EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCPBG00000020545 (Gene tree)
Gene ID: 101942297
Gene Symbol: ACO2
Alias: ACONM
Full Name: aconitase 2
Gene Type: protein_coding
Species: Chrysemys_picta_bellii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 34466 bases
Position: chrKK088194.1:552548-587013
Accession: 118
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPBP00000029134	Aconitase	PF00330.20	3.6e-148	1	1
ENSCPBP00000029134	Aconitase_C	PF00694.19	5.5e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPBT00000034302	ACO2-201	2426	-	ENSCPBP00000029134	783 (aa)	XP_005302646	UPI0003890DD4

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cpic00020	Citrate cycle (TCA cycle)	KEGG
cpic00630	Glyoxylate and dicarboxylate metabolism	KEGG
cpic01100	Metabolic pathways	KEGG
cpic01200	Carbon metabolism	KEGG
cpic01210	2-Oxocarboxylic acid metabolism	KEGG
cpic01230	Biosynthesis of amino acids	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.816	ENSG00000100412	ACO2	100	91.816	Homo_sapiens
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.794	ENSAPOG00000011484	ACO2	100	80.794	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.435	ENSAPOG00000017786	aco2	100	80.435	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	88.724	ENSAMEG00000015641	ACO2	100	88.724	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000020545	ACO2	82	81.690	ENSACIG00000021636	aco2	99	81.435	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	81.306	ENSAOCG00000019100	ACO2	100	81.306	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.435	ENSAOCG00000020887	aco2	99	81.435	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	81.562	ENSAPEG00000012427	ACO2	100	81.562	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.435	ENSAPEG00000020171	aco2	100	80.435	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	81.434	ENSATEG00000008001	ACO2	100	81.434	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	79.923	ENSATEG00000006397	aco2	99	81.123	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	79.923	ENSATEG00000007473	aco2	99	81.123	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	92.545	ENSAPLG00000005198	ACO2	99	92.545	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	92.465	ENSACAG00000004677	-	100	92.465	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.816	ENSANAG00000029281	ACO2	100	91.816	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.179	ENSACLG00000019179	aco2	100	80.179	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	81.841	ENSAMXG00000008808	aco2	100	81.841	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000020545	ACO2	86	79.947	ENSAMXG00000015485	ACO2	99	79.947	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.432	ENSBTAG00000006429	ACO2	100	91.432	Bos_taurus
ENSCPBG00000020545	ACO2	96	75.300	WBGene00000041	aco-2	99	76.065	Caenorhabditis_elegans
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	89.219	ENSCJAG00000005004	ACO2	99	93.082	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	92.082	ENSCAFG00000001075	ACO2	100	92.082	Canis_familiaris
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	92.082	ENSCAFG00020001976	ACO2	100	92.082	Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.560	ENSCHIG00000007877	ACO2	100	91.560	Capra_hircus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	92.072	ENSTSYG00000001084	ACO2	100	92.072	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.432	ENSCAPG00000017225	ACO2	100	91.432	Cavia_aperea
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	92.072	ENSCPOG00000012642	ACO2	100	92.072	Cavia_porcellus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.944	ENSCCAG00000028378	ACO2	100	91.944	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	57.673	ENSCATG00000000038	-	100	56.650	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.944	ENSCATG00000030437	ACO2	100	91.944	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000020545	ACO2	77	71.833	ENSCATG00000026864	-	100	71.833	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.944	ENSCLAG00000016998	ACO2	100	91.944	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.816	ENSCSAG00000005807	ACO2	100	91.816	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000020545	ACO2	70	90.860	ENSCHOG00000003549	ACO2	81	90.860	Choloepus_hoffmanni
ENSCPBG00000020545	ACO2	53	76.029	ENSCING00000008967	-	99	76.029	Ciona_intestinalis
ENSCPBG00000020545	ACO2	97	71.481	ENSCSAVG00000007584	-	99	79.001	Ciona_savignyi
ENSCPBG00000020545	ACO2	92	89.692	ENSCANG00000018904	ACO2	94	89.692	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.688	ENSCGRG00001023335	Aco2	100	91.688	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	72.542	ENSCGRG00001009672	-	95	72.542	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.688	ENSCGRG00000005122	Aco2	100	91.688	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	72.669	ENSCGRG00000002318	-	95	72.669	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.410	ENSCSEG00000006701	ACO2	100	80.410	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000020545	ACO2	82	76.292	ENSCSEG00000020501	aco2	99	76.292	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000020545	ACO2	98	75.391	ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.130	Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.154	ENSCVAG00000010923	ACO2	100	81.501	Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	82.353	ENSDARG00000007294	aco2	99	82.353	Danio_rerio
ENSCPBG00000020545	ACO2	98	84.436	ENSDNOG00000018156	ACO2	98	84.436	Dasypus_novemcinctus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.321	ENSDORG00000002209	Aco2	99	91.321	Dipodomys_ordii
ENSCPBG00000020545	ACO2	97	69.554	FBgn0037862	CG4706	97	69.554	Drosophila_melanogaster
ENSCPBG00000020545	ACO2	98	73.142	FBgn0010100	Acon	97	73.142	Drosophila_melanogaster
ENSCPBG00000020545	ACO2	81	90.462	ENSETEG00000010742	ACO2	81	90.462	Echinops_telfairi
ENSCPBG00000020545	ACO2	80	81.013	ENSEBUG00000009201	aco2	99	78.061	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	92.082	ENSEASG00005001546	ACO2	98	92.082	Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	91.826	ENSECAG00000023762	ACO2	98	91.826	Equus_caballus
ENSCPBG00000020545	ACO2	92	88.935	ENSEEUG00000010201	ACO2	93	88.935	Erinaceus_europaeus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	81.306	ENSELUG00000007787	ACO2	99	82.344	Esox_lucius
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	79.923	ENSELUG00000019769	aco2	100	79.923	Esox_lucius
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	88.764	ENSFCAG00000018526	ACO2	100	88.764	Felis_catus
ENSCPBG00000020545	ACO2	95	93.173	ENSFALG00000011957	ACO2	99	93.173	Ficedula_albicollis
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.816	ENSFDAG00000010448	ACO2	100	91.816	Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.435	ENSFHEG00000012709	aco2	100	80.435	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.154	ENSFHEG00000020556	ACO2	100	81.501	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	72.471	ENSGMOG00000001946	-	100	72.471	Gadus_morhua
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	78.590	ENSGMOG00000013297	aco2	100	78.590	Gadus_morhua
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	93.095	ENSGALG00000011950	ACO2	99	93.095	Gallus_gallus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	79.795	ENSGAFG00000008252	aco2	100	79.795	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.282	ENSGAFG00000010889	ACO2	100	80.282	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	78.672	ENSGACG00000004686	aco2	99	80.295	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	98.851	ENSGAGG00000017500	ACO2	100	98.851	Gopherus_agassizii
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.688	ENSGGOG00000001107	ACO2	100	91.688	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000020545	ACO2	91	71.322	ENSGGOG00000037860	-	100	69.832	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.179	ENSHBUG00000004106	aco2	100	80.179	Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.816	ENSHGLG00000015463	Aco2	100	91.816	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.304	ENSHGLG00100010294	ACO2	100	91.304	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.538	ENSHCOG00000006890	ACO2	100	80.538	Hippocampus_comes
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	79.412	ENSHCOG00000010190	aco2	100	79.412	Hippocampus_comes
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	83.099	ENSIPUG00000001101	aco2	100	83.099	Ictalurus_punctatus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.816	ENSSTOG00000016210	ACO2	100	91.816	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPBG00000020545	ACO2	92	80.658	ENSJJAG00000014029	Aco2	99	80.658	Jaculus_jaculus
ENSCPBG00000020545	ACO2	56	80.549	ENSKMAG00000021995	aco2	91	80.549	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	79.898	ENSKMAG00000014823	ACO2	100	79.898	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	78.900	ENSLBEG00000002060	aco2	99	80.031	Labrus_bergylta
ENSCPBG00000020545	ACO2	80	78.583	ENSLACG00000011854	ACO2	100	78.583	Latimeria_chalumnae
ENSCPBG00000020545	ACO2	89	72.571	ENSLOCG00000011607	aco2	98	72.571	Lepisosteus_oculatus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	90.909	ENSLAFG00000006030	ACO2	100	90.909	Loxodonta_africana
ENSCPBG00000020545	ACO2	81	71.722	ENSMFAG00000041445	-	96	71.722	Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.944	ENSMFAG00000043571	ACO2	100	91.944	Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.944	ENSMMUG00000001454	ACO2	100	91.944	Macaca_mulatta
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.816	ENSMNEG00000044522	ACO2	100	91.816	Macaca_nemestrina
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	68.240	ENSMLEG00000042289	-	100	68.240	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.944	ENSMLEG00000031603	ACO2	100	91.944	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	78.645	ENSMAMG00000003762	aco2	99	79.875	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.538	ENSMAMG00000007378	ACO2	100	82.038	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.179	ENSMZEG00005019194	aco2	100	80.179	Maylandia_zebra
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	92.545	ENSMGAG00000012110	ACO2	99	92.545	Meleagris_gallopavo
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.839	ENSMAUG00000007598	Aco2	100	91.688	Mesocricetus_auratus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	83.437	ENSMICG00000013529	ACO2	100	83.396	Microcebus_murinus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.816	ENSMOCG00000008387	Aco2	100	91.816	Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000020545	ACO2	82	78.939	ENSMMOG00000003639	aco2	99	78.939	Mola_mola
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	81.562	ENSMMOG00000002702	ACO2	100	81.562	Mola_mola
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	90.153	ENSMODG00000016560	ACO2	100	90.153	Monodelphis_domestica
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	78.846	ENSMALG00000008744	aco2	100	80.268	Monopterus_albus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.666	ENSMALG00000013359	ACO2	100	80.666	Monopterus_albus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.432	ENSMUSG00000022477	Aco2	100	91.432	Mus_musculus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.432	MGP_PahariEiJ_G0020064	Aco2	100	91.432	Mus_pahari
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.432	MGP_SPRETEiJ_G0020963	Aco2	100	91.432	Mus_spretus
ENSCPBG00000020545	ACO2	100	91.699	ENSMPUG00000016396	ACO2	100	91.699	Mustela_putorius_furo
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	90.155	ENSMLUG00000002472	ACO2	99	90.155	Myotis_lucifugus
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	67.178	ENSNGAG00000014065	-	100	67.178	Nannospalax_galili
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	89.642	ENSNGAG00000015866	-	100	89.642	Nannospalax_galili
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.307	ENSNBRG00000004766	aco2	100	80.307	Neolamprologus_brichardi
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	72.809	ENSNLEG00000036269	-	100	72.809	Nomascus_leucogenys
ENSCPBG00000020545	ACO2	99	91.944	ENSNLEG00000015482	ACO2	100	91.944	Nomascus_leucogenys
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ENSCPBG00000020545	ACO2	99	90.368	ENSOPRG00000000365	ACO2	100	90.368	Ochotona_princeps
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