EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCPBG00000018602 (Gene tree)
Gene ID: 101947030
Gene Symbol: AGO4
Alias: EIF2C4|FLJ20033|KIAA1567|hAGO4
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Chrysemys_picta_bellii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14960 bases
Position: chr19:3764480-3779439
Accession: 18424
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPBP00000026214	PAZ	PF02170.22	9.7e-28	1	1
ENSCPBP00000026214	Piwi	PF02171.17	3.8e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPBT00000030868	AGO4-201	3542	-	ENSCPBP00000026214	869 (aa)	XP_008165342	UPI00046C234F

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	81.490	ENSCPBG00000018583	AGO3	99	81.728
ENSCPBG00000018602	AGO4	99	83.217	ENSCPBG00000018594	AGO1	99	83.217
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	78.824	ENSCPBG00000019183	AGO2	96	78.824

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSG00000134698	AGO4	99	99.532	Homo_sapiens
ENSCPBG00000018602	AGO4	94	96.274	ENSAPOG00000023867	ago4	99	96.274	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000018602	AGO4	99	99.416	ENSAMEG00000000573	AGO4	99	99.416	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000018602	AGO4	91	97.733	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.733	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000018602	AGO4	91	93.073	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.073	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.313	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.398	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000018602	AGO4	97	100.000	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.596	ENSACAG00000017275	AGO4	99	98.596	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSANAG00000031428	AGO4	99	99.415	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	ENSACLG00000005181	ago4	99	96.198	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.429	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.474	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000018602	AGO4	99	98.364	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.364	Bos_taurus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.532	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000018602	AGO4	91	99.496	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	Canis_familiaris
ENSCPBG00000018602	AGO4	99	99.299	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	99.415	Capra_hircus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	99.415	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000018602	AGO4	93	95.749	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	95.749	Cavia_aperea
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	97.541	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	97.541	Cavia_porcellus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.532	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSCATG00000043421	AGO4	100	99.483	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.180	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	99.180	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSCSAG00000001090	AGO4	99	99.532	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000018602	AGO4	79	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSCANG00000016914	AGO4	100	99.532	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.947	ENSCGRG00001002701	Ago4	99	98.947	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.946	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	98.946	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000018602	AGO4	91	91.834	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.834	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	97.666	ENSDARG00000100854	ago4	99	97.666	Danio_rerio
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.298	ENSDNOG00000015674	AGO4	99	99.298	Dasypus_novemcinctus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSDORG00000008933	Ago4	99	99.415	Dipodomys_ordii
ENSCPBG00000018602	AGO4	59	99.507	ENSETEG00000018390	AGO4	83	99.507	Echinops_telfairi
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSEASG00005012079	AGO4	99	99.532	Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSECAG00000024686	AGO4	99	99.532	Equus_caballus
ENSCPBG00000018602	AGO4	78	96.390	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	96.390	Erinaceus_europaeus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	ENSELUG00000023873	ago4	99	96.198	Esox_lucius
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSFCAG00000006218	AGO4	99	99.415	Felis_catus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	99.415	Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000018602	AGO4	96	88.756	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.756	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	97.203	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.203	Gadus_morhua
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	100.000	ENSGALG00000039713	AGO4	100	100.000	Gallus_gallus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.198	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000018602	AGO4	99	97.100	ENSGACG00000002683	ago4	100	97.100	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000018602	AGO4	91	100.000	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	100.000	Gopherus_agassizii
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.122	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	96.122	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.198	Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSHGLG00000010241	AGO4	99	99.415	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.529	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.529	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.083	ENSHCOG00000003725	ago4	99	96.083	Hippocampus_comes
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.313	ENSIPUG00000015600	ago4	99	96.313	Ictalurus_punctatus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.415	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.313	ENSKMAG00000018602	ago4	99	96.313	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	95.652	ENSLBEG00000010670	ago4	99	95.652	Labrus_bergylta
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.713	ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.713	Latimeria_chalumnae
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.416	ENSLOCG00000000584	ago4	99	96.416	Lepisosteus_oculatus
ENSCPBG00000018602	AGO4	92	98.876	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	98.876	Loxodonta_africana
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSMFAG00000035543	AGO4	99	99.532	Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.416	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	99.603	Macaca_mulatta
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	99.603	Macaca_nemestrina
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	99.532	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.221	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	ENSMZEG00005026346	ago4	99	96.198	Maylandia_zebra
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.649	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	99.649	Meleagris_gallopavo
ENSCPBG00000018602	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	98.175	Mesocricetus_auratus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.298	ENSMICG00000033507	AGO4	100	99.298	Microcebus_murinus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.064	ENSMOCG00000005772	Ago4	99	99.064	Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000018602	AGO4	91	96.725	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.725	Mola_mola
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.883	ENSMODG00000017888	AGO4	99	99.883	Monodelphis_domestica
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	95.683	ENSMALG00000011797	ago4	99	95.683	Monopterus_albus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.596	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.596	Mus_caroli
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.363	ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.363	Mus_musculus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.012	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.012	Mus_pahari
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.129	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	99	98.129	Mus_spretus
ENSCPBG00000018602	AGO4	91	99.496	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	99.496	Mustela_putorius_furo
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.246	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	98.246	Myotis_lucifugus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	99.415	Nannospalax_galili
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	ENSNBRG00000013492	ago4	99	96.198	Neolamprologus_brichardi
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.532	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	99.532	Nomascus_leucogenys
ENSCPBG00000018602	AGO4	89	99.077	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	99.077	Notamacropus_eugenii
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ENSCPBG00000018602	AGO4	92	99.373	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.373	Octodon_degus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.966	ENSONIG00000013603	ago4	99	96.198	Oreochromis_niloticus
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ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.298	ENSOCUG00000004076	AGO4	99	99.298	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.313	ENSORLG00000009865	ago4	92	96.313	Oryzias_latipes
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.313	ENSORLG00020016978	ago4	92	96.313	Oryzias_latipes_hni
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.313	ENSORLG00015008800	ago4	92	96.313	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.412	ENSOMEG00000006399	ago4	99	96.412	Oryzias_melastigma
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	91.294	ENSOGAG00000027107	-	99	91.294	Otolemur_garnettii
ENSCPBG00000018602	AGO4	92	98.123	ENSOGAG00000004233	-	100	98.123	Otolemur_garnettii
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.947	ENSOARG00000019568	AGO4	98	98.947	Ovis_aries
ENSCPBG00000018602	AGO4	99	98.953	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	99.532	Pan_paniscus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSPPRG00000006520	AGO4	99	99.415	Panthera_pardus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	99.415	Panthera_tigris_altaica
ENSCPBG00000018602	AGO4	99	98.953	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.953	Pan_troglodytes
ENSCPBG00000018602	AGO4	91	99.496	ENSPANG00000007232	AGO4	100	99.496	Papio_anubis
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.412	ENSPKIG00000022598	ago4	99	96.412	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCPBG00000018602	AGO4	99	100.000	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSCPBG00000018602	AGO4	91	97.607	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPBG00000018602	AGO4	87	100.000	ENSPEMG00000022651	-	96	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPBG00000018602	AGO4	99	99.419	ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.883	Phascolarctos_cinereus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.313	ENSPFOG00000001935	ago4	99	96.313	Poecilia_formosa
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ENSCPBG00000018602	AGO4	99	96.203	ENSPREG00000010315	ago4	99	96.313	Poecilia_reticulata
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ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	ENSPNYG00000002089	ago4	99	96.198	Pundamilia_nyererei
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	97.083	ENSPNAG00000005191	ago4	99	97.083	Pygocentrus_nattereri
ENSCPBG00000018602	AGO4	69	97.990	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	97.990	Rattus_norvegicus
ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.355	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	99.603	Rhinopithecus_bieti
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