	100	96.037	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSAPEG00000004458	ago1	100	96.037	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSATEG00000008523	ago1	100	96.037	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	93.794	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.794	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000018594	AGO1	91	100.000	ENSACAG00000029174	AGO1	100	100.000	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSANAG00000037711	AGO1	100	99.767	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.804	ENSACLG00000000890	ago1	100	95.804	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000018594	AGO1	80	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.650	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.650	Bos_taurus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	99.767	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	99.767	Canis_familiaris
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	98.016	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	98.840	ENSCHIG00000011848	-	100	98.840	Capra_hircus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSTSYG00000009767	-	100	99.767	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	78.646	ENSTSYG00000032426	-	100	78.646	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000018594	AGO1	89	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.767	Cavia_porcellus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	99.767	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.068	ENSCATG00000031521	AGO1	100	99.872	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.767	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	99.767	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000018594	AGO1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSCANG00000039798	AGO1	100	99.767	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	99.767	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	99.764	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	99.764	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	94.664	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.664	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.804	ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.804	Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.387	ENSDARG00000092644	ago1	100	96.387	Danio_rerio
ENSCPBG00000018594	AGO1	91	99.872	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	99.872	Dasypus_novemcinctus
ENSCPBG00000018594	AGO1	93	98.525	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCPBG00000018594	AGO1	84	92.926	ENSETEG00000007626	AGO1	100	92.926	Echinops_telfairi
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSEASG00005012086	AGO1	100	99.767	Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSECAG00000024353	AGO1	100	99.767	Equus_caballus
ENSCPBG00000018594	AGO1	92	91.487	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.487	Erinaceus_europaeus
ENSCPBG00000018594	AGO1	91	96.931	ENSELUG00000016803	ago1	100	96.931	Esox_lucius
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	99.767	Felis_catus
ENSCPBG00000018594	AGO1	91	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	92.562	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.562	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000018594	AGO1	87	84.513	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.513	Gadus_morhua
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.883	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.883	Gallus_gallus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSGAFG00000009775	ago1	100	96.037	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000018594	AGO1	87	97.071	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	91	100.000	ENSGAGG00000012893	-	100	100.000	Gopherus_agassizii
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	99.767	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.804	ENSHBUG00000010459	ago1	100	95.804	Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	99.767	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	99.767	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	96.458	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.458	Hippocampus_comes
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.037	Ictalurus_punctatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	99.767	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.883	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.883	Jaculus_jaculus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSKMAG00000019464	ago1	100	96.037	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSLBEG00000007694	ago1	100	96.037	Labrus_bergylta
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	93.757	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.757	Latimeria_chalumnae
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	93.939	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.939	Lepisosteus_oculatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	99.764	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.764	Loxodonta_africana
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	99.767	Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	94.737	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.136	Macaca_mulatta
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.799	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	99.872	Macaca_nemestrina
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	99.767	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSMAMG00000008381	ago1	100	96.037	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.804	ENSMZEG00005007996	ago1	100	95.804	Maylandia_zebra
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	94.296	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.296	Meleagris_gallopavo
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	99.767	Mesocricetus_auratus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSMICG00000016147	AGO1	100	99.767	Microcebus_murinus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.650	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.650	Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000018594	AGO1	78	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.883	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.883	Monodelphis_domestica
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	96.340	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.420	Monopterus_albus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.767	Mus_caroli
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.767	Mus_musculus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.767	Mus_pahari
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.767	Mus_spretus
ENSCPBG00000018594	AGO1	84	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCPBG00000018594	AGO1	61	99.234	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.234	Myotis_lucifugus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.767	Nannospalax_galili
ENSCPBG00000018594	AGO1	91	96.931	ENSNBRG00000010867	ago1	100	96.931	Neolamprologus_brichardi
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.650	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.650	Nomascus_leucogenys
ENSCPBG00000018594	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSCPBG00000018594	AGO1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSODEG00000005321	AGO1	100	99.767	Octodon_degus
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	96.222	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.222	Oreochromis_niloticus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	91.234	ENSOANG00000002080	AGO1	100	92.209	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.650	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.650	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSORLG00000014965	ago1	100	96.037	Oryzias_latipes
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSORLG00020018253	ago1	100	96.037	Oryzias_latipes_hni
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSORLG00015003287	ago1	100	96.037	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSOMEG00000020528	ago1	100	96.037	Oryzias_melastigma
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	99.764	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	99.764	Otolemur_garnettii
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.650	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.650	Ovis_aries
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	99.767	Pan_paniscus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	99.767	Panthera_pardus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.533	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.533	Panthera_tigris_altaica
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	99.767	Pan_troglodytes
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSPANG00000009060	AGO1	100	99.767	Papio_anubis
ENSCPBG00000018594	AGO1	98	99.169	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.169	Pelodiscus_sinensis
ENSCPBG00000018594	AGO1	80	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.767	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.883	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.883	Phascolarctos_cinereus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSPFOG00000005867	ago1	100	96.037	Poecilia_formosa
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.119	Poecilia_latipinna
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSPREG00000006534	ago1	100	96.037	Poecilia_reticulata
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	99.767	Pongo_abelii
ENSCPBG00000018594	AGO1	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	Procavia_capensis
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	99.872	Propithecus_coquereli
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSPVAG00000005082	AGO1	100	99.767	Pteropus_vampyrus
ENSCPBG00000018594	AGO1	91	92.092	ENSPNYG00000012586	ago1	100	92.092	Pundamilia_nyererei
ENSCPBG00000018594	AGO1	93	92.231	ENSPNAG00000000597	ago1	99	92.231	Pygocentrus_nattereri
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.650	ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.650	Rattus_norvegicus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSRBIG00000032611	AGO1	100	99.767	Rhinopithecus_bieti
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSRROG00000044469	AGO1	100	99.767	Rhinopithecus_roxellana
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSSBOG00000020867	AGO1	100	99.767	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	98.713	ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.713	Sarcophilus_harrisii
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSSFOG00015020982	ago1	100	96.037	Scleropages_formosus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.921	ENSSMAG00000002841	ago1	100	95.921	Scophthalmus_maximus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSSDUG00000010864	ago1	100	96.037	Seriola_dumerili
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSSLDG00000000386	ago1	100	96.037	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCPBG00000018594	AGO1	74	100.000	ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	Sorex_araneus
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	99.882	ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.882	Sphenodon_punctatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSSPAG00000019154	ago1	100	96.037	Stegastes_partitus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.150	ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.315	Takifugu_rubripes
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.809	ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.809	Tetraodon_nigroviridis
ENSCPBG00000018594	AGO1	84	99.307	ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.307	Tupaia_belangeri
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	98.250	ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	Tursiops_truncatus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSUAMG00000027154	AGO1	100	99.767	Ursus_americanus
ENSCPBG00000018594	AGO1	99	96.240	ENSUMAG00000002480	AGO1	99	95.991	Ursus_maritimus
ENSCPBG00000018594	AGO1	95	92.044	ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.044	Vicugna_pacos
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	98.021	ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	Xenopus_tropicalis
ENSCPBG00000018594	AGO1	91	96.292	ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.292	Xiphophorus_couchianus
ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	ENSXMAG00000021899	ago1	100	96.037	Xiphophorus_maculatus