EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCPBG00000019183 (Gene tree)
Gene ID: 101942268
Gene Symbol: AGO2
Alias: CASC7|EIF2C2|LINC00980|Q10|hAGO2
Full Name: argonaute 2%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Chrysemys_picta_bellii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 108925 bases
Position: chrKK088237.1:8672546-8781470
Accession: 3263
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPBP00000027072	PAZ	PF02170.22	1.3e-26	1	1
ENSCPBP00000027072	Piwi	PF02171.17	8.6e-115	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPBT00000031871	AGO2-201	2812	-	ENSCPBP00000027072	872 (aa)	XP_008163363	UPI00046BF3F7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	78.824	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	78.824
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	79.123	ENSCPBG00000018583	AGO3	99	81.227
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	82.730	ENSCPBG00000018594	AGO1	98	83.790

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	97.821	ENSG00000123908	AGO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.452	ENSAPOG00000017586	ago2	96	93.452	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	98.950	ENSAMEG00000005019	AGO2	99	98.950	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000019183	AGO2	80	93.813	ENSACIG00000001179	ago2	96	93.813	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.690	ENSAOCG00000015307	ago2	96	93.690	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.690	ENSAPEG00000018425	ago2	96	93.690	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	91.116	ENSATEG00000000529	ago2	96	93.690	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.415	ENSAPLG00000010465	AGO2	99	99.415	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	98.502	ENSACAG00000000167	AGO2	99	98.502	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.068	ENSANAG00000027399	AGO2	99	99.068	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000019183	AGO2	79	94.752	ENSACLG00000024684	ago2	98	94.752	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	91.200	ENSAMXG00000014587	ago2	98	93.571	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.182	ENSBTAG00000001579	AGO2	99	99.182	Bos_taurus
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	67.010	WBGene00000105	alg-1	87	67.010	Caenorhabditis_elegans
ENSCPBG00000019183	AGO2	97	66.589	WBGene00000106	alg-2	96	66.706	Caenorhabditis_elegans
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.182	ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.182	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000019183	AGO2	93	99.386	ENSCAFG00000001196	AGO2	100	99.386	Canis_familiaris
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	98.608	ENSCAFG00020014198	AGO2	100	98.608	Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.182	ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.182	Capra_hircus
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	98.837	ENSTSYG00000007281	AGO2	99	98.837	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000019183	AGO2	97	84.242	ENSCAPG00000013707	AGO2	98	84.242	Cavia_aperea
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.297	Cavia_porcellus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	ENSCCAG00000035031	AGO2	100	99.297	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	95.935	ENSCATG00000038820	AGO2	100	95.935	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.180	ENSCLAG00000001381	AGO2	99	99.180	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.181	ENSCSAG00000009574	AGO2	94	99.181	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000019183	AGO2	81	84.633	ENSCHOG00000008938	-	84	84.633	Choloepus_hoffmanni
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	71.247	ENSCING00000007310	-	98	72.268	Ciona_intestinalis
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	73.027	ENSCSAVG00000005282	-	99	78.806	Ciona_savignyi
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	95.545	ENSCANG00000030899	AGO2	99	95.545	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	97.248	ENSCGRG00001013557	Ago2	100	97.248	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	98.593	ENSCGRG00000002120	Ago2	100	98.593	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.452	ENSCSEG00000012273	ago2	96	93.452	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	92.738	ENSCVAG00000008763	ago2	100	92.308	Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	91.200	ENSDARG00000061268	ago2	96	93.349	Danio_rerio
ENSCPBG00000019183	AGO2	90	97.092	ENSDNOG00000033433	AGO2	100	97.092	Dasypus_novemcinctus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	98.712	ENSDORG00000011242	Ago2	100	98.712	Dipodomys_ordii
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	72.511	FBgn0262739	AGO1	90	74.239	Drosophila_melanogaster
ENSCPBG00000019183	AGO2	79	86.317	ENSEBUG00000008202	-	99	86.317	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000019183	AGO2	79	86.337	ENSEBUG00000006807	-	100	86.337	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000019183	AGO2	93	86.279	ENSEBUG00000011986	-	100	86.279	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000019183	AGO2	80	88.761	ENSEBUG00000014654	ago2	100	88.761	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000019183	AGO2	91	56.983	ENSEBUG00000014681	ago2	99	56.983	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000019183	AGO2	93	99.509	ENSEASG00005021922	AGO2	100	99.509	Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.416	ENSECAG00000006078	AGO2	99	99.416	Equus_caballus
ENSCPBG00000019183	AGO2	73	98.592	ENSEEUG00000008564	-	74	98.592	Erinaceus_europaeus
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	89.605	ENSELUG00000019378	ago2	96	92.866	Esox_lucius
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	98.719	ENSFCAG00000002782	AGO2	100	99.063	Felis_catus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.649	ENSFALG00000002838	AGO2	99	99.649	Ficedula_albicollis
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	ENSFDAG00000004759	AGO2	100	99.297	Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000019183	AGO2	93	93.193	ENSFHEG00000016080	ago2	96	93.193	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	92.738	ENSGMOG00000013651	ago2	98	92.527	Gadus_morhua
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	98.394	ENSGALG00000040957	AGO2	100	98.394	Gallus_gallus
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	91.180	ENSGAFG00000018026	ago2	97	93.452	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	91.851	ENSGACG00000006796	ago2	98	93.333	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	99.771	ENSGAGG00000003914	AGO2	100	100.000	Gopherus_agassizii
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	ENSGGOG00000011412	AGO2	100	99.297	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000019183	AGO2	97	93.278	ENSHBUG00000018515	ago2	98	94.752	Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	ENSHGLG00000005548	AGO2	99	99.297	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.063	ENSHGLG00100015994	-	99	99.063	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	88.435	ENSHGLG00100000694	-	98	88.612	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.690	ENSHCOG00000006200	ago2	98	93.690	Hippocampus_comes
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	90.940	ENSIPUG00000001018	ago2	98	93.112	Ictalurus_punctatus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.064	ENSSTOG00000008113	AGO2	100	99.062	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	98.946	ENSJJAG00000018712	Ago2	99	98.946	Jaculus_jaculus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	92.308	ENSKMAG00000019999	ago2	98	93.452	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.214	ENSLBEG00000005112	ago2	96	93.214	Labrus_bergylta
ENSCPBG00000019183	AGO2	97	88.208	ENSLACG00000001277	-	98	88.284	Latimeria_chalumnae
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.333	ENSLOCG00000007766	ago2	97	93.333	Lepisosteus_oculatus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	98.946	ENSLAFG00000012905	AGO2	100	98.946	Loxodonta_africana
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	ENSMFAG00000015384	AGO2	100	99.297	Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	ENSMMUG00000008045	AGO2	98	99.297	Macaca_mulatta
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	98.952	ENSMNEG00000019904	AGO2	99	99.297	Macaca_nemestrina
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	ENSMLEG00000038874	AGO2	99	99.297	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	90.785	ENSMAMG00000008662	ago2	99	91.320	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.929	ENSMZEG00005008998	ago2	98	94.752	Maylandia_zebra
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.415	ENSMGAG00000012942	AGO2	99	99.415	Meleagris_gallopavo
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	90.515	ENSMAUG00000007785	Ago2	99	90.515	Mesocricetus_auratus
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	97.821	ENSMICG00000004427	AGO2	99	99.182	Microcebus_murinus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	98.945	ENSMOCG00000000300	Ago2	100	98.945	Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	90.595	ENSMMOG00000020165	ago2	100	90.595	Mola_mola
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	97.480	ENSMODG00000000748	AGO2	100	97.480	Monodelphis_domestica
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.452	ENSMALG00000020610	ago2	98	93.452	Monopterus_albus
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	97.362	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	100	97.362	Mus_caroli
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	97.362	ENSMUSG00000036698	Ago2	100	97.362	Mus_musculus
ENSCPBG00000019183	AGO2	100	97.133	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	100	97.133	Mus_pahari
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	97.335	MGP_SPRETEiJ_G0020759	Ago2	98	100.000	Mus_spretus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.063	ENSMPUG00000001930	AGO2	100	99.063	Mustela_putorius_furo
ENSCPBG00000019183	AGO2	65	87.279	ENSMLUG00000004552	-	100	87.170	Myotis_lucifugus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	98.944	ENSNGAG00000014556	Ago2	99	98.944	Nannospalax_galili
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.929	ENSNBRG00000006100	ago2	96	93.929	Neolamprologus_brichardi
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	94.035	ENSNLEG00000001461	AGO2	97	94.035	Nomascus_leucogenys
ENSCPBG00000019183	AGO2	86	86.154	ENSMEUG00000001395	AGO2	86	98.039	Notamacropus_eugenii
ENSCPBG00000019183	AGO2	97	86.690	ENSOPRG00000008795	-	99	86.690	Ochotona_princeps
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	98.839	ENSODEG00000014145	AGO2	100	99.297	Octodon_degus
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	93.929	ENSONIG00000010747	ago2	96	93.929	Oreochromis_niloticus
ENSCPBG00000019183	AGO2	99	99.302	ENSOANG00000007125	AGO2	99	99.302	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	97.427	ENSOCUG00000006066	AGO2	100	97.427	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	92.281	ENSORLG00000004615	ago2	98	93.333	Oryzias_latipes
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	92.281	ENSORLG00020003449	ago2	98	93.333	Oryzias_latipes_hni
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	92.281	ENSORLG00015015319	ago2	98	93.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	92.398	ENSOMEG00000017751	ago2	98	93.452	Oryzias_melastigma
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.298	ENSOGAG00000007933	AGO2	100	99.298	Otolemur_garnettii
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	97.547	ENSOARG00000003763	AGO2	100	97.547	Ovis_aries
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ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	ENSPTRG00000020622	AGO2	99	99.181	Pan_troglodytes
ENSCPBG00000019183	AGO2	98	96.604	ENSPANG00000005604	AGO2	99	96.604	Papio_anubis
ENSCPBG00000019183	AGO2	96	92.738	ENSPKIG00000001824	ago2	100	93.886	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSCPBG00000019183	AGO2	98	98.830	ENSPEMG00000008137	Ago2	100	98.828	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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