EuRBPDB

Description
Ensembl ID
ENSCPBG00000025073 (Gene tree)
Gene ID
101934915
Gene Symbol
SYF2
Alias
CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name
SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type
protein_coding
Species
Chrysemys_picta_bellii
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
4991 bases
Position
chrKK082979.1:2187314-2192304
Accession
19824
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein ID
Domain
Pfam ID
E-value
Domain number
Total number
ENSCPBP00000036049SYF2PF08231.124.5e-5511
Transcripts
Transcript ID
Name
Length
RefSeq ID
Protein ID
Length
RefSeq ID
UniportKB ID
ENSCPBT00000042274SYF2-2011556-ENSCPBP00000036049248 (aa)XP_005302118UPI000388D262
Gene Model
Pathways
Pathway ID
Pathway Name
Source
cpic03040SpliceosomeKEGG
Protein-Protein Interaction (PPI)
Orthologs
Ensembl ID
Gene Symbol
Coverage
Identiy
Ortholog
Gene Symbol
Coverage
Identiy
Species
ENSCPBG00000025073SYF29487.124ENSG00000117614SYF29289.286Homo_sapiens
ENSCPBG00000025073SYF29184.889ENSAPOG00000001174syf29484.889Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000025073SYF27988.718ENSAMEG00000010134-10088.718Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000025073SYF29883.471ENSAMEG00000010115-9189.545Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000025073SYF29479.915ENSACIG00000023688syf28981.778Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000025073SYF29780.738ENSAOCG00000022046syf29585.333Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000025073SYF28781.364ENSAOCG00000010912syf26484.135Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000025073SYF29780.738ENSAPEG00000018858syf28685.333Amphiprion_percula
ENSCPBG00000025073SYF28884.793ENSATEG00000007745syf29483.556Anabas_testudineus
ENSCPBG00000025073SYF28191.500ENSAPLG00000016435SYF29991.500Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000025073SYF26779.042ENSACAG00000026777-9478.344Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000025073SYF28292.157ENSACAG00000013653-10092.157Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000025073SYF29487.124ENSANAG00000032473SYF29388.889Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000025073SYF29181.333ENSACLG00000019916syf29481.333Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000025073SYF29479.747ENSAMXG00000004051syf29382.883Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000025073SYF29784.647ENSBTAG00000001651SYF29588.444Bos_taurus
ENSCPBG00000025073SYF28452.857WBGene00019402syf-29052.607Caenorhabditis_elegans
ENSCPBG00000025073SYF29487.124ENSCJAG00000046570SYF29289.286Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000025073SYF29179.204ENSCAFG00000030331-9679.556Canis_familiaris
ENSCPBG00000025073SYF28789.352ENSCAFG00000012895-9188.444Canis_familiaris
ENSCPBG00000025073SYF28789.352ENSCAFG00020021091-9188.444Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000025073SYF27380.220ENSCAFG00020021094-8387.179Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000025073SYF29785.477ENSCHIG00000020874SYF29885.062Capra_hircus
ENSCPBG00000025073SYF29485.470ENSTSYG00000005114SYF29287.892Carlito_syrichta
ENSCPBG00000025073SYF28088.889ENSCAPG00000010006SYF210088.889Cavia_aperea
ENSCPBG00000025073SYF29287.336ENSCPOG00000005326SYF29288.393Cavia_porcellus
ENSCPBG00000025073SYF29487.554ENSCCAG00000022459SYF29389.333Cebus_capucinus
ENSCPBG00000025073SYF29387.446ENSCATG00000026917SYF29288.839Cercocebus_atys
ENSCPBG00000025073SYF29289.083ENSCLAG00000008474SYF29290.179Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000025073SYF29288.158ENSCSAG00000000948SYF29289.286Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000025073SYF27170.056ENSCHOG00000005273-9371.598Choloepus_hoffmanni
ENSCPBG00000025073SYF28554.673ENSCING00000003017-8954.206Ciona_intestinalis
ENSCPBG00000025073SYF28551.402ENSCSAVG00000006627-9851.402Ciona_savignyi
ENSCPBG00000025073SYF29377.922ENSCANG00000037322SYF29179.018Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPBG00000025073SYF210082.329ENSCGRG00001020733Syf210081.928Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000025073SYF27987.755ENSCGRG00000005095Syf29687.437Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000025073SYF28879.358ENSCSEG00000000117syf29378.378Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000025073SYF28983.258ENSCVAG00000019543syf29283.258Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000025073SYF29481.857ENSDARG00000004706syf29682.533Danio_rerio
ENSCPBG00000025073SYF29487.931ENSDNOG00000047605SYF29189.732Dasypus_novemcinctus
ENSCPBG00000025073SYF210083.468ENSDORG00000001274Syf29289.286Dipodomys_ordii
ENSCPBG00000025073SYF29257.826FBgn0033556CG123439858.407Drosophila_melanogaster
ENSCPBG00000025073SYF28873.516ENSETEG00000015729SYF29274.762Echinops_telfairi
ENSCPBG00000025073SYF27960.914ENSEBUG00000015402syf29560.914Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000025073SYF210084.400ENSEASG00005004224-10083.600Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000025073SYF29478.541ENSEASG00005004232-9380.357Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000025073SYF29885.537ENSECAG00000010440-9390.135Equus_caballus
ENSCPBG00000025073SYF29786.307ENSECAG00000012023-9190.179Equus_caballus
ENSCPBG00000025073SYF26975.723ENSEEUG00000015084SYF28977.301Erinaceus_europaeus
ENSCPBG00000025073SYF29482.203ENSELUG00000003465syf29385.973Esox_lucius
ENSCPBG00000025073SYF29487.607ENSFCAG00000043095-9189.286Felis_catus
ENSCPBG00000025073SYF210083.936ENSFCAG00000010324-7889.778Felis_catus
ENSCPBG00000025073SYF28288.235ENSFALG00000000460SYF29086.222Ficedula_albicollis
ENSCPBG00000025073SYF29287.336ENSFDAG00000008310SYF29288.393Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000025073SYF29068.750ENSFHEG00000007238syf29968.750Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000025073SYF28784.651ENSGMOG00000019138syf29684.651Gadus_morhua
ENSCPBG00000025073SYF29191.111ENSGALG00000013639SYF29486.066Gallus_gallus
ENSCPBG00000025073SYF29577.872ENSGAFG00000019435syf29480.444Gambusia_affinis
ENSCPBG00000025073SYF28783.721ENSGACG00000007305syf29083.721Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000025073SYF210098.790ENSGAGG00000010670SYF210098.790Gopherus_agassizii
ENSCPBG00000025073SYF29486.695ENSGGOG00000012796SYF29288.839Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000025073SYF29279.828ENSHBUG00000020477syf29681.333Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000025073SYF29076.786ENSHGLG00000004304-9475.000Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000025073SYF29984.211ENSHGLG00000014393SYF29289.286Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000025073SYF29984.211ENSHGLG00100014722SYF29289.286Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000025073SYF29478.481ENSHCOG00000012904syf27381.982Hippocampus_comes
ENSCPBG00000025073SYF29381.739ENSIPUG00000019859syf29283.182Ictalurus_punctatus
ENSCPBG00000025073SYF25986.301ENSSTOG00000023984SYF210086.301Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPBG00000025073SYF28088.945ENSJJAG00000013301Syf29488.945Jaculus_jaculus
ENSCPBG00000025073SYF29480.591ENSKMAG00000013856syf29682.018Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000025073SYF28884.932ENSLBEG00000014425syf29483.857Labrus_bergylta
ENSCPBG00000025073SYF28887.156ENSLACG00000012064SYF29287.156Latimeria_chalumnae
ENSCPBG00000025073SYF29581.780ENSLOCG00000002728syf28984.753Lepisosteus_oculatus
ENSCPBG00000025073SYF27463.243ENSLAFG00000030814-10063.243Loxodonta_africana
ENSCPBG00000025073SYF29387.446ENSLAFG00000023150-9189.286Loxodonta_africana
ENSCPBG00000025073SYF29387.879ENSMFAG00000041831SYF29289.286Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000025073SYF29486.695ENSMMUG00000002968SYF29288.839Macaca_mulatta
ENSCPBG00000025073SYF29387.879ENSMNEG00000030180SYF29289.286Macaca_nemestrina
ENSCPBG00000025073SYF29387.446ENSMLEG00000030248SYF29288.839Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000025073SYF28883.410ENSMAMG00000010403syf29382.222Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000025073SYF29479.747ENSMZEG00005006429syf29481.333Maylandia_zebra
ENSCPBG00000025073SYF28091.960ENSMGAG00000002019SYF210091.960Meleagris_gallopavo
ENSCPBG00000025073SYF210082.731ENSMAUG00000018974Syf29388.000Mesocricetus_auratus
ENSCPBG00000025073SYF28088.945ENSMICG00000016191SYF210088.945Microcebus_murinus
ENSCPBG00000025073SYF29287.719ENSMOCG00000022938Syf29388.444Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000025073SYF29579.237ENSMMOG00000002396syf29382.432Mola_mola
ENSCPBG00000025073SYF29086.726ENSMODG00000013951-9986.726Monodelphis_domestica
ENSCPBG00000025073SYF29480.000ENSMALG00000010706syf29383.186Monopterus_albus
ENSCPBG00000025073SYF29287.281MGP_CAROLIEiJ_G0026633Syf29388.000Mus_caroli
ENSCPBG00000025073SYF29287.281ENSMUSG00000028821Syf29388.000Mus_musculus
ENSCPBG00000025073SYF29287.281MGP_PahariEiJ_G0028966Syf29388.000Mus_pahari
ENSCPBG00000025073SYF29287.281MGP_SPRETEiJ_G0027613Syf29388.000Mus_spretus
ENSCPBG00000025073SYF210082.329ENSMPUG00000015801-8989.498Mustela_putorius_furo
ENSCPBG00000025073SYF28789.352ENSMPUG00000015802-9188.839Mustela_putorius_furo
ENSCPBG00000025073SYF29785.062ENSMLUG00000001885SYF29288.839Myotis_lucifugus
ENSCPBG00000025073SYF29586.017ENSNGAG00000007912Syf29189.686Nannospalax_galili
ENSCPBG00000025073SYF29669.874ENSNBRG00000010720syf29372.000Neolamprologus_brichardi
ENSCPBG00000025073SYF29486.695ENSNLEG00000035185SYF29288.839Nomascus_leucogenys
ENSCPBG00000025073SYF29387.446ENSOPRG00000012870SYF29388.444Ochotona_princeps
ENSCPBG00000025073SYF29286.900ENSODEG00000017664-9488.393Octodon_degus
ENSCPBG00000025073SYF29676.891ENSODEG00000014338-9380.357Octodon_degus
ENSCPBG00000025073SYF29181.333ENSONIG00000008213syf29481.333Oreochromis_niloticus
ENSCPBG00000025073SYF28191.089ENSOANG00000009552SYF210091.089Ornithorhynchus_anatinus
ENSCPBG00000025073SYF29488.841ENSOCUG00000013050SYF29290.625Oryctolagus_cuniculus
ENSCPBG00000025073SYF29479.487ENSORLG00000028820syf29582.432Oryzias_latipes
ENSCPBG00000025073SYF29877.273ENSORLG00020018333syf29482.432Oryzias_latipes_hni
ENSCPBG00000025073SYF29877.686ENSORLG00015014665syf29283.486Oryzias_latipes_hsok
ENSCPBG00000025073SYF29481.435ENSOMEG00000013911syf29383.784Oryzias_melastigma
ENSCPBG00000025073SYF29983.401ENSOGAG00000009962SYF29289.286Otolemur_garnettii
ENSCPBG00000025073SYF29983.133ENSOARG00000006348-9982.731Ovis_aries
ENSCPBG00000025073SYF27962.051ENSOARG00000006269-10062.051Ovis_aries
ENSCPBG00000025073SYF29486.695ENSPPAG00000036579SYF29288.839Pan_paniscus
ENSCPBG00000025073SYF29289.035ENSPPRG00000001638-9189.778Panthera_pardus
ENSCPBG00000025073SYF29487.607ENSPPRG00000001651-9189.286Panthera_pardus
ENSCPBG00000025073SYF29487.554ENSPTIG00000007036-9189.286Panthera_tigris_altaica
ENSCPBG00000025073SYF28790.278ENSPTIG00000005711-8189.238Panthera_tigris_altaica
ENSCPBG00000025073SYF29486.695ENSPTRG00000000352SYF29288.839Pan_troglodytes
ENSCPBG00000025073SYF29387.879ENSPANG00000008139SYF29289.286Papio_anubis
ENSCPBG00000025073SYF210078.226ENSPKIG00000008130syf29484.163Paramormyrops_kingsleyae
ENSCPBG00000025073SYF29889.883ENSPSIG00000011816SYF28896.889Pelodiscus_sinensis
ENSCPBG00000025073SYF29578.390ENSPMGG00000008755syf28781.166Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPBG00000025073SYF29287.281ENSPEMG00000008283Syf29388.000Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPBG00000025073SYF29091.518ENSPCIG00000014235SYF29091.518Phascolarctos_cinereus
ENSCPBG00000025073SYF29479.399ENSPFOG00000004116syf29281.333Poecilia_formosa
ENSCPBG00000025073SYF29479.399ENSPLAG00000006691syf29681.333Poecilia_latipinna
ENSCPBG00000025073SYF29576.170ENSPMEG00000011684syf29678.222Poecilia_mexicana
ENSCPBG00000025073SYF28782.870ENSPREG00000003009syf29480.717Poecilia_reticulata
ENSCPBG00000025073SYF29387.446ENSPPYG00000001713SYF29288.839Pongo_abelii
ENSCPBG00000025073SYF29460.086ENSPCOG00000027011SYF28960.714Propithecus_coquereli
ENSCPBG00000025073SYF29477.155ENSPVAG00000005841SYF29179.018Pteropus_vampyrus
ENSCPBG00000025073SYF29181.333ENSPNYG00000004979syf29481.333Pundamilia_nyererei
ENSCPBG00000025073SYF29481.857ENSPNAG00000015570syf29385.135Pygocentrus_nattereri
ENSCPBG00000025073SYF29287.281ENSRNOG00000060597Syf29388.000Rattus_norvegicus
ENSCPBG00000025073SYF29385.281ENSRBIG00000042970SYF29286.607Rhinopithecus_bieti
ENSCPBG00000025073SYF29387.879ENSRROG00000001347SYF29289.286Rhinopithecus_roxellana
ENSCPBG00000025073SYF29387.446ENSSBOG00000020184SYF29388.889Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCPBG00000025073SYF29091.071ENSSHAG00000015630-9091.071Sarcophilus_harrisii
ENSCPBG00000025073SYF28390.291ENSSHAG00000007152-10090.291Sarcophilus_harrisii
ENSCPBG00000025073SYF29083.482ENSSFOG00015023647syf29583.482Scleropages_formosus
ENSCPBG00000025073SYF29479.325ENSSMAG00000009867syf29381.982Scophthalmus_maximus
ENSCPBG00000025073SYF28883.945ENSSDUG00000013072syf29283.945Seriola_dumerili
ENSCPBG00000025073SYF28883.945ENSSLDG00000012677syf29283.945Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCPBG00000025073SYF29468.103ENSSARG00000012889SYF29269.778Sorex_araneus
ENSCPBG00000025073SYF29888.618ENSSPUG00000005251SYF28992.857Sphenodon_punctatus
ENSCPBG00000025073SYF29480.591ENSSPAG00000009626syf29382.883Stegastes_partitus
ENSCPBG00000025073SYF29784.232ENSSSCG00000037481SYF29288.444Sus_scrofa
ENSCPBG00000025073SYF26060.927ENSTGUG00000001126SYF28561.176Taeniopygia_guttata
ENSCPBG00000025073SYF29679.325ENSTRUG00000001499syf28981.982Takifugu_rubripes
ENSCPBG00000025073SYF29079.821ENSTNIG00000016912syf210079.821Tetraodon_nigroviridis
ENSCPBG00000025073SYF29267.249ENSTBEG00000017370SYF29067.411Tupaia_belangeri
ENSCPBG00000025073SYF28789.352ENSTTRG00000003550SYF29289.333Tursiops_truncatus
ENSCPBG00000025073SYF29485.837ENSUAMG00000002897SYF29287.611Ursus_americanus
ENSCPBG00000025073SYF28788.889ENSUMAG00000013108SYF29288.053Ursus_maritimus
ENSCPBG00000025073SYF29286.522ENSVPAG00000005705SYF29188.288Vicugna_pacos
ENSCPBG00000025073SYF28789.352ENSVVUG00000027175-9188.444Vulpes_vulpes
ENSCPBG00000025073SYF28388.293ENSVVUG00000027181-9187.111Vulpes_vulpes
ENSCPBG00000025073SYF29583.051ENSXETG00000022797syf29085.333Xenopus_tropicalis
ENSCPBG00000025073SYF28784.186ENSXMAG00000022698syf29481.778Xiphophorus_maculatus